Protein–RNA interactions for Protein: Q96S38

RPS6KC1, Ribosomal protein S6 kinase delta-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,066 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS6KC1Q96S38 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
RPS6KC1Q96S38 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
RPS6KC1Q96S38 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
RPS6KC1Q96S38 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC19.89■□□□□ 0.77
RPS6KC1Q96S38 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
RPS6KC1Q96S38 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
RPS6KC1Q96S38 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
RPS6KC1Q96S38 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC19.89■□□□□ 0.77
RPS6KC1Q96S38 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
RPS6KC1Q96S38 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
RPS6KC1Q96S38 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC19.89■□□□□ 0.77
RPS6KC1Q96S38 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
RPS6KC1Q96S38 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
RPS6KC1Q96S38 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
RPS6KC1Q96S38 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
RPS6KC1Q96S38 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
RPS6KC1Q96S38 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
RPS6KC1Q96S38 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
RPS6KC1Q96S38 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
RPS6KC1Q96S38 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC19.88■□□□□ 0.77
RPS6KC1Q96S38 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
RPS6KC1Q96S38 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
RPS6KC1Q96S38 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
RPS6KC1Q96S38 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
RPS6KC1Q96S38 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
RPS6KC1Q96S38 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
RPS6KC1Q96S38 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
RPS6KC1Q96S38 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
RPS6KC1Q96S38 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
RPS6KC1Q96S38 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
RPS6KC1Q96S38 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
RPS6KC1Q96S38 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
RPS6KC1Q96S38 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
RPS6KC1Q96S38 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
RPS6KC1Q96S38 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
RPS6KC1Q96S38 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
RPS6KC1Q96S38 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
RPS6KC1Q96S38 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
RPS6KC1Q96S38 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
RPS6KC1Q96S38 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
RPS6KC1Q96S38 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
RPS6KC1Q96S38 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
RPS6KC1Q96S38 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
RPS6KC1Q96S38 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
RPS6KC1Q96S38 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
RPS6KC1Q96S38 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
RPS6KC1Q96S38 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
RPS6KC1Q96S38 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
RPS6KC1Q96S38 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
RPS6KC1Q96S38 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
RPS6KC1Q96S38 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC19.87■□□□□ 0.77
RPS6KC1Q96S38 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
RPS6KC1Q96S38 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
RPS6KC1Q96S38 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
RPS6KC1Q96S38 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC19.87■□□□□ 0.77
RPS6KC1Q96S38 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
RPS6KC1Q96S38 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
RPS6KC1Q96S38 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
RPS6KC1Q96S38 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
RPS6KC1Q96S38 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
RPS6KC1Q96S38 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
RPS6KC1Q96S38 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
RPS6KC1Q96S38 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
RPS6KC1Q96S38 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC19.87■□□□□ 0.77
RPS6KC1Q96S38 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC19.87■□□□□ 0.77
RPS6KC1Q96S38 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
RPS6KC1Q96S38 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
RPS6KC1Q96S38 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
RPS6KC1Q96S38 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
RPS6KC1Q96S38 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
RPS6KC1Q96S38 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
RPS6KC1Q96S38 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
RPS6KC1Q96S38 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
RPS6KC1Q96S38 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
RPS6KC1Q96S38 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
RPS6KC1Q96S38 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
RPS6KC1Q96S38 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
RPS6KC1Q96S38 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
RPS6KC1Q96S38 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
RPS6KC1Q96S38 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
RPS6KC1Q96S38 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
RPS6KC1Q96S38 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
RPS6KC1Q96S38 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC19.86■□□□□ 0.77
RPS6KC1Q96S38 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.86■□□□□ 0.77
RPS6KC1Q96S38 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
RPS6KC1Q96S38 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
RPS6KC1Q96S38 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC19.86■□□□□ 0.77
RPS6KC1Q96S38 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
RPS6KC1Q96S38 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
RPS6KC1Q96S38 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
RPS6KC1Q96S38 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
RPS6KC1Q96S38 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC19.86■□□□□ 0.77
RPS6KC1Q96S38 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
RPS6KC1Q96S38 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
RPS6KC1Q96S38 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
RPS6KC1Q96S38 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
RPS6KC1Q96S38 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
RPS6KC1Q96S38 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
RPS6KC1Q96S38 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
RPS6KC1Q96S38 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.1 ms