Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZC3

GDE1, Glycerophosphodiester phosphodiesterase 1, humanhuman

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Length 331 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GDE1Q9NZC3 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
GDE1Q9NZC3 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
GDE1Q9NZC3 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
GDE1Q9NZC3 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
GDE1Q9NZC3 ISCU-205ENST00000535729 1330 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
GDE1Q9NZC3 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
GDE1Q9NZC3 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
GDE1Q9NZC3 ABCB8-211ENST00000477092 1596 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
GDE1Q9NZC3 LCE1B-201ENST00000360090 1139 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
GDE1Q9NZC3 IMP4-203ENST00000409935 958 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
GDE1Q9NZC3 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
GDE1Q9NZC3 FLJ20021-201ENST00000527564 790 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
GDE1Q9NZC3 GSTZ1-207ENST00000553586 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
GDE1Q9NZC3 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC18.57■□□□□ 0.56
GDE1Q9NZC3 BORCS8-206ENST00000585679 801 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
GDE1Q9NZC3 FBF1-204ENST00000586631 621 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
GDE1Q9NZC3 IER2-202ENST00000587885 1291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
GDE1Q9NZC3 HEXIM2-207ENST00000592695 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
GDE1Q9NZC3 SELENOM-210ENST00000611680 689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
GDE1Q9NZC3 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
GDE1Q9NZC3 TMUB2-213ENST00000589856 1505 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
GDE1Q9NZC3 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
GDE1Q9NZC3 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
GDE1Q9NZC3 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
GDE1Q9NZC3 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
GDE1Q9NZC3 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
GDE1Q9NZC3 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
GDE1Q9NZC3 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
GDE1Q9NZC3 ANAPC13-206ENST00000514612 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
GDE1Q9NZC3 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
GDE1Q9NZC3 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
GDE1Q9NZC3 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
GDE1Q9NZC3 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
GDE1Q9NZC3 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
GDE1Q9NZC3 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
GDE1Q9NZC3 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
GDE1Q9NZC3 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
GDE1Q9NZC3 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
GDE1Q9NZC3 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
GDE1Q9NZC3 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
GDE1Q9NZC3 RAMP1-201ENST00000254661 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
GDE1Q9NZC3 TM2D1-201ENST00000294613 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
GDE1Q9NZC3 VSTM1-201ENST00000338372 1023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
GDE1Q9NZC3 TM2D1-204ENST00000371180 1248 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
GDE1Q9NZC3 GNB2-207ENST00000427895 1146 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
GDE1Q9NZC3 KRT18P3-201ENST00000451602 1288 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
GDE1Q9NZC3 SMIM27-204ENST00000453396 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
GDE1Q9NZC3 FAM172A-207ENST00000509739 1031 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
GDE1Q9NZC3 SPCS2-202ENST00000526361 772 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
GDE1Q9NZC3 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
GDE1Q9NZC3 AL450267.1-201ENST00000557174 520 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
GDE1Q9NZC3 TM2D1-212ENST00000606498 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
GDE1Q9NZC3 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
GDE1Q9NZC3 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
GDE1Q9NZC3 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
GDE1Q9NZC3 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
GDE1Q9NZC3 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
GDE1Q9NZC3 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
GDE1Q9NZC3 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
GDE1Q9NZC3 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
GDE1Q9NZC3 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
GDE1Q9NZC3 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
GDE1Q9NZC3 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
GDE1Q9NZC3 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
GDE1Q9NZC3 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
GDE1Q9NZC3 TSTD1-203ENST00000368024 457 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
GDE1Q9NZC3 AP001062.3-201ENST00000422357 704 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
GDE1Q9NZC3 C21orf33-205ENST00000427803 1077 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
GDE1Q9NZC3 RMDN1-202ENST00000430676 1106 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
GDE1Q9NZC3 AFG3L1P-210ENST00000431757 569 ntTSL 4 BASIC18.55■□□□□ 0.56
GDE1Q9NZC3 CR559946.1-201ENST00000453835 531 ntTSL 4 BASIC18.55■□□□□ 0.56
GDE1Q9NZC3 NMU-202ENST00000505262 693 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
GDE1Q9NZC3 AP005233.2-201ENST00000561588 372 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
GDE1Q9NZC3 RNF151-202ENST00000569210 853 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
GDE1Q9NZC3 NAA60-217ENST00000572942 1089 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
GDE1Q9NZC3 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
GDE1Q9NZC3 GRTP1-205ENST00000620217 1073 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
GDE1Q9NZC3 HMGN3-203ENST00000620514 1010 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
GDE1Q9NZC3 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
GDE1Q9NZC3 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
GDE1Q9NZC3 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
GDE1Q9NZC3 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
GDE1Q9NZC3 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
GDE1Q9NZC3 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
GDE1Q9NZC3 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
GDE1Q9NZC3 FIP1L1-207ENST00000507922 1335 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
GDE1Q9NZC3 HSP90B1-210ENST00000614327 1338 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
GDE1Q9NZC3 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
GDE1Q9NZC3 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
GDE1Q9NZC3 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
GDE1Q9NZC3 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
GDE1Q9NZC3 AC079776.2-201ENST00000641154 1609 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
GDE1Q9NZC3 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
GDE1Q9NZC3 C22orf39-203ENST00000399568 1005 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
GDE1Q9NZC3 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
GDE1Q9NZC3 UPF3AP3-201ENST00000420996 769 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
GDE1Q9NZC3 RPL13P5-203ENST00000421824 845 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
GDE1Q9NZC3 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
GDE1Q9NZC3 AC122714.2-201ENST00000502787 707 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
GDE1Q9NZC3 AC008105.3-202ENST00000585471 1077 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
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