Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2A4

ABI3, ABI gene family member 3, humanhuman

Predictions only

Length 366 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABI3Q9P2A4 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ABI3Q9P2A4 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
ABI3Q9P2A4 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ABI3Q9P2A4 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
ABI3Q9P2A4 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ABI3Q9P2A4 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ABI3Q9P2A4 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ABI3Q9P2A4 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ABI3Q9P2A4 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ABI3Q9P2A4 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ABI3Q9P2A4 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ABI3Q9P2A4 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ABI3Q9P2A4 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ABI3Q9P2A4 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ABI3Q9P2A4 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ABI3Q9P2A4 PLCB1-203ENST00000378641 7323 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ABI3Q9P2A4 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ABI3Q9P2A4 CBX6-202ENST00000407418 6122 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ABI3Q9P2A4 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ABI3Q9P2A4 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ABI3Q9P2A4 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ABI3Q9P2A4 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ABI3Q9P2A4 ADGRB2-212ENST00000527361 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ABI3Q9P2A4 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ABI3Q9P2A4 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ABI3Q9P2A4 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ABI3Q9P2A4 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ABI3Q9P2A4 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ABI3Q9P2A4 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ABI3Q9P2A4 CDCP1-201ENST00000296129 6006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ABI3Q9P2A4 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ABI3Q9P2A4 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ABI3Q9P2A4 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ABI3Q9P2A4 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ABI3Q9P2A4 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ABI3Q9P2A4 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
ABI3Q9P2A4 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
ABI3Q9P2A4 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
ABI3Q9P2A4 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ABI3Q9P2A4 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ABI3Q9P2A4 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ABI3Q9P2A4 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ABI3Q9P2A4 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ABI3Q9P2A4 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
ABI3Q9P2A4 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ABI3Q9P2A4 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ABI3Q9P2A4 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ABI3Q9P2A4 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
ABI3Q9P2A4 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
ABI3Q9P2A4 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ABI3Q9P2A4 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ABI3Q9P2A4 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ABI3Q9P2A4 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ABI3Q9P2A4 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ABI3Q9P2A4 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ABI3Q9P2A4 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ABI3Q9P2A4 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ABI3Q9P2A4 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ABI3Q9P2A4 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ABI3Q9P2A4 POM121C-208ENST00000615331 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ABI3Q9P2A4 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ABI3Q9P2A4 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ABI3Q9P2A4 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ABI3Q9P2A4 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ABI3Q9P2A4 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ABI3Q9P2A4 ITGA9-201ENST00000264741 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ABI3Q9P2A4 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ABI3Q9P2A4 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ABI3Q9P2A4 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ABI3Q9P2A4 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ABI3Q9P2A4 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ABI3Q9P2A4 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ABI3Q9P2A4 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ABI3Q9P2A4 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ABI3Q9P2A4 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ABI3Q9P2A4 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ABI3Q9P2A4 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ABI3Q9P2A4 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ABI3Q9P2A4 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ABI3Q9P2A4 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ABI3Q9P2A4 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
ABI3Q9P2A4 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ABI3Q9P2A4 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ABI3Q9P2A4 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ABI3Q9P2A4 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ABI3Q9P2A4 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ABI3Q9P2A4 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ABI3Q9P2A4 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ABI3Q9P2A4 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ABI3Q9P2A4 CACNA1I-201ENST00000401624 6740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ABI3Q9P2A4 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ABI3Q9P2A4 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ABI3Q9P2A4 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ABI3Q9P2A4 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ABI3Q9P2A4 SLK-202ENST00000369755 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ABI3Q9P2A4 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ABI3Q9P2A4 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ABI3Q9P2A4 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ABI3Q9P2A4 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ABI3Q9P2A4 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.1 ms