Protein–RNA interactions for Protein: Q9UN37

VPS4A, Vacuolar protein sorting-associated protein 4A, humanhuman

Predictions only

Length 437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS4AQ9UN37 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
VPS4AQ9UN37 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
VPS4AQ9UN37 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
VPS4AQ9UN37 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
VPS4AQ9UN37 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
VPS4AQ9UN37 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
VPS4AQ9UN37 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
VPS4AQ9UN37 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
VPS4AQ9UN37 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
VPS4AQ9UN37 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
VPS4AQ9UN37 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
VPS4AQ9UN37 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
VPS4AQ9UN37 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
VPS4AQ9UN37 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
VPS4AQ9UN37 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
VPS4AQ9UN37 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
VPS4AQ9UN37 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
VPS4AQ9UN37 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
VPS4AQ9UN37 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
VPS4AQ9UN37 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
VPS4AQ9UN37 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
VPS4AQ9UN37 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
VPS4AQ9UN37 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
VPS4AQ9UN37 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
VPS4AQ9UN37 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
VPS4AQ9UN37 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
VPS4AQ9UN37 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
VPS4AQ9UN37 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
VPS4AQ9UN37 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
VPS4AQ9UN37 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
VPS4AQ9UN37 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
VPS4AQ9UN37 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
VPS4AQ9UN37 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
VPS4AQ9UN37 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
VPS4AQ9UN37 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
VPS4AQ9UN37 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
VPS4AQ9UN37 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
VPS4AQ9UN37 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
VPS4AQ9UN37 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
VPS4AQ9UN37 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
VPS4AQ9UN37 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
VPS4AQ9UN37 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
VPS4AQ9UN37 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
VPS4AQ9UN37 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
VPS4AQ9UN37 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
VPS4AQ9UN37 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
VPS4AQ9UN37 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
VPS4AQ9UN37 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
VPS4AQ9UN37 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
VPS4AQ9UN37 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
VPS4AQ9UN37 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
VPS4AQ9UN37 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
VPS4AQ9UN37 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
VPS4AQ9UN37 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
VPS4AQ9UN37 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
VPS4AQ9UN37 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
VPS4AQ9UN37 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
VPS4AQ9UN37 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
VPS4AQ9UN37 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
VPS4AQ9UN37 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
VPS4AQ9UN37 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
VPS4AQ9UN37 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
VPS4AQ9UN37 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
VPS4AQ9UN37 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
VPS4AQ9UN37 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
VPS4AQ9UN37 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
VPS4AQ9UN37 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
VPS4AQ9UN37 ASXL1-202ENST00000375687 7031 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
VPS4AQ9UN37 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
VPS4AQ9UN37 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
VPS4AQ9UN37 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
VPS4AQ9UN37 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
VPS4AQ9UN37 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC17.58■□□□□ 0.41
VPS4AQ9UN37 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
VPS4AQ9UN37 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
VPS4AQ9UN37 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
VPS4AQ9UN37 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.4
VPS4AQ9UN37 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
VPS4AQ9UN37 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
VPS4AQ9UN37 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
VPS4AQ9UN37 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
VPS4AQ9UN37 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC17.58■□□□□ 0.4
VPS4AQ9UN37 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
VPS4AQ9UN37 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
VPS4AQ9UN37 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.4
VPS4AQ9UN37 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
VPS4AQ9UN37 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
VPS4AQ9UN37 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
VPS4AQ9UN37 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
VPS4AQ9UN37 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
VPS4AQ9UN37 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
VPS4AQ9UN37 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
VPS4AQ9UN37 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
VPS4AQ9UN37 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
VPS4AQ9UN37 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
VPS4AQ9UN37 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
VPS4AQ9UN37 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
VPS4AQ9UN37 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
VPS4AQ9UN37 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
VPS4AQ9UN37 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.3 ms