Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ75

CMSS1, Protein CMSS1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 279 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CMSS1Q9BQ75 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CMSS1Q9BQ75 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CMSS1Q9BQ75 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CMSS1Q9BQ75 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CMSS1Q9BQ75 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CMSS1Q9BQ75 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CMSS1Q9BQ75 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CMSS1Q9BQ75 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CMSS1Q9BQ75 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CMSS1Q9BQ75 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CMSS1Q9BQ75 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CMSS1Q9BQ75 MIDN-201ENST00000300952 3790 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CMSS1Q9BQ75 MTCL1-205ENST00000517570 6009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CMSS1Q9BQ75 SLK-202ENST00000369755 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CMSS1Q9BQ75 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CMSS1Q9BQ75 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CMSS1Q9BQ75 NAA50-201ENST00000240922 6135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CMSS1Q9BQ75 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CMSS1Q9BQ75 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CMSS1Q9BQ75 AATK-201ENST00000326724 5257 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CMSS1Q9BQ75 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
CMSS1Q9BQ75 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CMSS1Q9BQ75 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CMSS1Q9BQ75 C4orf50-202ENST00000531445 6860 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CMSS1Q9BQ75 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CMSS1Q9BQ75 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CMSS1Q9BQ75 ZNF500-201ENST00000219478 5880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CMSS1Q9BQ75 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
CMSS1Q9BQ75 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CMSS1Q9BQ75 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CMSS1Q9BQ75 TCAF2-203ENST00000425618 2448 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CMSS1Q9BQ75 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CMSS1Q9BQ75 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CMSS1Q9BQ75 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CMSS1Q9BQ75 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CMSS1Q9BQ75 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CMSS1Q9BQ75 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CMSS1Q9BQ75 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CMSS1Q9BQ75 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
CMSS1Q9BQ75 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CMSS1Q9BQ75 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CMSS1Q9BQ75 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CMSS1Q9BQ75 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
CMSS1Q9BQ75 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CMSS1Q9BQ75 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CMSS1Q9BQ75 CICP6-201ENST00000457191 2729 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
CMSS1Q9BQ75 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CMSS1Q9BQ75 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CMSS1Q9BQ75 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CMSS1Q9BQ75 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CMSS1Q9BQ75 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CMSS1Q9BQ75 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CMSS1Q9BQ75 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CMSS1Q9BQ75 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CMSS1Q9BQ75 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CMSS1Q9BQ75 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CMSS1Q9BQ75 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CMSS1Q9BQ75 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CMSS1Q9BQ75 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CMSS1Q9BQ75 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CMSS1Q9BQ75 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CMSS1Q9BQ75 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CMSS1Q9BQ75 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CMSS1Q9BQ75 MAPKAP1-208ENST00000394063 2977 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CMSS1Q9BQ75 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CMSS1Q9BQ75 ZCCHC18-203ENST00000537356 2907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CMSS1Q9BQ75 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CMSS1Q9BQ75 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CMSS1Q9BQ75 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CMSS1Q9BQ75 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CMSS1Q9BQ75 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CMSS1Q9BQ75 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CMSS1Q9BQ75 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CMSS1Q9BQ75 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CMSS1Q9BQ75 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CMSS1Q9BQ75 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CMSS1Q9BQ75 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
CMSS1Q9BQ75 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CMSS1Q9BQ75 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CMSS1Q9BQ75 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CMSS1Q9BQ75 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CMSS1Q9BQ75 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
CMSS1Q9BQ75 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CMSS1Q9BQ75 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CMSS1Q9BQ75 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CMSS1Q9BQ75 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CMSS1Q9BQ75 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CMSS1Q9BQ75 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CMSS1Q9BQ75 LRRC3-201ENST00000291592 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CMSS1Q9BQ75 GDE1-201ENST00000353258 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CMSS1Q9BQ75 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CMSS1Q9BQ75 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CMSS1Q9BQ75 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CMSS1Q9BQ75 DLG4-201ENST00000302955 3184 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CMSS1Q9BQ75 DLG4-202ENST00000399506 3185 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CMSS1Q9BQ75 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CMSS1Q9BQ75 UNC13A-205ENST00000551649 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CMSS1Q9BQ75 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CMSS1Q9BQ75 ISLR2-203ENST00000435464 4259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CMSS1Q9BQ75 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.2 ms