Protein–RNA interactions for Protein: Q9C037

TRIM4, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM4, humanhuman

Predictions only

Length 500 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM4Q9C037 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
TRIM4Q9C037 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TRIM4Q9C037 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TRIM4Q9C037 SH3RF1-201ENST00000284637 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
TRIM4Q9C037 CYP2U1-202ENST00000508453 3125 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
TRIM4Q9C037 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
TRIM4Q9C037 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TRIM4Q9C037 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
TRIM4Q9C037 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
TRIM4Q9C037 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TRIM4Q9C037 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
TRIM4Q9C037 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
TRIM4Q9C037 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
TRIM4Q9C037 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
TRIM4Q9C037 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
TRIM4Q9C037 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TRIM4Q9C037 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TRIM4Q9C037 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TRIM4Q9C037 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
TRIM4Q9C037 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
TRIM4Q9C037 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
TRIM4Q9C037 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
TRIM4Q9C037 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC18.14■□□□□ 0.49
TRIM4Q9C037 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
TRIM4Q9C037 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
TRIM4Q9C037 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
TRIM4Q9C037 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
TRIM4Q9C037 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TRIM4Q9C037 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
TRIM4Q9C037 SLC1A4-201ENST00000234256 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TRIM4Q9C037 LZTS3-202ENST00000337576 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
TRIM4Q9C037 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
TRIM4Q9C037 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
TRIM4Q9C037 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TRIM4Q9C037 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TRIM4Q9C037 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
TRIM4Q9C037 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
TRIM4Q9C037 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TRIM4Q9C037 KDM5C-202ENST00000375379 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
TRIM4Q9C037 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
TRIM4Q9C037 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
TRIM4Q9C037 FOLH1-201ENST00000256999 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TRIM4Q9C037 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TRIM4Q9C037 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TRIM4Q9C037 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TRIM4Q9C037 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
TRIM4Q9C037 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TRIM4Q9C037 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TRIM4Q9C037 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TRIM4Q9C037 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
TRIM4Q9C037 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TRIM4Q9C037 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TRIM4Q9C037 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TRIM4Q9C037 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TRIM4Q9C037 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TRIM4Q9C037 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TRIM4Q9C037 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TRIM4Q9C037 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
TRIM4Q9C037 MYB-209ENST00000442647 3304 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TRIM4Q9C037 PELI2-201ENST00000267460 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TRIM4Q9C037 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TRIM4Q9C037 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TRIM4Q9C037 SHANK1-204ENST00000391814 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TRIM4Q9C037 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TRIM4Q9C037 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TRIM4Q9C037 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TRIM4Q9C037 MARCH1-203ENST00000503008 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TRIM4Q9C037 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TRIM4Q9C037 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
TRIM4Q9C037 LIFR-202ENST00000453190 4253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TRIM4Q9C037 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TRIM4Q9C037 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TRIM4Q9C037 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TRIM4Q9C037 TRAPPC11-201ENST00000334690 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TRIM4Q9C037 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TRIM4Q9C037 MTDH-201ENST00000336273 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TRIM4Q9C037 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TRIM4Q9C037 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TRIM4Q9C037 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TRIM4Q9C037 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TRIM4Q9C037 MIDN-201ENST00000300952 3790 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TRIM4Q9C037 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TRIM4Q9C037 RAB1A-203ENST00000409784 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TRIM4Q9C037 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TRIM4Q9C037 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TRIM4Q9C037 PCDHGA12-202ENST00000613314 2634 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TRIM4Q9C037 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TRIM4Q9C037 CDCP1-201ENST00000296129 6006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TRIM4Q9C037 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TRIM4Q9C037 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TRIM4Q9C037 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TRIM4Q9C037 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TRIM4Q9C037 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TRIM4Q9C037 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TRIM4Q9C037 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TRIM4Q9C037 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TRIM4Q9C037 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
TRIM4Q9C037 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TRIM4Q9C037 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TRIM4Q9C037 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.5 ms