Protein–RNA interactions for Protein: R4GMW8

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BIVM-ERCC5R4GMW8 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
BIVM-ERCC5R4GMW8 CRELD1-206ENST00000452070 1778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.06■■■□□ 2.4
BIVM-ERCC5R4GMW8 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
BIVM-ERCC5R4GMW8 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
BIVM-ERCC5R4GMW8 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC30.06■■■□□ 2.4
BIVM-ERCC5R4GMW8 EEF1D-223ENST00000528610 923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
BIVM-ERCC5R4GMW8 EEF1D-238ENST00000531621 840 ntTSL 3 BASIC30.06■■■□□ 2.4
BIVM-ERCC5R4GMW8 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC30.06■■■□□ 2.4
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC106782.2-201ENST00000563252 992 ntTSL 3 BASIC30.06■■■□□ 2.4
BIVM-ERCC5R4GMW8 STX10-207ENST00000589083 1241 ntTSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
BIVM-ERCC5R4GMW8 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC30.06■■■□□ 2.4
BIVM-ERCC5R4GMW8 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
BIVM-ERCC5R4GMW8 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC30.06■■■□□ 2.4
BIVM-ERCC5R4GMW8 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
BIVM-ERCC5R4GMW8 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
BIVM-ERCC5R4GMW8 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.05■■■□□ 2.4
BIVM-ERCC5R4GMW8 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
BIVM-ERCC5R4GMW8 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
BIVM-ERCC5R4GMW8 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
BIVM-ERCC5R4GMW8 PIGU-202ENST00000374820 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
BIVM-ERCC5R4GMW8 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC30.05■■■□□ 2.4
BIVM-ERCC5R4GMW8 HDAC11-202ENST00000402259 1000 ntTSL 3 BASIC30.05■■■□□ 2.4
BIVM-ERCC5R4GMW8 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.05■■■□□ 2.4
BIVM-ERCC5R4GMW8 ZFPM1-204ENST00000563351 808 ntTSL 2 BASIC30.05■■■□□ 2.4
BIVM-ERCC5R4GMW8 MIR1199-201ENST00000621445 119 ntBASIC30.05■■■□□ 2.4
BIVM-ERCC5R4GMW8 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
BIVM-ERCC5R4GMW8 ZNF517-202ENST00000525105 1383 ntTSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
BIVM-ERCC5R4GMW8 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
BIVM-ERCC5R4GMW8 GPX3-209ENST00000614343 1478 ntTSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
BIVM-ERCC5R4GMW8 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC30.04■■■□□ 2.4
BIVM-ERCC5R4GMW8 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC30.04■■■□□ 2.4
BIVM-ERCC5R4GMW8 GSTZ1-202ENST00000349555 867 ntTSL 2 BASIC30.04■■■□□ 2.4
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC108073.2-201ENST00000464002 357 ntBASIC30.04■■■□□ 2.4
BIVM-ERCC5R4GMW8 AP000442.1-201ENST00000533552 769 ntTSL 5 BASIC30.04■■■□□ 2.4
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC008992.1-201ENST00000591132 446 ntTSL 2 BASIC30.04■■■□□ 2.4
BIVM-ERCC5R4GMW8 AL139424.1-201ENST00000607572 797 ntBASIC30.04■■■□□ 2.4
BIVM-ERCC5R4GMW8 CR381653.1-203ENST00000625153 577 ntTSL 5 BASIC30.04■■■□□ 2.4
BIVM-ERCC5R4GMW8 ATP6AP2-220ENST00000636970 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.04■■■□□ 2.4
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC30.04■■■□□ 2.4
BIVM-ERCC5R4GMW8 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC002310.6-201ENST00000624451 1377 ntBASIC30.04■■■□□ 2.4
BIVM-ERCC5R4GMW8 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.04■■■□□ 2.4
BIVM-ERCC5R4GMW8 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
BIVM-ERCC5R4GMW8 ATPIF1-201ENST00000335514 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
BIVM-ERCC5R4GMW8 C6orf48-203ENST00000375638 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.04■■■□□ 2.4
BIVM-ERCC5R4GMW8 C6orf48-207ENST00000375642 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.04■■■□□ 2.4
BIVM-ERCC5R4GMW8 GYG2P1-204ENST00000382966 639 ntTSL 3 BASIC30.04■■■□□ 2.4
BIVM-ERCC5R4GMW8 SNHG11-204ENST00000420006 720 ntTSL 3 BASIC30.04■■■□□ 2.4
BIVM-ERCC5R4GMW8 SNHG11-206ENST00000432153 1181 ntTSL 3 BASIC30.04■■■□□ 2.4
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC016999.1-201ENST00000447880 452 ntTSL 3 BASIC30.04■■■□□ 2.4
BIVM-ERCC5R4GMW8 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC126696.3-201ENST00000563993 575 ntTSL 4 BASIC30.04■■■□□ 2.4
BIVM-ERCC5R4GMW8 CROCCP3-203ENST00000589964 255 ntTSL 3 BASIC30.04■■■□□ 2.4
BIVM-ERCC5R4GMW8 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
BIVM-ERCC5R4GMW8 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
BIVM-ERCC5R4GMW8 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
BIVM-ERCC5R4GMW8 HCCS-203ENST00000380763 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
BIVM-ERCC5R4GMW8 RFX3-AS1-201ENST00000423112 552 ntTSL 3 BASIC30.03■■■□□ 2.4
BIVM-ERCC5R4GMW8 DNAJB3-202ENST00000449667 1266 ntBASIC30.03■■■□□ 2.4
BIVM-ERCC5R4GMW8 PP7080-203ENST00000510604 859 ntTSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
BIVM-ERCC5R4GMW8 GMDS-AS1-205ENST00000529893 900 ntTSL 5 BASIC30.03■■■□□ 2.4
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC092718.3-202ENST00000564536 1032 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC30.03■■■□□ 2.4
BIVM-ERCC5R4GMW8 NUTF2-206ENST00000569436 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.03■■■□□ 2.4
BIVM-ERCC5R4GMW8 LINC01842-201ENST00000588275 768 ntTSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC074135.2-201ENST00000600896 510 ntTSL 3 BASIC30.03■■■□□ 2.4
BIVM-ERCC5R4GMW8 RER1-202ENST00000378512 1404 ntTSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
BIVM-ERCC5R4GMW8 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC30.02■■■□□ 2.4
BIVM-ERCC5R4GMW8 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
BIVM-ERCC5R4GMW8 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.02■■■□□ 2.4
BIVM-ERCC5R4GMW8 EHMT1-216ENST00000493484 1182 ntTSL 3 BASIC30.02■■■□□ 2.4
BIVM-ERCC5R4GMW8 AZIN2-203ENST00000373441 1443 ntTSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
BIVM-ERCC5R4GMW8 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.02■■■□□ 2.4
BIVM-ERCC5R4GMW8 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC30.02■■■□□ 2.4
BIVM-ERCC5R4GMW8 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
BIVM-ERCC5R4GMW8 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC30.02■■■□□ 2.4
BIVM-ERCC5R4GMW8 CGREF1-201ENST00000260595 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.01■■■□□ 2.39
BIVM-ERCC5R4GMW8 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC30.01■■■□□ 2.39
BIVM-ERCC5R4GMW8 GLIPR1L1-202ENST00000378695 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
BIVM-ERCC5R4GMW8 COA5-202ENST00000409997 557 ntTSL 4 BASIC30.01■■■□□ 2.39
BIVM-ERCC5R4GMW8 CPSF1-207ENST00000531727 704 ntTSL 3 BASIC30.01■■■□□ 2.39
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.01■■■□□ 2.39
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC30.01■■■□□ 2.39
BIVM-ERCC5R4GMW8 PGM5P2-202ENST00000637225 1043 ntBASIC30.01■■■□□ 2.39
BIVM-ERCC5R4GMW8 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.01■■■□□ 2.39
BIVM-ERCC5R4GMW8 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
BIVM-ERCC5R4GMW8 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
BIVM-ERCC5R4GMW8 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
BIVM-ERCC5R4GMW8 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
BIVM-ERCC5R4GMW8 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC30■■■□□ 2.39
BIVM-ERCC5R4GMW8 NCF1C-201ENST00000438382 1427 ntBASIC30■■■□□ 2.39
BIVM-ERCC5R4GMW8 AQP12A-201ENST00000337801 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
BIVM-ERCC5R4GMW8 TRIM36-203ENST00000379618 693 ntTSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
BIVM-ERCC5R4GMW8 TMUB1-204ENST00000476627 882 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30■■■□□ 2.39
BIVM-ERCC5R4GMW8 HOXB-AS4-202ENST00000480386 566 ntTSL 4 BASIC30■■■□□ 2.39
BIVM-ERCC5R4GMW8 AL390334.1-205ENST00000555797 411 ntTSL 3 BASIC30■■■□□ 2.39
BIVM-ERCC5R4GMW8 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
BIVM-ERCC5R4GMW8 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC30■■■□□ 2.39
BIVM-ERCC5R4GMW8 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
BIVM-ERCC5R4GMW8 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30■■■□□ 2.39
BIVM-ERCC5R4GMW8 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC30■■■□□ 2.39
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