Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBU6

FAM8A1, Protein FAM8A1, humanhuman

Predictions only

Length 413 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM8A1Q9UBU6 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
FAM8A1Q9UBU6 KIF13B-206ENST00000524189 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
FAM8A1Q9UBU6 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
FAM8A1Q9UBU6 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
FAM8A1Q9UBU6 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
FAM8A1Q9UBU6 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
FAM8A1Q9UBU6 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
FAM8A1Q9UBU6 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
FAM8A1Q9UBU6 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
FAM8A1Q9UBU6 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
FAM8A1Q9UBU6 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
FAM8A1Q9UBU6 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
FAM8A1Q9UBU6 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
FAM8A1Q9UBU6 LINC01979-201ENST00000576738 5271 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
FAM8A1Q9UBU6 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
FAM8A1Q9UBU6 JMY-201ENST00000396137 9042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
FAM8A1Q9UBU6 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
FAM8A1Q9UBU6 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
FAM8A1Q9UBU6 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC18.07■□□□□ 0.48
FAM8A1Q9UBU6 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
FAM8A1Q9UBU6 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
FAM8A1Q9UBU6 ZDHHC8-202ENST00000334554 5046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
FAM8A1Q9UBU6 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
FAM8A1Q9UBU6 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
FAM8A1Q9UBU6 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
FAM8A1Q9UBU6 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
FAM8A1Q9UBU6 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
FAM8A1Q9UBU6 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
FAM8A1Q9UBU6 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
FAM8A1Q9UBU6 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
FAM8A1Q9UBU6 TSPAN3-201ENST00000267970 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
FAM8A1Q9UBU6 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
FAM8A1Q9UBU6 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
FAM8A1Q9UBU6 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
FAM8A1Q9UBU6 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
FAM8A1Q9UBU6 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
FAM8A1Q9UBU6 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
FAM8A1Q9UBU6 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
FAM8A1Q9UBU6 NFATC4-208ENST00000553708 5367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
FAM8A1Q9UBU6 CRAMP1-202ENST00000397412 7772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
FAM8A1Q9UBU6 WNK2-201ENST00000297954 7138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
FAM8A1Q9UBU6 ANKFY1-202ENST00000570535 6458 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
FAM8A1Q9UBU6 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
FAM8A1Q9UBU6 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
FAM8A1Q9UBU6 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
FAM8A1Q9UBU6 MAP4K4-205ENST00000350878 7640 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
FAM8A1Q9UBU6 KCMF1-201ENST00000409785 7568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
FAM8A1Q9UBU6 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
FAM8A1Q9UBU6 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
FAM8A1Q9UBU6 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
FAM8A1Q9UBU6 ZBTB7C-221ENST00000590800 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
FAM8A1Q9UBU6 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
FAM8A1Q9UBU6 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
FAM8A1Q9UBU6 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
FAM8A1Q9UBU6 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
FAM8A1Q9UBU6 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
FAM8A1Q9UBU6 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
FAM8A1Q9UBU6 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
FAM8A1Q9UBU6 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
FAM8A1Q9UBU6 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
FAM8A1Q9UBU6 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
FAM8A1Q9UBU6 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
FAM8A1Q9UBU6 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
FAM8A1Q9UBU6 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
FAM8A1Q9UBU6 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
FAM8A1Q9UBU6 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
FAM8A1Q9UBU6 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
FAM8A1Q9UBU6 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
FAM8A1Q9UBU6 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
FAM8A1Q9UBU6 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
FAM8A1Q9UBU6 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
FAM8A1Q9UBU6 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
FAM8A1Q9UBU6 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
FAM8A1Q9UBU6 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
FAM8A1Q9UBU6 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
FAM8A1Q9UBU6 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
FAM8A1Q9UBU6 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
FAM8A1Q9UBU6 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
FAM8A1Q9UBU6 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
FAM8A1Q9UBU6 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
FAM8A1Q9UBU6 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
FAM8A1Q9UBU6 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
FAM8A1Q9UBU6 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
FAM8A1Q9UBU6 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
FAM8A1Q9UBU6 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
FAM8A1Q9UBU6 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
FAM8A1Q9UBU6 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
FAM8A1Q9UBU6 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
FAM8A1Q9UBU6 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
FAM8A1Q9UBU6 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
FAM8A1Q9UBU6 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
FAM8A1Q9UBU6 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
FAM8A1Q9UBU6 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
FAM8A1Q9UBU6 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
FAM8A1Q9UBU6 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
FAM8A1Q9UBU6 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
FAM8A1Q9UBU6 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
FAM8A1Q9UBU6 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
FAM8A1Q9UBU6 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
FAM8A1Q9UBU6 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.6 ms