Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBS0

RPS6KB2, Ribosomal protein S6 kinase beta-2, humanhuman

Predictions only

Length 482 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS6KB2Q9UBS0 SENP6-205ENST00000447266 6501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
RPS6KB2Q9UBS0 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
RPS6KB2Q9UBS0 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
RPS6KB2Q9UBS0 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
RPS6KB2Q9UBS0 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
RPS6KB2Q9UBS0 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
RPS6KB2Q9UBS0 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
RPS6KB2Q9UBS0 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
RPS6KB2Q9UBS0 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC16.8■□□□□ 0.28
RPS6KB2Q9UBS0 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC16.8■□□□□ 0.28
RPS6KB2Q9UBS0 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
RPS6KB2Q9UBS0 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC16.8■□□□□ 0.28
RPS6KB2Q9UBS0 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
RPS6KB2Q9UBS0 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
RPS6KB2Q9UBS0 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
RPS6KB2Q9UBS0 PCNX3-201ENST00000355703 7105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
RPS6KB2Q9UBS0 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
RPS6KB2Q9UBS0 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
RPS6KB2Q9UBS0 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
RPS6KB2Q9UBS0 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
RPS6KB2Q9UBS0 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
RPS6KB2Q9UBS0 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
RPS6KB2Q9UBS0 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
RPS6KB2Q9UBS0 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
RPS6KB2Q9UBS0 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
RPS6KB2Q9UBS0 AC008969.1-201ENST00000550135 6438 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
RPS6KB2Q9UBS0 NRG1-202ENST00000356819 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
RPS6KB2Q9UBS0 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
RPS6KB2Q9UBS0 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
RPS6KB2Q9UBS0 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
RPS6KB2Q9UBS0 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
RPS6KB2Q9UBS0 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
RPS6KB2Q9UBS0 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
RPS6KB2Q9UBS0 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
RPS6KB2Q9UBS0 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
RPS6KB2Q9UBS0 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
RPS6KB2Q9UBS0 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
RPS6KB2Q9UBS0 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
RPS6KB2Q9UBS0 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
RPS6KB2Q9UBS0 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
RPS6KB2Q9UBS0 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
RPS6KB2Q9UBS0 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
RPS6KB2Q9UBS0 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
RPS6KB2Q9UBS0 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
RPS6KB2Q9UBS0 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
RPS6KB2Q9UBS0 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
RPS6KB2Q9UBS0 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
RPS6KB2Q9UBS0 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
RPS6KB2Q9UBS0 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
RPS6KB2Q9UBS0 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
RPS6KB2Q9UBS0 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
RPS6KB2Q9UBS0 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
RPS6KB2Q9UBS0 PDE8B-201ENST00000264917 5956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
RPS6KB2Q9UBS0 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
RPS6KB2Q9UBS0 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
RPS6KB2Q9UBS0 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
RPS6KB2Q9UBS0 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
RPS6KB2Q9UBS0 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
RPS6KB2Q9UBS0 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
RPS6KB2Q9UBS0 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
RPS6KB2Q9UBS0 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
RPS6KB2Q9UBS0 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
RPS6KB2Q9UBS0 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
RPS6KB2Q9UBS0 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
RPS6KB2Q9UBS0 KIAA2026-202ENST00000399933 6988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
RPS6KB2Q9UBS0 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
RPS6KB2Q9UBS0 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
RPS6KB2Q9UBS0 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
RPS6KB2Q9UBS0 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
RPS6KB2Q9UBS0 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
RPS6KB2Q9UBS0 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
RPS6KB2Q9UBS0 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC16.78■□□□□ 0.28
RPS6KB2Q9UBS0 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
RPS6KB2Q9UBS0 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
RPS6KB2Q9UBS0 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
RPS6KB2Q9UBS0 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
RPS6KB2Q9UBS0 PCNX2-201ENST00000258229 7518 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
RPS6KB2Q9UBS0 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
RPS6KB2Q9UBS0 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
RPS6KB2Q9UBS0 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
RPS6KB2Q9UBS0 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
RPS6KB2Q9UBS0 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
RPS6KB2Q9UBS0 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
RPS6KB2Q9UBS0 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
RPS6KB2Q9UBS0 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
RPS6KB2Q9UBS0 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
RPS6KB2Q9UBS0 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
RPS6KB2Q9UBS0 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
RPS6KB2Q9UBS0 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
RPS6KB2Q9UBS0 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
RPS6KB2Q9UBS0 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
RPS6KB2Q9UBS0 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
RPS6KB2Q9UBS0 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
RPS6KB2Q9UBS0 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
RPS6KB2Q9UBS0 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
RPS6KB2Q9UBS0 MANSC1-202ENST00000535902 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
RPS6KB2Q9UBS0 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
RPS6KB2Q9UBS0 GABBR1-205ENST00000377034 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
RPS6KB2Q9UBS0 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
RPS6KB2Q9UBS0 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.5 ms