Protein–RNA interactions for Protein: A2A3K4

PTPDC1, Protein tyrosine phosphatase domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 754 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPDC1A2A3K4 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PTPDC1A2A3K4 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PTPDC1A2A3K4 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PTPDC1A2A3K4 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PTPDC1A2A3K4 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PTPDC1A2A3K4 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PTPDC1A2A3K4 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PTPDC1A2A3K4 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PTPDC1A2A3K4 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PTPDC1A2A3K4 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PTPDC1A2A3K4 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PTPDC1A2A3K4 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
PTPDC1A2A3K4 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PTPDC1A2A3K4 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PTPDC1A2A3K4 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PTPDC1A2A3K4 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PTPDC1A2A3K4 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PTPDC1A2A3K4 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PTPDC1A2A3K4 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PTPDC1A2A3K4 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PTPDC1A2A3K4 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PTPDC1A2A3K4 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PTPDC1A2A3K4 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PTPDC1A2A3K4 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PTPDC1A2A3K4 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PTPDC1A2A3K4 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PTPDC1A2A3K4 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PTPDC1A2A3K4 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PTPDC1A2A3K4 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
PTPDC1A2A3K4 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
PTPDC1A2A3K4 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
PTPDC1A2A3K4 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
PTPDC1A2A3K4 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
PTPDC1A2A3K4 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
PTPDC1A2A3K4 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PTPDC1A2A3K4 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PTPDC1A2A3K4 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
PTPDC1A2A3K4 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
PTPDC1A2A3K4 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PTPDC1A2A3K4 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PTPDC1A2A3K4 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PTPDC1A2A3K4 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
PTPDC1A2A3K4 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PTPDC1A2A3K4 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PTPDC1A2A3K4 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
PTPDC1A2A3K4 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
PTPDC1A2A3K4 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC21.32■■□□□ 1
PTPDC1A2A3K4 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PTPDC1A2A3K4 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PTPDC1A2A3K4 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PTPDC1A2A3K4 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
PTPDC1A2A3K4 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
PTPDC1A2A3K4 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PTPDC1A2A3K4 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
PTPDC1A2A3K4 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PTPDC1A2A3K4 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PTPDC1A2A3K4 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PTPDC1A2A3K4 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PTPDC1A2A3K4 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
PTPDC1A2A3K4 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
PTPDC1A2A3K4 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PTPDC1A2A3K4 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PTPDC1A2A3K4 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
PTPDC1A2A3K4 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
PTPDC1A2A3K4 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PTPDC1A2A3K4 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC21.31■■□□□ 1
PTPDC1A2A3K4 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
PTPDC1A2A3K4 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PTPDC1A2A3K4 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
PTPDC1A2A3K4 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC21.31■■□□□ 1
PTPDC1A2A3K4 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC21.31■■□□□ 1
PTPDC1A2A3K4 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
PTPDC1A2A3K4 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PTPDC1A2A3K4 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PTPDC1A2A3K4 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PTPDC1A2A3K4 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PTPDC1A2A3K4 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PTPDC1A2A3K4 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PTPDC1A2A3K4 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PTPDC1A2A3K4 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
PTPDC1A2A3K4 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PTPDC1A2A3K4 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PTPDC1A2A3K4 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
PTPDC1A2A3K4 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
PTPDC1A2A3K4 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PTPDC1A2A3K4 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
PTPDC1A2A3K4 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PTPDC1A2A3K4 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC21.3■■□□□ 1
PTPDC1A2A3K4 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
PTPDC1A2A3K4 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
PTPDC1A2A3K4 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
PTPDC1A2A3K4 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PTPDC1A2A3K4 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PTPDC1A2A3K4 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
PTPDC1A2A3K4 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
PTPDC1A2A3K4 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC21.3■■□□□ 1
PTPDC1A2A3K4 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
PTPDC1A2A3K4 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PTPDC1A2A3K4 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
PTPDC1A2A3K4 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.7 ms