Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y296

TRAPPC4, Trafficking protein particle complex subunit 4, humanhuman

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC4Q9Y296 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TRAPPC4Q9Y296 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TRAPPC4Q9Y296 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TRAPPC4Q9Y296 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TRAPPC4Q9Y296 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TRAPPC4Q9Y296 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TRAPPC4Q9Y296 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TRAPPC4Q9Y296 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
TRAPPC4Q9Y296 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
TRAPPC4Q9Y296 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
TRAPPC4Q9Y296 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TRAPPC4Q9Y296 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TRAPPC4Q9Y296 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TRAPPC4Q9Y296 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TRAPPC4Q9Y296 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
TRAPPC4Q9Y296 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TRAPPC4Q9Y296 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
TRAPPC4Q9Y296 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TRAPPC4Q9Y296 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TRAPPC4Q9Y296 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TRAPPC4Q9Y296 PCDHGC5-202ENST00000610789 2763 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TRAPPC4Q9Y296 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
TRAPPC4Q9Y296 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TRAPPC4Q9Y296 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TRAPPC4Q9Y296 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TRAPPC4Q9Y296 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TRAPPC4Q9Y296 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TRAPPC4Q9Y296 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TRAPPC4Q9Y296 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TRAPPC4Q9Y296 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TRAPPC4Q9Y296 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TRAPPC4Q9Y296 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TRAPPC4Q9Y296 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
TRAPPC4Q9Y296 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TRAPPC4Q9Y296 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
TRAPPC4Q9Y296 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TRAPPC4Q9Y296 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
TRAPPC4Q9Y296 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
TRAPPC4Q9Y296 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TRAPPC4Q9Y296 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TRAPPC4Q9Y296 TCAF2-203ENST00000425618 2448 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
TRAPPC4Q9Y296 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
TRAPPC4Q9Y296 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TRAPPC4Q9Y296 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TRAPPC4Q9Y296 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
TRAPPC4Q9Y296 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TRAPPC4Q9Y296 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
TRAPPC4Q9Y296 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TRAPPC4Q9Y296 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
TRAPPC4Q9Y296 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
TRAPPC4Q9Y296 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
TRAPPC4Q9Y296 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
TRAPPC4Q9Y296 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TRAPPC4Q9Y296 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
TRAPPC4Q9Y296 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TRAPPC4Q9Y296 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
TRAPPC4Q9Y296 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
TRAPPC4Q9Y296 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TRAPPC4Q9Y296 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
TRAPPC4Q9Y296 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
TRAPPC4Q9Y296 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TRAPPC4Q9Y296 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TRAPPC4Q9Y296 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
TRAPPC4Q9Y296 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
TRAPPC4Q9Y296 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
TRAPPC4Q9Y296 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
TRAPPC4Q9Y296 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
TRAPPC4Q9Y296 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
TRAPPC4Q9Y296 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
TRAPPC4Q9Y296 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
TRAPPC4Q9Y296 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
TRAPPC4Q9Y296 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
TRAPPC4Q9Y296 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
TRAPPC4Q9Y296 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
TRAPPC4Q9Y296 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
TRAPPC4Q9Y296 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
TRAPPC4Q9Y296 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
TRAPPC4Q9Y296 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
TRAPPC4Q9Y296 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
TRAPPC4Q9Y296 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
TRAPPC4Q9Y296 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
TRAPPC4Q9Y296 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
TRAPPC4Q9Y296 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
TRAPPC4Q9Y296 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
TRAPPC4Q9Y296 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC16.65■□□□□ 0.26
TRAPPC4Q9Y296 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
TRAPPC4Q9Y296 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
TRAPPC4Q9Y296 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
TRAPPC4Q9Y296 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
TRAPPC4Q9Y296 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
TRAPPC4Q9Y296 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
TRAPPC4Q9Y296 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
TRAPPC4Q9Y296 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
TRAPPC4Q9Y296 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
TRAPPC4Q9Y296 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
TRAPPC4Q9Y296 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
TRAPPC4Q9Y296 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
TRAPPC4Q9Y296 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
TRAPPC4Q9Y296 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
TRAPPC4Q9Y296 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 80.2 ms