Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJ41

RABGEF1, Rab5 GDP/GTP exchange factor, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGEF1Q9UJ41 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
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RABGEF1Q9UJ41 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
RABGEF1Q9UJ41 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
RABGEF1Q9UJ41 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
RABGEF1Q9UJ41 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
RABGEF1Q9UJ41 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
RABGEF1Q9UJ41 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
RABGEF1Q9UJ41 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
RABGEF1Q9UJ41 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC18.64■□□□□ 0.57
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RABGEF1Q9UJ41 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
RABGEF1Q9UJ41 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
RABGEF1Q9UJ41 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
RABGEF1Q9UJ41 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
RABGEF1Q9UJ41 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
RABGEF1Q9UJ41 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
RABGEF1Q9UJ41 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
RABGEF1Q9UJ41 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.63■□□□□ 0.57
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RABGEF1Q9UJ41 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
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RABGEF1Q9UJ41 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
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RABGEF1Q9UJ41 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
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RABGEF1Q9UJ41 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
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RABGEF1Q9UJ41 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
RABGEF1Q9UJ41 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
RABGEF1Q9UJ41 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
RABGEF1Q9UJ41 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
RABGEF1Q9UJ41 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
RABGEF1Q9UJ41 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
RABGEF1Q9UJ41 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
RABGEF1Q9UJ41 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
RABGEF1Q9UJ41 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
RABGEF1Q9UJ41 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
RABGEF1Q9UJ41 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
RABGEF1Q9UJ41 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
RABGEF1Q9UJ41 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
RABGEF1Q9UJ41 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
RABGEF1Q9UJ41 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
RABGEF1Q9UJ41 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
RABGEF1Q9UJ41 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
RABGEF1Q9UJ41 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
RABGEF1Q9UJ41 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
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