Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y235

APOBEC2, C->U-editing enzyme APOBEC-2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBEC2Q9Y235 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
APOBEC2Q9Y235 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
APOBEC2Q9Y235 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
APOBEC2Q9Y235 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
APOBEC2Q9Y235 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
APOBEC2Q9Y235 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
APOBEC2Q9Y235 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
APOBEC2Q9Y235 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
APOBEC2Q9Y235 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
APOBEC2Q9Y235 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
APOBEC2Q9Y235 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
APOBEC2Q9Y235 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
APOBEC2Q9Y235 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
APOBEC2Q9Y235 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
APOBEC2Q9Y235 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
APOBEC2Q9Y235 TRMT112-203ENST00000535750 823 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
APOBEC2Q9Y235 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
APOBEC2Q9Y235 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
APOBEC2Q9Y235 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC18.61■□□□□ 0.57
APOBEC2Q9Y235 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
APOBEC2Q9Y235 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
APOBEC2Q9Y235 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
APOBEC2Q9Y235 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
APOBEC2Q9Y235 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
APOBEC2Q9Y235 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
APOBEC2Q9Y235 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
APOBEC2Q9Y235 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
APOBEC2Q9Y235 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
APOBEC2Q9Y235 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
APOBEC2Q9Y235 PKD1P1-201ENST00000458669 6805 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
APOBEC2Q9Y235 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
APOBEC2Q9Y235 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
APOBEC2Q9Y235 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
APOBEC2Q9Y235 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
APOBEC2Q9Y235 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
APOBEC2Q9Y235 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
APOBEC2Q9Y235 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
APOBEC2Q9Y235 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
APOBEC2Q9Y235 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
APOBEC2Q9Y235 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
APOBEC2Q9Y235 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
APOBEC2Q9Y235 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
APOBEC2Q9Y235 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
APOBEC2Q9Y235 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
APOBEC2Q9Y235 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
APOBEC2Q9Y235 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
APOBEC2Q9Y235 YBEY-201ENST00000329319 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
APOBEC2Q9Y235 YBEY-206ENST00000397701 744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
APOBEC2Q9Y235 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC18.6■□□□□ 0.57
APOBEC2Q9Y235 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
APOBEC2Q9Y235 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
APOBEC2Q9Y235 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
APOBEC2Q9Y235 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
APOBEC2Q9Y235 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
APOBEC2Q9Y235 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
APOBEC2Q9Y235 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
APOBEC2Q9Y235 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
APOBEC2Q9Y235 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
APOBEC2Q9Y235 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
APOBEC2Q9Y235 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
APOBEC2Q9Y235 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
APOBEC2Q9Y235 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC18.6■□□□□ 0.57
APOBEC2Q9Y235 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
APOBEC2Q9Y235 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
APOBEC2Q9Y235 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
APOBEC2Q9Y235 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
APOBEC2Q9Y235 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
APOBEC2Q9Y235 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
APOBEC2Q9Y235 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
APOBEC2Q9Y235 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
APOBEC2Q9Y235 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
APOBEC2Q9Y235 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
APOBEC2Q9Y235 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
APOBEC2Q9Y235 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
APOBEC2Q9Y235 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
APOBEC2Q9Y235 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
APOBEC2Q9Y235 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
APOBEC2Q9Y235 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
APOBEC2Q9Y235 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
APOBEC2Q9Y235 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
APOBEC2Q9Y235 CROCC2-201ENST00000443866 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
APOBEC2Q9Y235 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
APOBEC2Q9Y235 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
APOBEC2Q9Y235 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
APOBEC2Q9Y235 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
APOBEC2Q9Y235 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
APOBEC2Q9Y235 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
APOBEC2Q9Y235 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
APOBEC2Q9Y235 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
APOBEC2Q9Y235 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
APOBEC2Q9Y235 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
APOBEC2Q9Y235 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
APOBEC2Q9Y235 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
APOBEC2Q9Y235 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
APOBEC2Q9Y235 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
APOBEC2Q9Y235 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
APOBEC2Q9Y235 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
APOBEC2Q9Y235 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
APOBEC2Q9Y235 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
APOBEC2Q9Y235 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.9 ms