Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y385

UBE2J1, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 J1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 318 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2J1Q9Y385 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
UBE2J1Q9Y385 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
UBE2J1Q9Y385 HIC2-201ENST00000407464 6798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
UBE2J1Q9Y385 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
UBE2J1Q9Y385 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
UBE2J1Q9Y385 ZC3H7B-201ENST00000352645 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
UBE2J1Q9Y385 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
UBE2J1Q9Y385 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
UBE2J1Q9Y385 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
UBE2J1Q9Y385 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
UBE2J1Q9Y385 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
UBE2J1Q9Y385 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
UBE2J1Q9Y385 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
UBE2J1Q9Y385 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
UBE2J1Q9Y385 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
UBE2J1Q9Y385 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
UBE2J1Q9Y385 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
UBE2J1Q9Y385 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
UBE2J1Q9Y385 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
UBE2J1Q9Y385 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
UBE2J1Q9Y385 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
UBE2J1Q9Y385 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
UBE2J1Q9Y385 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
UBE2J1Q9Y385 QRICH2-205ENST00000636395 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
UBE2J1Q9Y385 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
UBE2J1Q9Y385 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
UBE2J1Q9Y385 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
UBE2J1Q9Y385 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
UBE2J1Q9Y385 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
UBE2J1Q9Y385 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
UBE2J1Q9Y385 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
UBE2J1Q9Y385 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
UBE2J1Q9Y385 TJP2-202ENST00000377245 4611 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
UBE2J1Q9Y385 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
UBE2J1Q9Y385 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
UBE2J1Q9Y385 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
UBE2J1Q9Y385 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
UBE2J1Q9Y385 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
UBE2J1Q9Y385 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
UBE2J1Q9Y385 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
UBE2J1Q9Y385 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
UBE2J1Q9Y385 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
UBE2J1Q9Y385 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
UBE2J1Q9Y385 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
UBE2J1Q9Y385 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
UBE2J1Q9Y385 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
UBE2J1Q9Y385 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
UBE2J1Q9Y385 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
UBE2J1Q9Y385 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
UBE2J1Q9Y385 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
UBE2J1Q9Y385 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
UBE2J1Q9Y385 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
UBE2J1Q9Y385 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
UBE2J1Q9Y385 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
UBE2J1Q9Y385 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
UBE2J1Q9Y385 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
UBE2J1Q9Y385 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
UBE2J1Q9Y385 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
UBE2J1Q9Y385 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
UBE2J1Q9Y385 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
UBE2J1Q9Y385 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
UBE2J1Q9Y385 PKD1P5-201ENST00000532415 10291 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
UBE2J1Q9Y385 CACNA1G-202ENST00000354983 8138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
UBE2J1Q9Y385 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
UBE2J1Q9Y385 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
UBE2J1Q9Y385 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
UBE2J1Q9Y385 TNKS1BP1-201ENST00000358252 5795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
UBE2J1Q9Y385 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
UBE2J1Q9Y385 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
UBE2J1Q9Y385 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
UBE2J1Q9Y385 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
UBE2J1Q9Y385 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
UBE2J1Q9Y385 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
UBE2J1Q9Y385 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
UBE2J1Q9Y385 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
UBE2J1Q9Y385 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
UBE2J1Q9Y385 PKDREJ-201ENST00000253255 7693 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
UBE2J1Q9Y385 SLC12A5-201ENST00000243964 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
UBE2J1Q9Y385 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
UBE2J1Q9Y385 MYO1D-201ENST00000318217 5563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
UBE2J1Q9Y385 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
UBE2J1Q9Y385 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
UBE2J1Q9Y385 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
UBE2J1Q9Y385 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
UBE2J1Q9Y385 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
UBE2J1Q9Y385 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
UBE2J1Q9Y385 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
UBE2J1Q9Y385 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
UBE2J1Q9Y385 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
UBE2J1Q9Y385 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
UBE2J1Q9Y385 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
UBE2J1Q9Y385 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
UBE2J1Q9Y385 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
UBE2J1Q9Y385 AP3D1-202ENST00000355272 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
UBE2J1Q9Y385 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
UBE2J1Q9Y385 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
UBE2J1Q9Y385 ISLR2-203ENST00000435464 4259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
UBE2J1Q9Y385 TUBGCP6-204ENST00000439308 6078 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
UBE2J1Q9Y385 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
UBE2J1Q9Y385 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.5 ms