Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXC9

BBS2, Bardet-Biedl syndrome 2 protein, humanhuman

Predictions only

Length 721 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BBS2Q9BXC9 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
BBS2Q9BXC9 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
BBS2Q9BXC9 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
BBS2Q9BXC9 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
BBS2Q9BXC9 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
BBS2Q9BXC9 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
BBS2Q9BXC9 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
BBS2Q9BXC9 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
BBS2Q9BXC9 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
BBS2Q9BXC9 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
BBS2Q9BXC9 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
BBS2Q9BXC9 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
BBS2Q9BXC9 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
BBS2Q9BXC9 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
BBS2Q9BXC9 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
BBS2Q9BXC9 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
BBS2Q9BXC9 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
BBS2Q9BXC9 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
BBS2Q9BXC9 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
BBS2Q9BXC9 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
BBS2Q9BXC9 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
BBS2Q9BXC9 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
BBS2Q9BXC9 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
BBS2Q9BXC9 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
BBS2Q9BXC9 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
BBS2Q9BXC9 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
BBS2Q9BXC9 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
BBS2Q9BXC9 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
BBS2Q9BXC9 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
BBS2Q9BXC9 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
BBS2Q9BXC9 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
BBS2Q9BXC9 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
BBS2Q9BXC9 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
BBS2Q9BXC9 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
BBS2Q9BXC9 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
BBS2Q9BXC9 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
BBS2Q9BXC9 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
BBS2Q9BXC9 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
BBS2Q9BXC9 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
BBS2Q9BXC9 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
BBS2Q9BXC9 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
BBS2Q9BXC9 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
BBS2Q9BXC9 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
BBS2Q9BXC9 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
BBS2Q9BXC9 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
BBS2Q9BXC9 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
BBS2Q9BXC9 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
BBS2Q9BXC9 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
BBS2Q9BXC9 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
BBS2Q9BXC9 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
BBS2Q9BXC9 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
BBS2Q9BXC9 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
BBS2Q9BXC9 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
BBS2Q9BXC9 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
BBS2Q9BXC9 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
BBS2Q9BXC9 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
BBS2Q9BXC9 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
BBS2Q9BXC9 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
BBS2Q9BXC9 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
BBS2Q9BXC9 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
BBS2Q9BXC9 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
BBS2Q9BXC9 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
BBS2Q9BXC9 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
BBS2Q9BXC9 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
BBS2Q9BXC9 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
BBS2Q9BXC9 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
BBS2Q9BXC9 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
BBS2Q9BXC9 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
BBS2Q9BXC9 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
BBS2Q9BXC9 PDCD2L-203ENST00000587065 492 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
BBS2Q9BXC9 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
BBS2Q9BXC9 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
BBS2Q9BXC9 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
BBS2Q9BXC9 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
BBS2Q9BXC9 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
BBS2Q9BXC9 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
BBS2Q9BXC9 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
BBS2Q9BXC9 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
BBS2Q9BXC9 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
BBS2Q9BXC9 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
BBS2Q9BXC9 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
BBS2Q9BXC9 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
BBS2Q9BXC9 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
BBS2Q9BXC9 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
BBS2Q9BXC9 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
BBS2Q9BXC9 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
BBS2Q9BXC9 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
BBS2Q9BXC9 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
BBS2Q9BXC9 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
BBS2Q9BXC9 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
BBS2Q9BXC9 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
BBS2Q9BXC9 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
BBS2Q9BXC9 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
BBS2Q9BXC9 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
BBS2Q9BXC9 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
BBS2Q9BXC9 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
BBS2Q9BXC9 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
BBS2Q9BXC9 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
BBS2Q9BXC9 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
BBS2Q9BXC9 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.1 ms