Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPE6

SPAG4, Sperm-associated antigen 4 protein, humanhuman

Predictions only

Length 437 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPAG4Q9NPE6 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SPAG4Q9NPE6 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SPAG4Q9NPE6 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SPAG4Q9NPE6 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
SPAG4Q9NPE6 MYO1B-202ENST00000339514 5026 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
SPAG4Q9NPE6 EWSR1-222ENST00000629659 2446 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
SPAG4Q9NPE6 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
SPAG4Q9NPE6 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
SPAG4Q9NPE6 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC17.33■□□□□ 0.37
SPAG4Q9NPE6 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
SPAG4Q9NPE6 TLK2-201ENST00000326270 3512 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
SPAG4Q9NPE6 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
SPAG4Q9NPE6 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
SPAG4Q9NPE6 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
SPAG4Q9NPE6 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SPAG4Q9NPE6 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SPAG4Q9NPE6 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SPAG4Q9NPE6 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
SPAG4Q9NPE6 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
SPAG4Q9NPE6 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
SPAG4Q9NPE6 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
SPAG4Q9NPE6 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC17.33■□□□□ 0.36
SPAG4Q9NPE6 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC17.33■□□□□ 0.36
SPAG4Q9NPE6 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
SPAG4Q9NPE6 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
SPAG4Q9NPE6 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
SPAG4Q9NPE6 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SPAG4Q9NPE6 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SPAG4Q9NPE6 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SPAG4Q9NPE6 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SPAG4Q9NPE6 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SPAG4Q9NPE6 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SPAG4Q9NPE6 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SPAG4Q9NPE6 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SPAG4Q9NPE6 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
SPAG4Q9NPE6 MPV17L-201ENST00000287594 5820 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SPAG4Q9NPE6 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SPAG4Q9NPE6 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
SPAG4Q9NPE6 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SPAG4Q9NPE6 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SPAG4Q9NPE6 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SPAG4Q9NPE6 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SPAG4Q9NPE6 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
SPAG4Q9NPE6 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SPAG4Q9NPE6 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SPAG4Q9NPE6 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SPAG4Q9NPE6 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SPAG4Q9NPE6 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SPAG4Q9NPE6 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SPAG4Q9NPE6 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SPAG4Q9NPE6 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SPAG4Q9NPE6 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SPAG4Q9NPE6 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SPAG4Q9NPE6 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SPAG4Q9NPE6 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
SPAG4Q9NPE6 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
SPAG4Q9NPE6 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SPAG4Q9NPE6 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SPAG4Q9NPE6 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SPAG4Q9NPE6 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
SPAG4Q9NPE6 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SPAG4Q9NPE6 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SPAG4Q9NPE6 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SPAG4Q9NPE6 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SPAG4Q9NPE6 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SPAG4Q9NPE6 LZTS3-203ENST00000360342 4055 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SPAG4Q9NPE6 TBC1D4-202ENST00000377636 6364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SPAG4Q9NPE6 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SPAG4Q9NPE6 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SPAG4Q9NPE6 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SPAG4Q9NPE6 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SPAG4Q9NPE6 MALT1-202ENST00000348428 9368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SPAG4Q9NPE6 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SPAG4Q9NPE6 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SPAG4Q9NPE6 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SPAG4Q9NPE6 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SPAG4Q9NPE6 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SPAG4Q9NPE6 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SPAG4Q9NPE6 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SPAG4Q9NPE6 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SPAG4Q9NPE6 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SPAG4Q9NPE6 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SPAG4Q9NPE6 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SPAG4Q9NPE6 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SPAG4Q9NPE6 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SPAG4Q9NPE6 PPP3CA-203ENST00000394854 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SPAG4Q9NPE6 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SPAG4Q9NPE6 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SPAG4Q9NPE6 PTPA-203ENST00000348141 2737 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SPAG4Q9NPE6 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SPAG4Q9NPE6 PTPA-207ENST00000393370 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SPAG4Q9NPE6 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SPAG4Q9NPE6 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SPAG4Q9NPE6 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
SPAG4Q9NPE6 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SPAG4Q9NPE6 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SPAG4Q9NPE6 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SPAG4Q9NPE6 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SPAG4Q9NPE6 CDCP1-201ENST00000296129 6006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SPAG4Q9NPE6 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21 ms