Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYR8

RDH8, Retinol dehydrogenase 8, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RDH8Q9NYR8 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC15.71■□□□□ 0.1
RDH8Q9NYR8 CHST10-201ENST00000264249 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
RDH8Q9NYR8 RRM2-202ENST00000360566 3673 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
RDH8Q9NYR8 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
RDH8Q9NYR8 CACNA1A-221ENST00000636012 7500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
RDH8Q9NYR8 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
RDH8Q9NYR8 OTUD7A-201ENST00000307050 10770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
RDH8Q9NYR8 FAM210B-201ENST00000371384 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
RDH8Q9NYR8 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
RDH8Q9NYR8 HNRNPF-204ENST00000443950 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
RDH8Q9NYR8 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
RDH8Q9NYR8 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
RDH8Q9NYR8 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
RDH8Q9NYR8 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
RDH8Q9NYR8 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
RDH8Q9NYR8 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
RDH8Q9NYR8 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
RDH8Q9NYR8 AHRR-201ENST00000316418 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
RDH8Q9NYR8 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
RDH8Q9NYR8 GBA2-202ENST00000378094 3757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
RDH8Q9NYR8 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
RDH8Q9NYR8 NAA50-201ENST00000240922 6135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
RDH8Q9NYR8 RAI1-207ENST00000640861 5172 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
RDH8Q9NYR8 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
RDH8Q9NYR8 TMEM229B-201ENST00000357461 4068 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
RDH8Q9NYR8 INPP5J-213ENST00000620191 2306 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
RDH8Q9NYR8 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
RDH8Q9NYR8 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
RDH8Q9NYR8 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
RDH8Q9NYR8 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
RDH8Q9NYR8 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
RDH8Q9NYR8 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
RDH8Q9NYR8 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
RDH8Q9NYR8 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
RDH8Q9NYR8 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
RDH8Q9NYR8 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
RDH8Q9NYR8 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
RDH8Q9NYR8 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
RDH8Q9NYR8 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
RDH8Q9NYR8 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
RDH8Q9NYR8 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
RDH8Q9NYR8 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
RDH8Q9NYR8 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
RDH8Q9NYR8 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
RDH8Q9NYR8 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
RDH8Q9NYR8 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
RDH8Q9NYR8 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
RDH8Q9NYR8 JMJD1C-202ENST00000399262 8666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
RDH8Q9NYR8 TJP2-202ENST00000377245 4611 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
RDH8Q9NYR8 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
RDH8Q9NYR8 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
RDH8Q9NYR8 OR4D1-202ENST00000641449 4925 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
RDH8Q9NYR8 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
RDH8Q9NYR8 PHACTR3-204ENST00000371015 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
RDH8Q9NYR8 COL18A1-203ENST00000359759 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
RDH8Q9NYR8 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
RDH8Q9NYR8 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
RDH8Q9NYR8 TSKU-205ENST00000612930 2666 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.7■□□□□ 0.1
RDH8Q9NYR8 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
RDH8Q9NYR8 C5orf24-202ENST00000394976 5065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
RDH8Q9NYR8 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
RDH8Q9NYR8 P2RX5-TAX1BP3-201ENST00000550383 5905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
RDH8Q9NYR8 PML-215ENST00000565898 5393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
RDH8Q9NYR8 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
RDH8Q9NYR8 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
RDH8Q9NYR8 GALNT10-203ENST00000425427 4344 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
RDH8Q9NYR8 CLN5-208ENST00000636183 6664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
RDH8Q9NYR8 RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 4931 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
RDH8Q9NYR8 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
RDH8Q9NYR8 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
RDH8Q9NYR8 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
RDH8Q9NYR8 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
RDH8Q9NYR8 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
RDH8Q9NYR8 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
RDH8Q9NYR8 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
RDH8Q9NYR8 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
RDH8Q9NYR8 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC15.69■□□□□ 0.1
RDH8Q9NYR8 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
RDH8Q9NYR8 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
RDH8Q9NYR8 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
RDH8Q9NYR8 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
RDH8Q9NYR8 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
RDH8Q9NYR8 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
RDH8Q9NYR8 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
RDH8Q9NYR8 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
RDH8Q9NYR8 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
RDH8Q9NYR8 MON2-213ENST00000552738 5543 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
RDH8Q9NYR8 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
RDH8Q9NYR8 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
RDH8Q9NYR8 BMI1-201ENST00000376663 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
RDH8Q9NYR8 HNRNPA3-201ENST00000392524 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
RDH8Q9NYR8 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
RDH8Q9NYR8 RTL6-201ENST00000341255 5495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
RDH8Q9NYR8 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
RDH8Q9NYR8 AQP1-204ENST00000441328 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
RDH8Q9NYR8 PITPNC1-203ENST00000580974 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
RDH8Q9NYR8 PCDH8P1-201ENST00000428983 2773 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
RDH8Q9NYR8 BICD2-201ENST00000356884 6427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
RDH8Q9NYR8 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
RDH8Q9NYR8 PGBD5-201ENST00000391860 10961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
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