Protein–RNA interactions for Protein: Q99999

GAL3ST1, Galactosylceramide sulfotransferase, humanhuman

Predictions only

Length 423 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GAL3ST1Q99999 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GAL3ST1Q99999 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GAL3ST1Q99999 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
GAL3ST1Q99999 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
GAL3ST1Q99999 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GAL3ST1Q99999 MAP4K3-201ENST00000263881 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GAL3ST1Q99999 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GAL3ST1Q99999 CDK19-202ENST00000368911 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GAL3ST1Q99999 ZNF385C-205ENST00000618554 2596 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
GAL3ST1Q99999 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
GAL3ST1Q99999 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GAL3ST1Q99999 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GAL3ST1Q99999 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GAL3ST1Q99999 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GAL3ST1Q99999 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GAL3ST1Q99999 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
GAL3ST1Q99999 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
GAL3ST1Q99999 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
GAL3ST1Q99999 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
GAL3ST1Q99999 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
GAL3ST1Q99999 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
GAL3ST1Q99999 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
GAL3ST1Q99999 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
GAL3ST1Q99999 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GAL3ST1Q99999 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
GAL3ST1Q99999 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GAL3ST1Q99999 NFATC4-231ENST00000557451 5613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GAL3ST1Q99999 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
GAL3ST1Q99999 ISLR2-203ENST00000435464 4259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
GAL3ST1Q99999 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GAL3ST1Q99999 NFIC-211ENST00000641145 8399 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
GAL3ST1Q99999 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
GAL3ST1Q99999 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GAL3ST1Q99999 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GAL3ST1Q99999 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GAL3ST1Q99999 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
GAL3ST1Q99999 CRAMP1-201ENST00000293925 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GAL3ST1Q99999 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GAL3ST1Q99999 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GAL3ST1Q99999 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GAL3ST1Q99999 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
GAL3ST1Q99999 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GAL3ST1Q99999 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GAL3ST1Q99999 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GAL3ST1Q99999 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GAL3ST1Q99999 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
GAL3ST1Q99999 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
GAL3ST1Q99999 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
GAL3ST1Q99999 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GAL3ST1Q99999 GIMAP1-201ENST00000307194 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GAL3ST1Q99999 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GAL3ST1Q99999 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GAL3ST1Q99999 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GAL3ST1Q99999 DDHD1-202ENST00000357758 5603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GAL3ST1Q99999 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GAL3ST1Q99999 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GAL3ST1Q99999 L1CAM-203ENST00000370055 4655 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GAL3ST1Q99999 SLC30A4-201ENST00000261867 7157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GAL3ST1Q99999 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GAL3ST1Q99999 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
GAL3ST1Q99999 NFATC4-208ENST00000553708 5367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GAL3ST1Q99999 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GAL3ST1Q99999 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GAL3ST1Q99999 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GAL3ST1Q99999 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GAL3ST1Q99999 ARHGAP44-202ENST00000340825 4211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GAL3ST1Q99999 ARHGAP44-203ENST00000379672 4228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GAL3ST1Q99999 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GAL3ST1Q99999 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GAL3ST1Q99999 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GAL3ST1Q99999 STAT5A-201ENST00000345506 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GAL3ST1Q99999 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GAL3ST1Q99999 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GAL3ST1Q99999 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GAL3ST1Q99999 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GAL3ST1Q99999 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GAL3ST1Q99999 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
GAL3ST1Q99999 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GAL3ST1Q99999 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GAL3ST1Q99999 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GAL3ST1Q99999 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
GAL3ST1Q99999 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GAL3ST1Q99999 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GAL3ST1Q99999 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GAL3ST1Q99999 JPH2-202ENST00000372980 4787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GAL3ST1Q99999 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GAL3ST1Q99999 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GAL3ST1Q99999 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GAL3ST1Q99999 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GAL3ST1Q99999 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GAL3ST1Q99999 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GAL3ST1Q99999 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GAL3ST1Q99999 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GAL3ST1Q99999 ACTN4-201ENST00000252699 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GAL3ST1Q99999 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GAL3ST1Q99999 SH3RF1-201ENST00000284637 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GAL3ST1Q99999 CLIP4-201ENST00000320081 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GAL3ST1Q99999 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GAL3ST1Q99999 APBA2-207ENST00000558402 4031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GAL3ST1Q99999 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.8 ms