Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSQ0

RRP7BP, Putative ribosomal RNA-processing protein 7 homolog B, humanhuman

Predictions only

Length 103 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RRP7BPQ9NSQ0 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
RRP7BPQ9NSQ0 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
RRP7BPQ9NSQ0 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
RRP7BPQ9NSQ0 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
RRP7BPQ9NSQ0 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
RRP7BPQ9NSQ0 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
RRP7BPQ9NSQ0 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
RRP7BPQ9NSQ0 OTOS-202ENST00000391989 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.08■■□□□ 1.93
RRP7BPQ9NSQ0 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC27.08■■□□□ 1.93
RRP7BPQ9NSQ0 AC139887.2-202ENST00000507446 534 ntTSL 4 BASIC27.08■■□□□ 1.93
RRP7BPQ9NSQ0 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
RRP7BPQ9NSQ0 BABAM1-206ENST00000595632 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
RRP7BPQ9NSQ0 AC243547.2-201ENST00000616257 234 ntTSL 3 BASIC27.08■■□□□ 1.93
RRP7BPQ9NSQ0 HOXA11-AS1_5.1-201ENST00000620211 203 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
RRP7BPQ9NSQ0 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
RRP7BPQ9NSQ0 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC27.08■■□□□ 1.92
RRP7BPQ9NSQ0 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.92
RRP7BPQ9NSQ0 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.92
RRP7BPQ9NSQ0 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
RRP7BPQ9NSQ0 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
RRP7BPQ9NSQ0 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
RRP7BPQ9NSQ0 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
RRP7BPQ9NSQ0 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
RRP7BPQ9NSQ0 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
RRP7BPQ9NSQ0 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
RRP7BPQ9NSQ0 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
RRP7BPQ9NSQ0 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
RRP7BPQ9NSQ0 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
RRP7BPQ9NSQ0 C12orf76-202ENST00000546627 461 ntTSL 4 BASIC27.07■■□□□ 1.92
RRP7BPQ9NSQ0 PAM16-208ENST00000573553 722 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
RRP7BPQ9NSQ0 AC005632.4-201ENST00000613759 431 ntTSL 3 BASIC27.07■■□□□ 1.92
RRP7BPQ9NSQ0 TSPY4-205ENST00000640033 663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
RRP7BPQ9NSQ0 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC27.07■■□□□ 1.92
RRP7BPQ9NSQ0 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
RRP7BPQ9NSQ0 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
RRP7BPQ9NSQ0 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
RRP7BPQ9NSQ0 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
RRP7BPQ9NSQ0 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
RRP7BPQ9NSQ0 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
RRP7BPQ9NSQ0 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
RRP7BPQ9NSQ0 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
RRP7BPQ9NSQ0 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
RRP7BPQ9NSQ0 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
RRP7BPQ9NSQ0 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
RRP7BPQ9NSQ0 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
RRP7BPQ9NSQ0 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
RRP7BPQ9NSQ0 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
RRP7BPQ9NSQ0 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
RRP7BPQ9NSQ0 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
RRP7BPQ9NSQ0 PTH2-201ENST00000270631 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
RRP7BPQ9NSQ0 C1QB-203ENST00000509305 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
RRP7BPQ9NSQ0 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC27.06■■□□□ 1.92
RRP7BPQ9NSQ0 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
RRP7BPQ9NSQ0 GPALPP1-207ENST00000611650 899 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
RRP7BPQ9NSQ0 ASAH1-255ENST00000637638 699 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
RRP7BPQ9NSQ0 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
RRP7BPQ9NSQ0 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
RRP7BPQ9NSQ0 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
RRP7BPQ9NSQ0 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
RRP7BPQ9NSQ0 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
RRP7BPQ9NSQ0 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
RRP7BPQ9NSQ0 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
RRP7BPQ9NSQ0 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
RRP7BPQ9NSQ0 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
RRP7BPQ9NSQ0 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
RRP7BPQ9NSQ0 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
RRP7BPQ9NSQ0 MRPS18A-201ENST00000372116 785 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
RRP7BPQ9NSQ0 PITPNA-AS1-201ENST00000425081 542 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
RRP7BPQ9NSQ0 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
RRP7BPQ9NSQ0 HNF1B-206ENST00000620125 1103 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
RRP7BPQ9NSQ0 FAM215A-202ENST00000632077 792 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
RRP7BPQ9NSQ0 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
RRP7BPQ9NSQ0 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
RRP7BPQ9NSQ0 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
RRP7BPQ9NSQ0 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
RRP7BPQ9NSQ0 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.04■■□□□ 1.92
RRP7BPQ9NSQ0 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
RRP7BPQ9NSQ0 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
RRP7BPQ9NSQ0 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
RRP7BPQ9NSQ0 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
RRP7BPQ9NSQ0 KLHL7-201ENST00000322275 969 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
RRP7BPQ9NSQ0 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC27.04■■□□□ 1.92
RRP7BPQ9NSQ0 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
RRP7BPQ9NSQ0 SMIM29-201ENST00000335352 1160 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
RRP7BPQ9NSQ0 FUOM-202ENST00000368551 628 ntTSL 3 BASIC27.04■■□□□ 1.92
RRP7BPQ9NSQ0 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC27.04■■□□□ 1.92
RRP7BPQ9NSQ0 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
RRP7BPQ9NSQ0 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC27.04■■□□□ 1.92
RRP7BPQ9NSQ0 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
RRP7BPQ9NSQ0 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
RRP7BPQ9NSQ0 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
RRP7BPQ9NSQ0 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
RRP7BPQ9NSQ0 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
RRP7BPQ9NSQ0 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
RRP7BPQ9NSQ0 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
RRP7BPQ9NSQ0 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
RRP7BPQ9NSQ0 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
RRP7BPQ9NSQ0 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
RRP7BPQ9NSQ0 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
RRP7BPQ9NSQ0 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.9 ms