Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6R9

CCDC61, Coiled-coil domain-containing protein 61, humanhuman

Predictions only

Length 512 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC61Q9Y6R9 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CCDC61Q9Y6R9 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CCDC61Q9Y6R9 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CCDC61Q9Y6R9 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CCDC61Q9Y6R9 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CCDC61Q9Y6R9 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CCDC61Q9Y6R9 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CCDC61Q9Y6R9 MCL1-201ENST00000307940 1110 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CCDC61Q9Y6R9 DNAH14-205ENST00000366850 1103 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CCDC61Q9Y6R9 AP000355.1-201ENST00000432032 480 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CCDC61Q9Y6R9 AC105339.3-201ENST00000560043 636 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
CCDC61Q9Y6R9 NAA60-217ENST00000572942 1089 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CCDC61Q9Y6R9 ARMC7-203ENST00000581078 1002 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CCDC61Q9Y6R9 FUT6-212ENST00000592563 1095 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CCDC61Q9Y6R9 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CCDC61Q9Y6R9 CCL3-204ENST00000613922 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CCDC61Q9Y6R9 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CCDC61Q9Y6R9 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CCDC61Q9Y6R9 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CCDC61Q9Y6R9 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CCDC61Q9Y6R9 ANAPC13-206ENST00000514612 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CCDC61Q9Y6R9 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CCDC61Q9Y6R9 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CCDC61Q9Y6R9 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CCDC61Q9Y6R9 PMPCAP1-201ENST00000508114 1576 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
CCDC61Q9Y6R9 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CCDC61Q9Y6R9 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CCDC61Q9Y6R9 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CCDC61Q9Y6R9 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CCDC61Q9Y6R9 HSPB1-201ENST00000248553 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CCDC61Q9Y6R9 GUK1-202ENST00000366716 940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CCDC61Q9Y6R9 INIP-202ENST00000374236 874 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CCDC61Q9Y6R9 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CCDC61Q9Y6R9 TMEM128-202ENST00000382753 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CCDC61Q9Y6R9 CENPM-204ENST00000402420 688 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CCDC61Q9Y6R9 PRR29-203ENST00000425164 1266 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CCDC61Q9Y6R9 AL591424.1-201ENST00000442569 1213 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
CCDC61Q9Y6R9 EEF1D-238ENST00000531621 840 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CCDC61Q9Y6R9 BLOC1S6-214ENST00000567461 1052 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CCDC61Q9Y6R9 SLC25A3P1-206ENST00000569142 925 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CCDC61Q9Y6R9 AL356488.2-201ENST00000602755 427 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
CCDC61Q9Y6R9 GRTP1-205ENST00000620217 1073 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CCDC61Q9Y6R9 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CCDC61Q9Y6R9 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CCDC61Q9Y6R9 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CCDC61Q9Y6R9 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CCDC61Q9Y6R9 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CCDC61Q9Y6R9 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CCDC61Q9Y6R9 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CCDC61Q9Y6R9 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CCDC61Q9Y6R9 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CCDC61Q9Y6R9 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CCDC61Q9Y6R9 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CCDC61Q9Y6R9 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CCDC61Q9Y6R9 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CCDC61Q9Y6R9 AC079776.2-201ENST00000641154 1609 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
CCDC61Q9Y6R9 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CCDC61Q9Y6R9 ROMO1-201ENST00000336695 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CCDC61Q9Y6R9 RFXANK-202ENST00000392324 1059 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CCDC61Q9Y6R9 IMP4-203ENST00000409935 958 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CCDC61Q9Y6R9 RMDN1-202ENST00000430676 1106 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CCDC61Q9Y6R9 RNF151-202ENST00000569210 853 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CCDC61Q9Y6R9 AC008105.3-202ENST00000585471 1077 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CCDC61Q9Y6R9 SELENOM-210ENST00000611680 689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CCDC61Q9Y6R9 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CCDC61Q9Y6R9 AC073592.4-201ENST00000623827 446 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
CCDC61Q9Y6R9 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CCDC61Q9Y6R9 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CCDC61Q9Y6R9 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CCDC61Q9Y6R9 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CCDC61Q9Y6R9 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CCDC61Q9Y6R9 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CCDC61Q9Y6R9 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CCDC61Q9Y6R9 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
CCDC61Q9Y6R9 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CCDC61Q9Y6R9 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CCDC61Q9Y6R9 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CCDC61Q9Y6R9 UBE2J2-204ENST00000400929 1057 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CCDC61Q9Y6R9 RPL13P5-203ENST00000421824 845 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CCDC61Q9Y6R9 LAGE3P1-201ENST00000425356 484 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
CCDC61Q9Y6R9 GNB2-207ENST00000427895 1146 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CCDC61Q9Y6R9 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
CCDC61Q9Y6R9 BEAN1-203ENST00000561796 1078 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CCDC61Q9Y6R9 MKNK2-212ENST00000591588 631 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CCDC61Q9Y6R9 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CCDC61Q9Y6R9 AC243773.2-203ENST00000612281 640 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CCDC61Q9Y6R9 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CCDC61Q9Y6R9 HMGN3-203ENST00000620514 1010 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CCDC61Q9Y6R9 AD001527.2-201ENST00000622994 785 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
CCDC61Q9Y6R9 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CCDC61Q9Y6R9 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CCDC61Q9Y6R9 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
CCDC61Q9Y6R9 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CCDC61Q9Y6R9 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
CCDC61Q9Y6R9 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
CCDC61Q9Y6R9 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CCDC61Q9Y6R9 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CCDC61Q9Y6R9 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CCDC61Q9Y6R9 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CCDC61Q9Y6R9 GOSR2-201ENST00000225567 1245 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42 ms