Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y251

HPSE, Heparanase, humanhuman

Predictions only

Length 543 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HPSEQ9Y251 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
HPSEQ9Y251 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
HPSEQ9Y251 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
HPSEQ9Y251 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
HPSEQ9Y251 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
HPSEQ9Y251 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
HPSEQ9Y251 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
HPSEQ9Y251 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
HPSEQ9Y251 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
HPSEQ9Y251 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
HPSEQ9Y251 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
HPSEQ9Y251 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
HPSEQ9Y251 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.37■□□□□ 0.85
HPSEQ9Y251 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
HPSEQ9Y251 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
HPSEQ9Y251 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
HPSEQ9Y251 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
HPSEQ9Y251 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC20.37■□□□□ 0.85
HPSEQ9Y251 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
HPSEQ9Y251 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
HPSEQ9Y251 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
HPSEQ9Y251 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
HPSEQ9Y251 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
HPSEQ9Y251 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
HPSEQ9Y251 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
HPSEQ9Y251 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
HPSEQ9Y251 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
HPSEQ9Y251 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
HPSEQ9Y251 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
HPSEQ9Y251 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
HPSEQ9Y251 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
HPSEQ9Y251 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
HPSEQ9Y251 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
HPSEQ9Y251 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
HPSEQ9Y251 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
HPSEQ9Y251 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
HPSEQ9Y251 ORAI2-202ENST00000403646 2528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
HPSEQ9Y251 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
HPSEQ9Y251 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
HPSEQ9Y251 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
HPSEQ9Y251 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
HPSEQ9Y251 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
HPSEQ9Y251 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
HPSEQ9Y251 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
HPSEQ9Y251 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
HPSEQ9Y251 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
HPSEQ9Y251 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
HPSEQ9Y251 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
HPSEQ9Y251 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
HPSEQ9Y251 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
HPSEQ9Y251 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
HPSEQ9Y251 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
HPSEQ9Y251 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
HPSEQ9Y251 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
HPSEQ9Y251 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
HPSEQ9Y251 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
HPSEQ9Y251 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
HPSEQ9Y251 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
HPSEQ9Y251 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
HPSEQ9Y251 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
HPSEQ9Y251 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
HPSEQ9Y251 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
HPSEQ9Y251 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
HPSEQ9Y251 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
HPSEQ9Y251 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
HPSEQ9Y251 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
HPSEQ9Y251 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
HPSEQ9Y251 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
HPSEQ9Y251 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
HPSEQ9Y251 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
HPSEQ9Y251 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
HPSEQ9Y251 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
HPSEQ9Y251 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
HPSEQ9Y251 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
HPSEQ9Y251 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
HPSEQ9Y251 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
HPSEQ9Y251 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
HPSEQ9Y251 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
HPSEQ9Y251 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
HPSEQ9Y251 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
HPSEQ9Y251 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
HPSEQ9Y251 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
HPSEQ9Y251 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
HPSEQ9Y251 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
HPSEQ9Y251 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC20.34■□□□□ 0.85
HPSEQ9Y251 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
HPSEQ9Y251 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
HPSEQ9Y251 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
HPSEQ9Y251 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
HPSEQ9Y251 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
HPSEQ9Y251 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
HPSEQ9Y251 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
HPSEQ9Y251 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
HPSEQ9Y251 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
HPSEQ9Y251 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
HPSEQ9Y251 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
HPSEQ9Y251 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
HPSEQ9Y251 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
HPSEQ9Y251 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
HPSEQ9Y251 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.6 ms