Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y285

FARSA, Phenylalanine--tRNA ligase alpha subunit, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 508 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FARSAQ9Y285 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
FARSAQ9Y285 CLUH-201ENST00000435359 5224 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
FARSAQ9Y285 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
FARSAQ9Y285 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
FARSAQ9Y285 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
FARSAQ9Y285 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
FARSAQ9Y285 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
FARSAQ9Y285 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
FARSAQ9Y285 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
FARSAQ9Y285 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
FARSAQ9Y285 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
FARSAQ9Y285 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
FARSAQ9Y285 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
FARSAQ9Y285 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
FARSAQ9Y285 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
FARSAQ9Y285 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
FARSAQ9Y285 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
FARSAQ9Y285 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
FARSAQ9Y285 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
FARSAQ9Y285 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
FARSAQ9Y285 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
FARSAQ9Y285 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
FARSAQ9Y285 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
FARSAQ9Y285 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
FARSAQ9Y285 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
FARSAQ9Y285 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
FARSAQ9Y285 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
FARSAQ9Y285 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
FARSAQ9Y285 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
FARSAQ9Y285 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
FARSAQ9Y285 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
FARSAQ9Y285 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
FARSAQ9Y285 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
FARSAQ9Y285 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
FARSAQ9Y285 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
FARSAQ9Y285 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
FARSAQ9Y285 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
FARSAQ9Y285 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
FARSAQ9Y285 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
FARSAQ9Y285 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
FARSAQ9Y285 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
FARSAQ9Y285 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
FARSAQ9Y285 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
FARSAQ9Y285 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
FARSAQ9Y285 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
FARSAQ9Y285 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
FARSAQ9Y285 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
FARSAQ9Y285 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
FARSAQ9Y285 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
FARSAQ9Y285 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
FARSAQ9Y285 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
FARSAQ9Y285 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
FARSAQ9Y285 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
FARSAQ9Y285 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
FARSAQ9Y285 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
FARSAQ9Y285 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
FARSAQ9Y285 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
FARSAQ9Y285 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
FARSAQ9Y285 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
FARSAQ9Y285 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
FARSAQ9Y285 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
FARSAQ9Y285 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
FARSAQ9Y285 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
FARSAQ9Y285 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
FARSAQ9Y285 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
FARSAQ9Y285 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
FARSAQ9Y285 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
FARSAQ9Y285 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
FARSAQ9Y285 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
FARSAQ9Y285 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
FARSAQ9Y285 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
FARSAQ9Y285 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
FARSAQ9Y285 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
FARSAQ9Y285 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
FARSAQ9Y285 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
FARSAQ9Y285 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
FARSAQ9Y285 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
FARSAQ9Y285 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
FARSAQ9Y285 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
FARSAQ9Y285 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
FARSAQ9Y285 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
FARSAQ9Y285 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
FARSAQ9Y285 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
FARSAQ9Y285 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
FARSAQ9Y285 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
FARSAQ9Y285 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
FARSAQ9Y285 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
FARSAQ9Y285 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
FARSAQ9Y285 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
FARSAQ9Y285 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
FARSAQ9Y285 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
FARSAQ9Y285 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
FARSAQ9Y285 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
FARSAQ9Y285 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
FARSAQ9Y285 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
FARSAQ9Y285 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
FARSAQ9Y285 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
FARSAQ9Y285 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
FARSAQ9Y285 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
FARSAQ9Y285 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.7 ms