Protein–RNA interactions for Protein: Q9C000

NLRP1, NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,473 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NLRP1Q9C000 WDR53-203ENST00000429115 683 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
NLRP1Q9C000 AC008992.1-201ENST00000591132 446 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
NLRP1Q9C000 AC004706.3-202ENST00000621574 984 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
NLRP1Q9C000 GPR89P-201ENST00000407924 1495 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
NLRP1Q9C000 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
NLRP1Q9C000 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
NLRP1Q9C000 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
NLRP1Q9C000 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
NLRP1Q9C000 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC25.91■■□□□ 1.74
NLRP1Q9C000 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
NLRP1Q9C000 AP000344.2-201ENST00000512987 629 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
NLRP1Q9C000 CIPC-205ENST00000555437 566 ntTSL 3 BASIC25.91■■□□□ 1.74
NLRP1Q9C000 RPL28-205ENST00000558131 444 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
NLRP1Q9C000 MIR22HG-204ENST00000571595 767 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
NLRP1Q9C000 ARMC7-204ENST00000582136 1204 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
NLRP1Q9C000 MRPL34-205ENST00000600434 793 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC25.91■■□□□ 1.74
NLRP1Q9C000 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
NLRP1Q9C000 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
NLRP1Q9C000 ZDHHC4-206ENST00000405731 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
NLRP1Q9C000 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
NLRP1Q9C000 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
NLRP1Q9C000 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
NLRP1Q9C000 TSEN15P1-201ENST00000423257 515 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
NLRP1Q9C000 COX20P2-201ENST00000452636 358 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
NLRP1Q9C000 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
NLRP1Q9C000 ARTN-206ENST00000472435 402 ntTSL 3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
NLRP1Q9C000 RIMS4-202ENST00000541604 1036 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
NLRP1Q9C000 RNF34-208ENST00000555076 593 ntTSL 3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
NLRP1Q9C000 MIR4751-201ENST00000578027 74 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
NLRP1Q9C000 AC009630.3-201ENST00000581909 729 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
NLRP1Q9C000 SWI5-206ENST00000608796 906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
NLRP1Q9C000 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
NLRP1Q9C000 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
NLRP1Q9C000 AZIN2-203ENST00000373441 1443 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
NLRP1Q9C000 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
NLRP1Q9C000 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
NLRP1Q9C000 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
NLRP1Q9C000 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
NLRP1Q9C000 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
NLRP1Q9C000 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
NLRP1Q9C000 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
NLRP1Q9C000 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
NLRP1Q9C000 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
NLRP1Q9C000 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
NLRP1Q9C000 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
NLRP1Q9C000 IRF9-203ENST00000557894 1391 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
NLRP1Q9C000 SFTPC-201ENST00000318561 997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
NLRP1Q9C000 MYL6-202ENST00000348108 722 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC25.89■■□□□ 1.73
NLRP1Q9C000 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
NLRP1Q9C000 LINC00029-202ENST00000414668 1117 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
NLRP1Q9C000 BCRP1-201ENST00000444246 691 ntBASIC25.89■■□□□ 1.73
NLRP1Q9C000 HOXB-AS4-202ENST00000480386 566 ntTSL 4 BASIC25.89■■□□□ 1.73
NLRP1Q9C000 C5orf66-202ENST00000507641 547 ntTSL 3 BASIC25.89■■□□□ 1.73
NLRP1Q9C000 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.73
NLRP1Q9C000 AC020558.1-201ENST00000583662 425 ntTSL 3 BASIC25.89■■□□□ 1.73
NLRP1Q9C000 OR5AH1P-202ENST00000597822 431 ntTSL 3 BASIC25.89■■□□□ 1.73
NLRP1Q9C000 AL590999.1-203ENST00000606829 542 ntTSL 4 BASIC25.89■■□□□ 1.73
NLRP1Q9C000 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
NLRP1Q9C000 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.73
NLRP1Q9C000 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.73
NLRP1Q9C000 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
NLRP1Q9C000 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
NLRP1Q9C000 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
NLRP1Q9C000 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
NLRP1Q9C000 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
NLRP1Q9C000 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
NLRP1Q9C000 AC105339.1-201ENST00000440089 1362 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
NLRP1Q9C000 CD82-202ENST00000342935 967 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
NLRP1Q9C000 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
NLRP1Q9C000 NRSN2-AS1-202ENST00000442637 762 ntTSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
NLRP1Q9C000 PDPK2P-202ENST00000562415 1191 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
NLRP1Q9C000 ZNF773-202ENST00000593916 548 ntTSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
NLRP1Q9C000 AL096865.1-201ENST00000606796 927 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
NLRP1Q9C000 AC093028.1-201ENST00000622998 982 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
NLRP1Q9C000 NPAS4-204ENST00000639555 878 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
NLRP1Q9C000 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
NLRP1Q9C000 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
NLRP1Q9C000 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
NLRP1Q9C000 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
NLRP1Q9C000 FAM3D-201ENST00000358781 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
NLRP1Q9C000 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
NLRP1Q9C000 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
NLRP1Q9C000 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
NLRP1Q9C000 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
NLRP1Q9C000 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC25.87■■□□□ 1.73
NLRP1Q9C000 AP4S1-202ENST00000313566 839 ntTSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
NLRP1Q9C000 IGLL3P-201ENST00000412472 434 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
NLRP1Q9C000 PRSS29P-201ENST00000440800 595 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
NLRP1Q9C000 VN2R19P-201ENST00000442399 1052 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
NLRP1Q9C000 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
NLRP1Q9C000 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.87■■□□□ 1.73
NLRP1Q9C000 RGS19-202ENST00000395042 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
NLRP1Q9C000 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
NLRP1Q9C000 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
NLRP1Q9C000 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
NLRP1Q9C000 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
NLRP1Q9C000 AC093627.6-201ENST00000478759 1365 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
NLRP1Q9C000 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
NLRP1Q9C000 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
NLRP1Q9C000 GUK1-203ENST00000366718 1275 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.4 ms