Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4C0

NRXN3, Neurexin-3, humanhuman

Predictions only

Length 1,643 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NRXN3Q9Y4C0 ADORA1-209ENST00000640524 653 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
NRXN3Q9Y4C0 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
NRXN3Q9Y4C0 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
NRXN3Q9Y4C0 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
NRXN3Q9Y4C0 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
NRXN3Q9Y4C0 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
NRXN3Q9Y4C0 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
NRXN3Q9Y4C0 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
NRXN3Q9Y4C0 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
NRXN3Q9Y4C0 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
NRXN3Q9Y4C0 UPK2-201ENST00000264031 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
NRXN3Q9Y4C0 ODF3B-204ENST00000405135 917 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
NRXN3Q9Y4C0 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
NRXN3Q9Y4C0 RPL8-207ENST00000528957 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
NRXN3Q9Y4C0 MTDHP5-201ENST00000598980 586 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
NRXN3Q9Y4C0 AL157832.3-201ENST00000635764 1005 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
NRXN3Q9Y4C0 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
NRXN3Q9Y4C0 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
NRXN3Q9Y4C0 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
NRXN3Q9Y4C0 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
NRXN3Q9Y4C0 PNRC2-202ENST00000374468 814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
NRXN3Q9Y4C0 SNHG11-204ENST00000420006 720 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
NRXN3Q9Y4C0 SNHG11-206ENST00000432153 1181 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
NRXN3Q9Y4C0 USP30-AS1-201ENST00000478808 656 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
NRXN3Q9Y4C0 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
NRXN3Q9Y4C0 AC008403.2-204ENST00000600650 1006 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
NRXN3Q9Y4C0 GAK-222ENST00000618573 1248 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
NRXN3Q9Y4C0 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
NRXN3Q9Y4C0 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC25.3■■□□□ 1.64
NRXN3Q9Y4C0 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
NRXN3Q9Y4C0 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
NRXN3Q9Y4C0 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
NRXN3Q9Y4C0 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
NRXN3Q9Y4C0 PHYHD1-201ENST00000308941 1599 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
NRXN3Q9Y4C0 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
NRXN3Q9Y4C0 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
NRXN3Q9Y4C0 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
NRXN3Q9Y4C0 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
NRXN3Q9Y4C0 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
NRXN3Q9Y4C0 C19orf70-201ENST00000309324 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
NRXN3Q9Y4C0 PRORY-201ENST00000382764 878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
NRXN3Q9Y4C0 HTR5BP-201ENST00000430851 1154 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
NRXN3Q9Y4C0 AC016999.1-201ENST00000447880 452 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
NRXN3Q9Y4C0 LINC00237-202ENST00000455890 1220 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
NRXN3Q9Y4C0 CYMP-203ENST00000474680 1263 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
NRXN3Q9Y4C0 MLF1-210ENST00000484955 1247 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
NRXN3Q9Y4C0 AC018845.2-201ENST00000568326 409 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
NRXN3Q9Y4C0 AC244153.1-202ENST00000617855 482 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
NRXN3Q9Y4C0 PGM5P2-202ENST00000637225 1043 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
NRXN3Q9Y4C0 AC092865.6-201ENST00000642101 219 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
NRXN3Q9Y4C0 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
NRXN3Q9Y4C0 AL353593.2-201ENST00000602529 1483 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
NRXN3Q9Y4C0 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
NRXN3Q9Y4C0 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
NRXN3Q9Y4C0 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
NRXN3Q9Y4C0 MRPL55-208ENST00000366734 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
NRXN3Q9Y4C0 MRPL55-217ENST00000366746 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
NRXN3Q9Y4C0 ATP5G3-202ENST00000392541 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
NRXN3Q9Y4C0 AC093714.2-201ENST00000489626 763 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
NRXN3Q9Y4C0 AC106782.2-201ENST00000563252 992 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
NRXN3Q9Y4C0 FBF1-204ENST00000586631 621 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
NRXN3Q9Y4C0 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
NRXN3Q9Y4C0 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
NRXN3Q9Y4C0 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
NRXN3Q9Y4C0 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
NRXN3Q9Y4C0 LCA10-201ENST00000618311 1392 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
NRXN3Q9Y4C0 COPS8-202ENST00000392008 1654 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
NRXN3Q9Y4C0 PPIB-201ENST00000300026 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
NRXN3Q9Y4C0 RFXANK-203ENST00000407360 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
NRXN3Q9Y4C0 AL391650.1-205ENST00000433939 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
NRXN3Q9Y4C0 TMEM106C-214ENST00000550161 976 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
NRXN3Q9Y4C0 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
NRXN3Q9Y4C0 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
NRXN3Q9Y4C0 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
NRXN3Q9Y4C0 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
NRXN3Q9Y4C0 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
NRXN3Q9Y4C0 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
NRXN3Q9Y4C0 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
NRXN3Q9Y4C0 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
NRXN3Q9Y4C0 HDAC11-202ENST00000402259 1000 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
NRXN3Q9Y4C0 CCNL2-202ENST00000408918 1186 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
NRXN3Q9Y4C0 AC131097.3-202ENST00000439270 331 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
NRXN3Q9Y4C0 LINC00899-202ENST00000444890 493 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
NRXN3Q9Y4C0 MRPL20-203ENST00000482352 1049 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
NRXN3Q9Y4C0 RIN3-211ENST00000557762 517 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
NRXN3Q9Y4C0 ATP6V0C-202ENST00000564973 1081 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
NRXN3Q9Y4C0 ICAM2-205ENST00000578379 1064 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
NRXN3Q9Y4C0 ICAM2-206ENST00000578892 1056 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
NRXN3Q9Y4C0 AC010624.2-201ENST00000600998 575 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
NRXN3Q9Y4C0 CBY1-211ENST00000619293 1118 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
NRXN3Q9Y4C0 AL513190.1-201ENST00000621254 727 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
NRXN3Q9Y4C0 TRIM29-221ENST00000627238 510 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
NRXN3Q9Y4C0 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
NRXN3Q9Y4C0 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
NRXN3Q9Y4C0 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
NRXN3Q9Y4C0 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
NRXN3Q9Y4C0 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
NRXN3Q9Y4C0 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
NRXN3Q9Y4C0 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
NRXN3Q9Y4C0 AC006504.4-201ENST00000592118 1568 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.9 ms