Protein–RNA interactions for Protein: Q99865

SPIN2A, Spindlin-2A, humanhuman

Predictions only

Length 258 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPIN2AQ99865 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SPIN2AQ99865 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SPIN2AQ99865 STK35-201ENST00000381482 6685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SPIN2AQ99865 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SPIN2AQ99865 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SPIN2AQ99865 XKR7-201ENST00000562532 7844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SPIN2AQ99865 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SPIN2AQ99865 ANKFY1-202ENST00000570535 6458 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SPIN2AQ99865 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SPIN2AQ99865 PAPD5-202ENST00000436909 4635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SPIN2AQ99865 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SPIN2AQ99865 SUFU-202ENST00000369902 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SPIN2AQ99865 CRTC3-202ENST00000420329 5209 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SPIN2AQ99865 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SPIN2AQ99865 MAP6-202ENST00000434603 4329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SPIN2AQ99865 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SPIN2AQ99865 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SPIN2AQ99865 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SPIN2AQ99865 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SPIN2AQ99865 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SPIN2AQ99865 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SPIN2AQ99865 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SPIN2AQ99865 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SPIN2AQ99865 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SPIN2AQ99865 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
SPIN2AQ99865 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SPIN2AQ99865 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SPIN2AQ99865 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SPIN2AQ99865 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SPIN2AQ99865 PCDHA12-201ENST00000398631 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SPIN2AQ99865 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SPIN2AQ99865 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SPIN2AQ99865 PLXND1-201ENST00000324093 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SPIN2AQ99865 PITPNC1-203ENST00000580974 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SPIN2AQ99865 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SPIN2AQ99865 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SPIN2AQ99865 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SPIN2AQ99865 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SPIN2AQ99865 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SPIN2AQ99865 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SPIN2AQ99865 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SPIN2AQ99865 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SPIN2AQ99865 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SPIN2AQ99865 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SPIN2AQ99865 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
SPIN2AQ99865 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SPIN2AQ99865 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SPIN2AQ99865 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SPIN2AQ99865 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SPIN2AQ99865 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SPIN2AQ99865 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SPIN2AQ99865 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SPIN2AQ99865 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SPIN2AQ99865 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SPIN2AQ99865 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SPIN2AQ99865 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SPIN2AQ99865 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SPIN2AQ99865 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
SPIN2AQ99865 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
SPIN2AQ99865 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SPIN2AQ99865 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SPIN2AQ99865 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SPIN2AQ99865 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
SPIN2AQ99865 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SPIN2AQ99865 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
SPIN2AQ99865 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SPIN2AQ99865 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SPIN2AQ99865 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SPIN2AQ99865 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SPIN2AQ99865 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SPIN2AQ99865 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SPIN2AQ99865 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SPIN2AQ99865 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SPIN2AQ99865 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SPIN2AQ99865 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SPIN2AQ99865 ADAMTS18-201ENST00000282849 5913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SPIN2AQ99865 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SPIN2AQ99865 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SPIN2AQ99865 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SPIN2AQ99865 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SPIN2AQ99865 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SPIN2AQ99865 CTDSP2-201ENST00000398073 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SPIN2AQ99865 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SPIN2AQ99865 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SPIN2AQ99865 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SPIN2AQ99865 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SPIN2AQ99865 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SPIN2AQ99865 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SPIN2AQ99865 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SPIN2AQ99865 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SPIN2AQ99865 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SPIN2AQ99865 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SPIN2AQ99865 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
SPIN2AQ99865 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SPIN2AQ99865 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SPIN2AQ99865 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
SPIN2AQ99865 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SPIN2AQ99865 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SPIN2AQ99865 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SPIN2AQ99865 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.3 ms