Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKD2

MRTO4, mRNA turnover protein 4 homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 239 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MRTO4Q9UKD2 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
MRTO4Q9UKD2 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
MRTO4Q9UKD2 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
MRTO4Q9UKD2 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
MRTO4Q9UKD2 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
MRTO4Q9UKD2 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
MRTO4Q9UKD2 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
MRTO4Q9UKD2 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
MRTO4Q9UKD2 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
MRTO4Q9UKD2 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
MRTO4Q9UKD2 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
MRTO4Q9UKD2 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
MRTO4Q9UKD2 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
MRTO4Q9UKD2 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
MRTO4Q9UKD2 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
MRTO4Q9UKD2 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
MRTO4Q9UKD2 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
MRTO4Q9UKD2 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
MRTO4Q9UKD2 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
MRTO4Q9UKD2 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC16.88■□□□□ 0.29
MRTO4Q9UKD2 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
MRTO4Q9UKD2 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
MRTO4Q9UKD2 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
MRTO4Q9UKD2 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
MRTO4Q9UKD2 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
MRTO4Q9UKD2 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
MRTO4Q9UKD2 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
MRTO4Q9UKD2 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
MRTO4Q9UKD2 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
MRTO4Q9UKD2 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
MRTO4Q9UKD2 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
MRTO4Q9UKD2 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC16.88■□□□□ 0.29
MRTO4Q9UKD2 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC16.88■□□□□ 0.29
MRTO4Q9UKD2 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
MRTO4Q9UKD2 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
MRTO4Q9UKD2 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
MRTO4Q9UKD2 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
MRTO4Q9UKD2 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
MRTO4Q9UKD2 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
MRTO4Q9UKD2 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
MRTO4Q9UKD2 GOSR1-201ENST00000225724 6039 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
MRTO4Q9UKD2 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
MRTO4Q9UKD2 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
MRTO4Q9UKD2 GPD2-201ENST00000310454 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
MRTO4Q9UKD2 TJP1-212ENST00000614355 6977 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
MRTO4Q9UKD2 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
MRTO4Q9UKD2 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
MRTO4Q9UKD2 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
MRTO4Q9UKD2 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
MRTO4Q9UKD2 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
MRTO4Q9UKD2 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
MRTO4Q9UKD2 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
MRTO4Q9UKD2 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
MRTO4Q9UKD2 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
MRTO4Q9UKD2 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
MRTO4Q9UKD2 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
MRTO4Q9UKD2 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
MRTO4Q9UKD2 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
MRTO4Q9UKD2 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
MRTO4Q9UKD2 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
MRTO4Q9UKD2 BEND4-202ENST00000504360 8692 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
MRTO4Q9UKD2 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
MRTO4Q9UKD2 GATAD2A-202ENST00000360315 5671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
MRTO4Q9UKD2 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
MRTO4Q9UKD2 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
MRTO4Q9UKD2 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
MRTO4Q9UKD2 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
MRTO4Q9UKD2 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
MRTO4Q9UKD2 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
MRTO4Q9UKD2 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
MRTO4Q9UKD2 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
MRTO4Q9UKD2 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
MRTO4Q9UKD2 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
MRTO4Q9UKD2 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
MRTO4Q9UKD2 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
MRTO4Q9UKD2 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
MRTO4Q9UKD2 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.86■□□□□ 0.29
MRTO4Q9UKD2 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
MRTO4Q9UKD2 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
MRTO4Q9UKD2 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
MRTO4Q9UKD2 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
MRTO4Q9UKD2 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
MRTO4Q9UKD2 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
MRTO4Q9UKD2 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
MRTO4Q9UKD2 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
MRTO4Q9UKD2 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
MRTO4Q9UKD2 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
MRTO4Q9UKD2 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
MRTO4Q9UKD2 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
MRTO4Q9UKD2 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
MRTO4Q9UKD2 IQSEC2-202ENST00000396435 6015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
MRTO4Q9UKD2 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
MRTO4Q9UKD2 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
MRTO4Q9UKD2 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
MRTO4Q9UKD2 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
MRTO4Q9UKD2 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
MRTO4Q9UKD2 HECTD2-204ENST00000446394 4939 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
MRTO4Q9UKD2 DHX33-201ENST00000225296 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
MRTO4Q9UKD2 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
MRTO4Q9UKD2 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.3 ms