Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBI1

COMMD3, COMM domain-containing protein 3, humanhuman

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Length 195 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COMMD3Q9UBI1 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
COMMD3Q9UBI1 MFF-202ENST00000337110 1760 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
COMMD3Q9UBI1 SFRP1-201ENST00000220772 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
COMMD3Q9UBI1 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
COMMD3Q9UBI1 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
COMMD3Q9UBI1 ADAM10-205ENST00000461408 1932 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
COMMD3Q9UBI1 PIGP-207ENST00000464265 3437 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
COMMD3Q9UBI1 LINC01215-201ENST00000607746 2592 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
COMMD3Q9UBI1 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
COMMD3Q9UBI1 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
COMMD3Q9UBI1 DYNC1I1-212ENST00000630942 2249 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
COMMD3Q9UBI1 HIP1R-201ENST00000253083 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
COMMD3Q9UBI1 RAI1-207ENST00000640861 5172 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
COMMD3Q9UBI1 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
COMMD3Q9UBI1 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
COMMD3Q9UBI1 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
COMMD3Q9UBI1 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
COMMD3Q9UBI1 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
COMMD3Q9UBI1 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
COMMD3Q9UBI1 SQLE-201ENST00000265896 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
COMMD3Q9UBI1 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
COMMD3Q9UBI1 VIPR2-201ENST00000262178 3944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
COMMD3Q9UBI1 MANSC1-202ENST00000535902 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
COMMD3Q9UBI1 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
COMMD3Q9UBI1 KL-201ENST00000380099 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
COMMD3Q9UBI1 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
COMMD3Q9UBI1 PDE8B-201ENST00000264917 5956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
COMMD3Q9UBI1 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
COMMD3Q9UBI1 TSSK2-201ENST00000399635 1816 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
COMMD3Q9UBI1 SPAG6-202ENST00000376603 2770 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
COMMD3Q9UBI1 GPC1-201ENST00000264039 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
COMMD3Q9UBI1 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
COMMD3Q9UBI1 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
COMMD3Q9UBI1 TSC22D3-203ENST00000372383 2266 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
COMMD3Q9UBI1 SEC23A-203ENST00000545328 2734 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
COMMD3Q9UBI1 IGSF8-202ENST00000368086 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
COMMD3Q9UBI1 MIB1-201ENST00000261537 9576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
COMMD3Q9UBI1 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
COMMD3Q9UBI1 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
COMMD3Q9UBI1 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
COMMD3Q9UBI1 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
COMMD3Q9UBI1 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
COMMD3Q9UBI1 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
COMMD3Q9UBI1 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
COMMD3Q9UBI1 HNRNPF-204ENST00000443950 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
COMMD3Q9UBI1 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
COMMD3Q9UBI1 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
COMMD3Q9UBI1 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
COMMD3Q9UBI1 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
COMMD3Q9UBI1 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
COMMD3Q9UBI1 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
COMMD3Q9UBI1 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
COMMD3Q9UBI1 TSC2-207ENST00000439673 5287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
COMMD3Q9UBI1 PDE1C-201ENST00000321453 2898 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
COMMD3Q9UBI1 KRT23-201ENST00000209718 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
COMMD3Q9UBI1 SURF4-208ENST00000613129 3148 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
COMMD3Q9UBI1 KDM6B-202ENST00000448097 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
COMMD3Q9UBI1 MAP4K1-201ENST00000396857 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
COMMD3Q9UBI1 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
COMMD3Q9UBI1 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
COMMD3Q9UBI1 ITPK1-210ENST00000556603 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
COMMD3Q9UBI1 CTIF-201ENST00000256413 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
COMMD3Q9UBI1 C2CD4C-201ENST00000332235 3129 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
COMMD3Q9UBI1 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
COMMD3Q9UBI1 PAPD5-202ENST00000436909 4635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
COMMD3Q9UBI1 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
COMMD3Q9UBI1 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
COMMD3Q9UBI1 MGAT2-201ENST00000305386 2687 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
COMMD3Q9UBI1 LRRN4-201ENST00000378858 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
COMMD3Q9UBI1 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
COMMD3Q9UBI1 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
COMMD3Q9UBI1 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
COMMD3Q9UBI1 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
COMMD3Q9UBI1 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
COMMD3Q9UBI1 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
COMMD3Q9UBI1 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
COMMD3Q9UBI1 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
COMMD3Q9UBI1 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
COMMD3Q9UBI1 BNC1-201ENST00000345382 4610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
COMMD3Q9UBI1 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
COMMD3Q9UBI1 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
COMMD3Q9UBI1 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
COMMD3Q9UBI1 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
COMMD3Q9UBI1 PML-215ENST00000565898 5393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
COMMD3Q9UBI1 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
COMMD3Q9UBI1 USP13-201ENST00000263966 8323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
COMMD3Q9UBI1 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
COMMD3Q9UBI1 AL512625.1-201ENST00000305709 2541 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
COMMD3Q9UBI1 LMBR1-202ENST00000359422 4727 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
COMMD3Q9UBI1 NPRL3-201ENST00000399953 2784 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
COMMD3Q9UBI1 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
COMMD3Q9UBI1 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
COMMD3Q9UBI1 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
COMMD3Q9UBI1 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
COMMD3Q9UBI1 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
COMMD3Q9UBI1 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
COMMD3Q9UBI1 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
COMMD3Q9UBI1 ZIC5-201ENST00000267294 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
COMMD3Q9UBI1 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
COMMD3Q9UBI1 TRPC4AP-202ENST00000451813 3138 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
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