Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQ75

CASS4, Cas scaffolding protein family member 4, humanhuman

Predictions only

Length 786 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASS4Q9NQ75 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CASS4Q9NQ75 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CASS4Q9NQ75 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
CASS4Q9NQ75 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CASS4Q9NQ75 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CASS4Q9NQ75 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CASS4Q9NQ75 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CASS4Q9NQ75 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CASS4Q9NQ75 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CASS4Q9NQ75 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CASS4Q9NQ75 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CASS4Q9NQ75 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CASS4Q9NQ75 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CASS4Q9NQ75 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CASS4Q9NQ75 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CASS4Q9NQ75 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CASS4Q9NQ75 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CASS4Q9NQ75 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CASS4Q9NQ75 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CASS4Q9NQ75 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CASS4Q9NQ75 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CASS4Q9NQ75 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
CASS4Q9NQ75 C6orf132-201ENST00000341865 6210 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CASS4Q9NQ75 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CASS4Q9NQ75 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CASS4Q9NQ75 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CASS4Q9NQ75 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CASS4Q9NQ75 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CASS4Q9NQ75 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CASS4Q9NQ75 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CASS4Q9NQ75 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CASS4Q9NQ75 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CASS4Q9NQ75 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CASS4Q9NQ75 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CASS4Q9NQ75 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CASS4Q9NQ75 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CASS4Q9NQ75 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CASS4Q9NQ75 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CASS4Q9NQ75 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CASS4Q9NQ75 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
CASS4Q9NQ75 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CASS4Q9NQ75 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CASS4Q9NQ75 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CASS4Q9NQ75 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CASS4Q9NQ75 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
CASS4Q9NQ75 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CASS4Q9NQ75 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CASS4Q9NQ75 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CASS4Q9NQ75 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CASS4Q9NQ75 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CASS4Q9NQ75 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CASS4Q9NQ75 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CASS4Q9NQ75 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CASS4Q9NQ75 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CASS4Q9NQ75 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CASS4Q9NQ75 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CASS4Q9NQ75 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CASS4Q9NQ75 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CASS4Q9NQ75 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CASS4Q9NQ75 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CASS4Q9NQ75 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CASS4Q9NQ75 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CASS4Q9NQ75 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CASS4Q9NQ75 ARHGEF28-212ENST00000513042 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CASS4Q9NQ75 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CASS4Q9NQ75 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CASS4Q9NQ75 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
CASS4Q9NQ75 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CASS4Q9NQ75 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CASS4Q9NQ75 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CASS4Q9NQ75 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CASS4Q9NQ75 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CASS4Q9NQ75 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CASS4Q9NQ75 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
CASS4Q9NQ75 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CASS4Q9NQ75 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CASS4Q9NQ75 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CASS4Q9NQ75 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CASS4Q9NQ75 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CASS4Q9NQ75 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
CASS4Q9NQ75 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CASS4Q9NQ75 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CASS4Q9NQ75 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CASS4Q9NQ75 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CASS4Q9NQ75 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CASS4Q9NQ75 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CASS4Q9NQ75 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CASS4Q9NQ75 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CASS4Q9NQ75 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CASS4Q9NQ75 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CASS4Q9NQ75 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CASS4Q9NQ75 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CASS4Q9NQ75 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CASS4Q9NQ75 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CASS4Q9NQ75 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CASS4Q9NQ75 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CASS4Q9NQ75 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CASS4Q9NQ75 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CASS4Q9NQ75 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CASS4Q9NQ75 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.1 ms