Protein–RNA interactions for Protein: A1A4Y4

IRGM, Immunity-related GTPase family M protein, humanhuman

Predictions only

Length 181 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRGMA1A4Y4 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
IRGMA1A4Y4 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
IRGMA1A4Y4 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
IRGMA1A4Y4 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
IRGMA1A4Y4 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
IRGMA1A4Y4 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
IRGMA1A4Y4 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
IRGMA1A4Y4 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
IRGMA1A4Y4 CREBBP-201ENST00000262367 10803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
IRGMA1A4Y4 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
IRGMA1A4Y4 NETO2-202ENST00000562435 7481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
IRGMA1A4Y4 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
IRGMA1A4Y4 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
IRGMA1A4Y4 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
IRGMA1A4Y4 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
IRGMA1A4Y4 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
IRGMA1A4Y4 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
IRGMA1A4Y4 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
IRGMA1A4Y4 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
IRGMA1A4Y4 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
IRGMA1A4Y4 TSC2-207ENST00000439673 5287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
IRGMA1A4Y4 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
IRGMA1A4Y4 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
IRGMA1A4Y4 DYM-201ENST00000269445 5049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
IRGMA1A4Y4 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
IRGMA1A4Y4 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
IRGMA1A4Y4 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
IRGMA1A4Y4 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
IRGMA1A4Y4 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
IRGMA1A4Y4 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC16.31■□□□□ 0.2
IRGMA1A4Y4 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
IRGMA1A4Y4 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
IRGMA1A4Y4 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
IRGMA1A4Y4 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
IRGMA1A4Y4 BCL11B-202ENST00000357195 7559 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
IRGMA1A4Y4 PAPD5-202ENST00000436909 4635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
IRGMA1A4Y4 DDHD1-202ENST00000357758 5603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
IRGMA1A4Y4 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
IRGMA1A4Y4 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
IRGMA1A4Y4 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
IRGMA1A4Y4 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
IRGMA1A4Y4 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
IRGMA1A4Y4 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
IRGMA1A4Y4 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
IRGMA1A4Y4 STC2-201ENST00000265087 5353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
IRGMA1A4Y4 IFT140-203ENST00000426508 5270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
IRGMA1A4Y4 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
IRGMA1A4Y4 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
IRGMA1A4Y4 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
IRGMA1A4Y4 AC084018.2-201ENST00000613093 2607 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
IRGMA1A4Y4 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
IRGMA1A4Y4 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
IRGMA1A4Y4 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
IRGMA1A4Y4 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
IRGMA1A4Y4 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
IRGMA1A4Y4 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
IRGMA1A4Y4 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
IRGMA1A4Y4 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
IRGMA1A4Y4 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
IRGMA1A4Y4 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
IRGMA1A4Y4 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC16.3■□□□□ 0.2
IRGMA1A4Y4 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
IRGMA1A4Y4 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
IRGMA1A4Y4 L2HGDH-202ENST00000267436 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
IRGMA1A4Y4 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
IRGMA1A4Y4 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
IRGMA1A4Y4 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
IRGMA1A4Y4 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
IRGMA1A4Y4 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
IRGMA1A4Y4 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
IRGMA1A4Y4 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
IRGMA1A4Y4 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
IRGMA1A4Y4 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
IRGMA1A4Y4 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
IRGMA1A4Y4 CNTRL-208ENST00000373865 1917 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
IRGMA1A4Y4 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
IRGMA1A4Y4 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
IRGMA1A4Y4 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
IRGMA1A4Y4 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
IRGMA1A4Y4 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
IRGMA1A4Y4 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
IRGMA1A4Y4 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
IRGMA1A4Y4 ITGA9-201ENST00000264741 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
IRGMA1A4Y4 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
IRGMA1A4Y4 PPP3CA-201ENST00000323055 4519 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
IRGMA1A4Y4 DUSP8-201ENST00000331588 4455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
IRGMA1A4Y4 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
IRGMA1A4Y4 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC16.29■□□□□ 0.2
IRGMA1A4Y4 ADARB1-202ENST00000360697 6604 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
IRGMA1A4Y4 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
IRGMA1A4Y4 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
IRGMA1A4Y4 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
IRGMA1A4Y4 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
IRGMA1A4Y4 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
IRGMA1A4Y4 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
IRGMA1A4Y4 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
IRGMA1A4Y4 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
IRGMA1A4Y4 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
IRGMA1A4Y4 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
IRGMA1A4Y4 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.1 ms