Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHW5

GPN3, GPN-loop GTPase 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 284 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPN3Q9UHW5 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
GPN3Q9UHW5 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC17.2■□□□□ 0.34
GPN3Q9UHW5 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
GPN3Q9UHW5 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
GPN3Q9UHW5 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
GPN3Q9UHW5 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
GPN3Q9UHW5 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
GPN3Q9UHW5 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
GPN3Q9UHW5 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
GPN3Q9UHW5 BCL11B-202ENST00000357195 7559 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
GPN3Q9UHW5 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
GPN3Q9UHW5 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
GPN3Q9UHW5 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
GPN3Q9UHW5 ZSWIM8-213ENST00000603114 5919 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
GPN3Q9UHW5 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
GPN3Q9UHW5 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GPN3Q9UHW5 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GPN3Q9UHW5 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GPN3Q9UHW5 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GPN3Q9UHW5 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GPN3Q9UHW5 FOXO3-202ENST00000406360 7341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GPN3Q9UHW5 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GPN3Q9UHW5 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
GPN3Q9UHW5 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
GPN3Q9UHW5 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GPN3Q9UHW5 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GPN3Q9UHW5 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GPN3Q9UHW5 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
GPN3Q9UHW5 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GPN3Q9UHW5 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GPN3Q9UHW5 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GPN3Q9UHW5 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GPN3Q9UHW5 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GPN3Q9UHW5 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
GPN3Q9UHW5 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
GPN3Q9UHW5 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
GPN3Q9UHW5 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
GPN3Q9UHW5 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
GPN3Q9UHW5 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
GPN3Q9UHW5 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GPN3Q9UHW5 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GPN3Q9UHW5 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GPN3Q9UHW5 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GPN3Q9UHW5 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GPN3Q9UHW5 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GPN3Q9UHW5 RNF217-211ENST00000560949 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
GPN3Q9UHW5 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GPN3Q9UHW5 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GPN3Q9UHW5 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
GPN3Q9UHW5 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GPN3Q9UHW5 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
GPN3Q9UHW5 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GPN3Q9UHW5 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
GPN3Q9UHW5 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GPN3Q9UHW5 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GPN3Q9UHW5 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GPN3Q9UHW5 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GPN3Q9UHW5 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GPN3Q9UHW5 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GPN3Q9UHW5 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GPN3Q9UHW5 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GPN3Q9UHW5 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GPN3Q9UHW5 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GPN3Q9UHW5 PCGF3-201ENST00000362003 5685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GPN3Q9UHW5 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GPN3Q9UHW5 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GPN3Q9UHW5 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GPN3Q9UHW5 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GPN3Q9UHW5 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GPN3Q9UHW5 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GPN3Q9UHW5 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GPN3Q9UHW5 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GPN3Q9UHW5 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GPN3Q9UHW5 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GPN3Q9UHW5 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GPN3Q9UHW5 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GPN3Q9UHW5 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GPN3Q9UHW5 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GPN3Q9UHW5 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
GPN3Q9UHW5 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GPN3Q9UHW5 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GPN3Q9UHW5 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GPN3Q9UHW5 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GPN3Q9UHW5 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GPN3Q9UHW5 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GPN3Q9UHW5 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GPN3Q9UHW5 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GPN3Q9UHW5 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GPN3Q9UHW5 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GPN3Q9UHW5 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GPN3Q9UHW5 TBC1D4-202ENST00000377636 6364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GPN3Q9UHW5 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GPN3Q9UHW5 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GPN3Q9UHW5 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GPN3Q9UHW5 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GPN3Q9UHW5 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GPN3Q9UHW5 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GPN3Q9UHW5 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GPN3Q9UHW5 TSC2-201ENST00000219476 6156 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GPN3Q9UHW5 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.2 ms