Protein–RNA interactions for Protein: Q9UQ13

SHOC2, Leucine-rich repeat protein SHOC-2, humanhuman

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Length 582 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHOC2Q9UQ13 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SHOC2Q9UQ13 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SHOC2Q9UQ13 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SHOC2Q9UQ13 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SHOC2Q9UQ13 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SHOC2Q9UQ13 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SHOC2Q9UQ13 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SHOC2Q9UQ13 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SHOC2Q9UQ13 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SHOC2Q9UQ13 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
SHOC2Q9UQ13 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
SHOC2Q9UQ13 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SHOC2Q9UQ13 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
SHOC2Q9UQ13 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SHOC2Q9UQ13 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SHOC2Q9UQ13 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SHOC2Q9UQ13 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SHOC2Q9UQ13 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SHOC2Q9UQ13 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
SHOC2Q9UQ13 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
SHOC2Q9UQ13 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SHOC2Q9UQ13 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SHOC2Q9UQ13 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SHOC2Q9UQ13 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SHOC2Q9UQ13 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
SHOC2Q9UQ13 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SHOC2Q9UQ13 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SHOC2Q9UQ13 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SHOC2Q9UQ13 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SHOC2Q9UQ13 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SHOC2Q9UQ13 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SHOC2Q9UQ13 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
SHOC2Q9UQ13 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
SHOC2Q9UQ13 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SHOC2Q9UQ13 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
SHOC2Q9UQ13 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SHOC2Q9UQ13 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SHOC2Q9UQ13 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SHOC2Q9UQ13 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
SHOC2Q9UQ13 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
SHOC2Q9UQ13 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
SHOC2Q9UQ13 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SHOC2Q9UQ13 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
SHOC2Q9UQ13 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
SHOC2Q9UQ13 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SHOC2Q9UQ13 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC18.69■□□□□ 0.58
SHOC2Q9UQ13 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
SHOC2Q9UQ13 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SHOC2Q9UQ13 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SHOC2Q9UQ13 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SHOC2Q9UQ13 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
SHOC2Q9UQ13 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SHOC2Q9UQ13 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SHOC2Q9UQ13 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SHOC2Q9UQ13 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
SHOC2Q9UQ13 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
SHOC2Q9UQ13 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SHOC2Q9UQ13 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SHOC2Q9UQ13 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
SHOC2Q9UQ13 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SHOC2Q9UQ13 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SHOC2Q9UQ13 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
SHOC2Q9UQ13 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
SHOC2Q9UQ13 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
SHOC2Q9UQ13 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC18.68■□□□□ 0.58
SHOC2Q9UQ13 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
SHOC2Q9UQ13 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
SHOC2Q9UQ13 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
SHOC2Q9UQ13 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
SHOC2Q9UQ13 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
SHOC2Q9UQ13 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
SHOC2Q9UQ13 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC18.68■□□□□ 0.58
SHOC2Q9UQ13 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
SHOC2Q9UQ13 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
SHOC2Q9UQ13 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC18.68■□□□□ 0.58
SHOC2Q9UQ13 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
SHOC2Q9UQ13 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
SHOC2Q9UQ13 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
SHOC2Q9UQ13 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.68■□□□□ 0.58
SHOC2Q9UQ13 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
SHOC2Q9UQ13 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
SHOC2Q9UQ13 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
SHOC2Q9UQ13 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
SHOC2Q9UQ13 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
SHOC2Q9UQ13 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
SHOC2Q9UQ13 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
SHOC2Q9UQ13 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
SHOC2Q9UQ13 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
SHOC2Q9UQ13 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
SHOC2Q9UQ13 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
SHOC2Q9UQ13 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
SHOC2Q9UQ13 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
SHOC2Q9UQ13 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
SHOC2Q9UQ13 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
SHOC2Q9UQ13 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
SHOC2Q9UQ13 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
SHOC2Q9UQ13 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
SHOC2Q9UQ13 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
SHOC2Q9UQ13 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
SHOC2Q9UQ13 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
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