Protein–RNA interactions for Protein: Q9HC77

CENPJ, Centromere protein J, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,338 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPJQ9HC77 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CENPJQ9HC77 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CENPJQ9HC77 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CENPJQ9HC77 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CENPJQ9HC77 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CENPJQ9HC77 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CENPJQ9HC77 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CENPJQ9HC77 MED22-202ENST00000371999 987 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
CENPJQ9HC77 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CENPJQ9HC77 RBSN-204ENST00000449050 903 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
CENPJQ9HC77 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CENPJQ9HC77 AP001005.1-201ENST00000571755 1248 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
CENPJQ9HC77 AC064862.7-201ENST00000604520 867 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
CENPJQ9HC77 AC064853.6-201ENST00000642029 303 ntAPPRIS P1 BASIC25.14■■□□□ 1.62
CENPJQ9HC77 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CENPJQ9HC77 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
CENPJQ9HC77 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
CENPJQ9HC77 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CENPJQ9HC77 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
CENPJQ9HC77 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
CENPJQ9HC77 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
CENPJQ9HC77 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CENPJQ9HC77 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CENPJQ9HC77 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CENPJQ9HC77 TXNRD2-212ENST00000485358 850 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CENPJQ9HC77 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CENPJQ9HC77 MAP1LC3B-207ENST00000565788 625 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CENPJQ9HC77 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CENPJQ9HC77 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CENPJQ9HC77 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CENPJQ9HC77 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CENPJQ9HC77 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CENPJQ9HC77 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CENPJQ9HC77 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CENPJQ9HC77 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CENPJQ9HC77 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CENPJQ9HC77 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CENPJQ9HC77 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CENPJQ9HC77 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CENPJQ9HC77 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CENPJQ9HC77 AL162171.1-201ENST00000556328 718 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CENPJQ9HC77 AC012615.3-201ENST00000592884 500 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CENPJQ9HC77 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
CENPJQ9HC77 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CENPJQ9HC77 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CENPJQ9HC77 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CENPJQ9HC77 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CENPJQ9HC77 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
CENPJQ9HC77 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CENPJQ9HC77 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CENPJQ9HC77 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CENPJQ9HC77 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CENPJQ9HC77 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CENPJQ9HC77 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CENPJQ9HC77 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CENPJQ9HC77 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CENPJQ9HC77 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CENPJQ9HC77 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CENPJQ9HC77 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CENPJQ9HC77 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
CENPJQ9HC77 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CENPJQ9HC77 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CENPJQ9HC77 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CENPJQ9HC77 FUOM-202ENST00000368551 628 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CENPJQ9HC77 C1orf109-203ENST00000464085 919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CENPJQ9HC77 TTLL12-204ENST00000494035 888 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CENPJQ9HC77 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CENPJQ9HC77 AL512343.2-201ENST00000609423 490 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CENPJQ9HC77 AC120114.3-201ENST00000611923 658 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
CENPJQ9HC77 BX640515.1-201ENST00000617215 977 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
CENPJQ9HC77 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CENPJQ9HC77 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CENPJQ9HC77 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CENPJQ9HC77 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CENPJQ9HC77 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CENPJQ9HC77 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CENPJQ9HC77 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CENPJQ9HC77 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CENPJQ9HC77 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CENPJQ9HC77 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CENPJQ9HC77 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CENPJQ9HC77 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CENPJQ9HC77 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CENPJQ9HC77 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CENPJQ9HC77 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CENPJQ9HC77 AP005117.1-201ENST00000584346 1413 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
CENPJQ9HC77 AL031284.1-201ENST00000419297 478 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
CENPJQ9HC77 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CENPJQ9HC77 ABCD1P5-201ENST00000445663 754 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
CENPJQ9HC77 AF186996.4-201ENST00000467186 377 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
CENPJQ9HC77 LINC01607-201ENST00000607172 621 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CENPJQ9HC77 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CENPJQ9HC77 MIR7706-201ENST00000613747 67 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
CENPJQ9HC77 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CENPJQ9HC77 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CENPJQ9HC77 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CENPJQ9HC77 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CENPJQ9HC77 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CENPJQ9HC77 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CENPJQ9HC77 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.3 ms