Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0A0

CNTNAP4, Contactin-associated protein-like 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,308 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTNAP4Q9C0A0 KRT18P2-201ENST00000447938 1258 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
CNTNAP4Q9C0A0 USP30-AS1-201ENST00000478808 656 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CNTNAP4Q9C0A0 GMDS-AS1-205ENST00000529893 900 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CNTNAP4Q9C0A0 AL137786.1-202ENST00000555496 789 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CNTNAP4Q9C0A0 CRB3-204ENST00000600229 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CNTNAP4Q9C0A0 MCCC2-209ENST00000629193 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CNTNAP4Q9C0A0 AL662799.1-201ENST00000630418 496 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CNTNAP4Q9C0A0 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CNTNAP4Q9C0A0 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CNTNAP4Q9C0A0 DBNL-213ENST00000452943 1513 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CNTNAP4Q9C0A0 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CNTNAP4Q9C0A0 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CNTNAP4Q9C0A0 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CNTNAP4Q9C0A0 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CNTNAP4Q9C0A0 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CNTNAP4Q9C0A0 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CNTNAP4Q9C0A0 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CNTNAP4Q9C0A0 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CNTNAP4Q9C0A0 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CNTNAP4Q9C0A0 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CNTNAP4Q9C0A0 HCCS-203ENST00000380763 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CNTNAP4Q9C0A0 LBH-203ENST00000404397 543 ntTSL 4 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CNTNAP4Q9C0A0 COQ7-208ENST00000568985 714 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CNTNAP4Q9C0A0 CDC42EP4-206ENST00000581014 737 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CNTNAP4Q9C0A0 CROCCP3-203ENST00000589964 255 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CNTNAP4Q9C0A0 RPS15-207ENST00000591032 550 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CNTNAP4Q9C0A0 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CNTNAP4Q9C0A0 MOV10L1-203ENST00000395852 1422 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CNTNAP4Q9C0A0 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CNTNAP4Q9C0A0 CLDN15-208ENST00000611078 1509 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CNTNAP4Q9C0A0 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CNTNAP4Q9C0A0 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CNTNAP4Q9C0A0 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CNTNAP4Q9C0A0 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CNTNAP4Q9C0A0 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CNTNAP4Q9C0A0 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CNTNAP4Q9C0A0 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CNTNAP4Q9C0A0 TOR3A-201ENST00000352445 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CNTNAP4Q9C0A0 ZNF789-202ENST00000379724 510 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CNTNAP4Q9C0A0 ODF3B-204ENST00000405135 917 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CNTNAP4Q9C0A0 AC067930.3-201ENST00000524808 701 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CNTNAP4Q9C0A0 AC244517.5-205ENST00000623615 575 ntTSL 4 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CNTNAP4Q9C0A0 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CNTNAP4Q9C0A0 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CNTNAP4Q9C0A0 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CNTNAP4Q9C0A0 ZNF561-AS1-204ENST00000587536 1799 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CNTNAP4Q9C0A0 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CNTNAP4Q9C0A0 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CNTNAP4Q9C0A0 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CNTNAP4Q9C0A0 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CNTNAP4Q9C0A0 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CNTNAP4Q9C0A0 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CNTNAP4Q9C0A0 OPN1LW-201ENST00000369951 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CNTNAP4Q9C0A0 SLC4A1APP2-201ENST00000424054 1259 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
CNTNAP4Q9C0A0 BAX-213ENST00000539787 458 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CNTNAP4Q9C0A0 AC010624.2-201ENST00000600998 575 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CNTNAP4Q9C0A0 AC004817.3-201ENST00000602957 2129 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
CNTNAP4Q9C0A0 NPAS4-204ENST00000639555 878 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CNTNAP4Q9C0A0 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CNTNAP4Q9C0A0 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CNTNAP4Q9C0A0 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CNTNAP4Q9C0A0 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CNTNAP4Q9C0A0 AC138969.1-205ENST00000381497 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CNTNAP4Q9C0A0 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CNTNAP4Q9C0A0 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CNTNAP4Q9C0A0 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CNTNAP4Q9C0A0 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CNTNAP4Q9C0A0 CD244-202ENST00000368033 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CNTNAP4Q9C0A0 AC002310.6-201ENST00000624451 1377 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
CNTNAP4Q9C0A0 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CNTNAP4Q9C0A0 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CNTNAP4Q9C0A0 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CNTNAP4Q9C0A0 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
CNTNAP4Q9C0A0 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CNTNAP4Q9C0A0 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CNTNAP4Q9C0A0 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CNTNAP4Q9C0A0 ALG1L5P-201ENST00000482043 771 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
CNTNAP4Q9C0A0 LMX1B-203ENST00000526117 1195 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CNTNAP4Q9C0A0 AHSA1-208ENST00000555517 832 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CNTNAP4Q9C0A0 AC018558.2-201ENST00000566562 480 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CNTNAP4Q9C0A0 NUTF2-206ENST00000569436 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CNTNAP4Q9C0A0 AL589182.2-201ENST00000619332 1049 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
CNTNAP4Q9C0A0 ADORA1-209ENST00000640524 653 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CNTNAP4Q9C0A0 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CNTNAP4Q9C0A0 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CNTNAP4Q9C0A0 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CNTNAP4Q9C0A0 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CNTNAP4Q9C0A0 KRT18P28-201ENST00000453838 1332 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
CNTNAP4Q9C0A0 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CNTNAP4Q9C0A0 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CNTNAP4Q9C0A0 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CNTNAP4Q9C0A0 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CNTNAP4Q9C0A0 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CNTNAP4Q9C0A0 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CNTNAP4Q9C0A0 FGFBP2-201ENST00000259989 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CNTNAP4Q9C0A0 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CNTNAP4Q9C0A0 AC105202.1-202ENST00000522060 834 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CNTNAP4Q9C0A0 L2HGDH-206ENST00000555610 804 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CNTNAP4Q9C0A0 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CNTNAP4Q9C0A0 AL356481.3-201ENST00000630523 575 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.3 ms