Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPX8

SHANK2, SH3 and multiple ankyrin repeat domains protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,470 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHANK2Q9UPX8 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
SHANK2Q9UPX8 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
SHANK2Q9UPX8 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
SHANK2Q9UPX8 MOBP-208ENST00000441980 830 ntAPPRIS P4 TSL 4 BASIC26.84■■□□□ 1.89
SHANK2Q9UPX8 ETFA-208ENST00000559602 792 ntTSL 3 BASIC26.84■■□□□ 1.89
SHANK2Q9UPX8 UBE2Q2P1-205ENST00000559871 534 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
SHANK2Q9UPX8 ATP6V0C-202ENST00000564973 1081 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
SHANK2Q9UPX8 NKAPP1-205ENST00000585790 367 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
SHANK2Q9UPX8 CCL3-204ENST00000613922 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
SHANK2Q9UPX8 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
SHANK2Q9UPX8 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
SHANK2Q9UPX8 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
SHANK2Q9UPX8 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
SHANK2Q9UPX8 NOX4-207ENST00000525196 1555 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
SHANK2Q9UPX8 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
SHANK2Q9UPX8 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
SHANK2Q9UPX8 RPS2P28-201ENST00000314255 741 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
SHANK2Q9UPX8 SPDYE21P-201ENST00000413323 827 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
SHANK2Q9UPX8 RPL13P5-203ENST00000421824 845 ntTSL 3 BASIC26.83■■□□□ 1.89
SHANK2Q9UPX8 AL096828.1-201ENST00000423020 542 ntTSL 4 BASIC26.83■■□□□ 1.89
SHANK2Q9UPX8 TCTN1-208ENST00000471804 718 ntTSL 3 BASIC26.83■■□□□ 1.89
SHANK2Q9UPX8 CHMP1A-208ENST00000550102 803 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
SHANK2Q9UPX8 AL450267.1-201ENST00000557174 520 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
SHANK2Q9UPX8 ANAPC11-210ENST00000574924 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
SHANK2Q9UPX8 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
SHANK2Q9UPX8 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
SHANK2Q9UPX8 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
SHANK2Q9UPX8 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
SHANK2Q9UPX8 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
SHANK2Q9UPX8 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC26.83■■□□□ 1.89
SHANK2Q9UPX8 SEPT4-201ENST00000317256 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
SHANK2Q9UPX8 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
SHANK2Q9UPX8 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
SHANK2Q9UPX8 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
SHANK2Q9UPX8 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
SHANK2Q9UPX8 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
SHANK2Q9UPX8 TMEM219-201ENST00000279396 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
SHANK2Q9UPX8 RMDN1-202ENST00000430676 1106 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
SHANK2Q9UPX8 AL589182.1-202ENST00000548416 533 ntTSL 4 BASIC26.82■■□□□ 1.88
SHANK2Q9UPX8 BLOC1S6-214ENST00000567461 1052 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
SHANK2Q9UPX8 ACTRT2-201ENST00000378404 1421 ntAPPRIS P1 BASIC26.82■■□□□ 1.88
SHANK2Q9UPX8 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
SHANK2Q9UPX8 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
SHANK2Q9UPX8 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
SHANK2Q9UPX8 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
SHANK2Q9UPX8 BTG3-202ENST00000348354 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
SHANK2Q9UPX8 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
SHANK2Q9UPX8 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
SHANK2Q9UPX8 AC104109.2-201ENST00000602919 1418 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
SHANK2Q9UPX8 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
SHANK2Q9UPX8 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
SHANK2Q9UPX8 NECTIN1-202ENST00000340882 1059 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
SHANK2Q9UPX8 CR559946.1-201ENST00000453835 531 ntTSL 4 BASIC26.81■■□□□ 1.88
SHANK2Q9UPX8 SPCS2-207ENST00000530257 612 ntTSL 3 BASIC26.81■■□□□ 1.88
SHANK2Q9UPX8 NAA60-217ENST00000572942 1089 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
SHANK2Q9UPX8 AP001160.2-201ENST00000596071 487 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
SHANK2Q9UPX8 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
SHANK2Q9UPX8 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
SHANK2Q9UPX8 GPN3-202ENST00000537466 1491 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
SHANK2Q9UPX8 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
SHANK2Q9UPX8 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
SHANK2Q9UPX8 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
SHANK2Q9UPX8 PRRG3-205ENST00000538575 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
SHANK2Q9UPX8 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
SHANK2Q9UPX8 AC138969.1-205ENST00000381497 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
SHANK2Q9UPX8 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
SHANK2Q9UPX8 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
SHANK2Q9UPX8 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
SHANK2Q9UPX8 DNAH14-205ENST00000366850 1103 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
SHANK2Q9UPX8 GNB2-207ENST00000427895 1146 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
SHANK2Q9UPX8 AFG3L1P-210ENST00000431757 569 ntTSL 4 BASIC26.81■■□□□ 1.88
SHANK2Q9UPX8 CFL1-212ENST00000531413 636 ntTSL 3 BASIC26.81■■□□□ 1.88
SHANK2Q9UPX8 NUTM2B-AS1-211ENST00000601369 1233 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
SHANK2Q9UPX8 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
SHANK2Q9UPX8 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
SHANK2Q9UPX8 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
SHANK2Q9UPX8 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
SHANK2Q9UPX8 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
SHANK2Q9UPX8 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
SHANK2Q9UPX8 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
SHANK2Q9UPX8 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
SHANK2Q9UPX8 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
SHANK2Q9UPX8 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
SHANK2Q9UPX8 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
SHANK2Q9UPX8 ELOF1-201ENST00000252445 1019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
SHANK2Q9UPX8 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
SHANK2Q9UPX8 AGTRAP-205ENST00000400895 786 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
SHANK2Q9UPX8 MIR940-201ENST00000401276 94 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
SHANK2Q9UPX8 URGCP-206ENST00000446958 365 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
SHANK2Q9UPX8 LRRC28-210ENST00000558879 581 ntTSL 4 BASIC26.8■■□□□ 1.88
SHANK2Q9UPX8 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC26.8■■□□□ 1.88
SHANK2Q9UPX8 FAM197Y3-203ENST00000618346 717 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
SHANK2Q9UPX8 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
SHANK2Q9UPX8 ZNF259P1-201ENST00000407656 1365 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
SHANK2Q9UPX8 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
SHANK2Q9UPX8 ATG2A-203ENST00000421419 1481 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
SHANK2Q9UPX8 AP002414.3-201ENST00000589352 1468 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
SHANK2Q9UPX8 AL353593.2-201ENST00000602529 1483 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
SHANK2Q9UPX8 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
SHANK2Q9UPX8 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.2 ms