Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0L9

PKD2L1, Polycystic kidney disease 2-like 1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 805 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKD2L1Q9P0L9 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PKD2L1Q9P0L9 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PKD2L1Q9P0L9 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PKD2L1Q9P0L9 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PKD2L1Q9P0L9 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
PKD2L1Q9P0L9 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PKD2L1Q9P0L9 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PKD2L1Q9P0L9 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PKD2L1Q9P0L9 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PKD2L1Q9P0L9 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PKD2L1Q9P0L9 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PKD2L1Q9P0L9 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PKD2L1Q9P0L9 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PKD2L1Q9P0L9 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PKD2L1Q9P0L9 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PKD2L1Q9P0L9 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PKD2L1Q9P0L9 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PKD2L1Q9P0L9 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
PKD2L1Q9P0L9 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PKD2L1Q9P0L9 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
PKD2L1Q9P0L9 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PKD2L1Q9P0L9 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PKD2L1Q9P0L9 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PKD2L1Q9P0L9 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PKD2L1Q9P0L9 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PKD2L1Q9P0L9 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PKD2L1Q9P0L9 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PKD2L1Q9P0L9 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PKD2L1Q9P0L9 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PKD2L1Q9P0L9 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PKD2L1Q9P0L9 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PKD2L1Q9P0L9 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PKD2L1Q9P0L9 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PKD2L1Q9P0L9 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PKD2L1Q9P0L9 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PKD2L1Q9P0L9 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PKD2L1Q9P0L9 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PKD2L1Q9P0L9 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PKD2L1Q9P0L9 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PKD2L1Q9P0L9 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PKD2L1Q9P0L9 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PKD2L1Q9P0L9 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
PKD2L1Q9P0L9 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PKD2L1Q9P0L9 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
PKD2L1Q9P0L9 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
PKD2L1Q9P0L9 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PKD2L1Q9P0L9 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PKD2L1Q9P0L9 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PKD2L1Q9P0L9 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PKD2L1Q9P0L9 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PKD2L1Q9P0L9 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PKD2L1Q9P0L9 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PKD2L1Q9P0L9 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PKD2L1Q9P0L9 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PKD2L1Q9P0L9 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PKD2L1Q9P0L9 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PKD2L1Q9P0L9 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PKD2L1Q9P0L9 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PKD2L1Q9P0L9 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PKD2L1Q9P0L9 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PKD2L1Q9P0L9 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PKD2L1Q9P0L9 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PKD2L1Q9P0L9 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PKD2L1Q9P0L9 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PKD2L1Q9P0L9 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PKD2L1Q9P0L9 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PKD2L1Q9P0L9 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PKD2L1Q9P0L9 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PKD2L1Q9P0L9 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PKD2L1Q9P0L9 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PKD2L1Q9P0L9 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PKD2L1Q9P0L9 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PKD2L1Q9P0L9 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PKD2L1Q9P0L9 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PKD2L1Q9P0L9 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PKD2L1Q9P0L9 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
PKD2L1Q9P0L9 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PKD2L1Q9P0L9 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PKD2L1Q9P0L9 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PKD2L1Q9P0L9 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PKD2L1Q9P0L9 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PKD2L1Q9P0L9 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
PKD2L1Q9P0L9 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
PKD2L1Q9P0L9 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PKD2L1Q9P0L9 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PKD2L1Q9P0L9 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PKD2L1Q9P0L9 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PKD2L1Q9P0L9 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PKD2L1Q9P0L9 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PKD2L1Q9P0L9 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PKD2L1Q9P0L9 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PKD2L1Q9P0L9 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PKD2L1Q9P0L9 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
PKD2L1Q9P0L9 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PKD2L1Q9P0L9 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PKD2L1Q9P0L9 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PKD2L1Q9P0L9 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PKD2L1Q9P0L9 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PKD2L1Q9P0L9 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PKD2L1Q9P0L9 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.6 ms