Protein–RNA interactions for Protein: Q96Q91

SLC4A9, Anion exchange protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 983 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC4A9Q96Q91 AL122058.1-202ENST00000426580 252 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SLC4A9Q96Q91 MCF2L-AS1-201ENST00000446789 712 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SLC4A9Q96Q91 RPS27L-204ENST00000455271 923 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SLC4A9Q96Q91 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SLC4A9Q96Q91 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SLC4A9Q96Q91 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SLC4A9Q96Q91 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
SLC4A9Q96Q91 GPX3-209ENST00000614343 1478 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SLC4A9Q96Q91 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SLC4A9Q96Q91 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SLC4A9Q96Q91 PDE9A-205ENST00000349112 1616 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SLC4A9Q96Q91 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SLC4A9Q96Q91 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SLC4A9Q96Q91 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SLC4A9Q96Q91 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SLC4A9Q96Q91 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SLC4A9Q96Q91 NECTIN1-202ENST00000340882 1059 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SLC4A9Q96Q91 RPL36-201ENST00000347512 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SLC4A9Q96Q91 TRIM36-203ENST00000379618 693 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SLC4A9Q96Q91 RNA5SP416-201ENST00000516838 111 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
SLC4A9Q96Q91 MRPL49-203ENST00000526171 501 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SLC4A9Q96Q91 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SLC4A9Q96Q91 LINC01842-201ENST00000588275 768 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SLC4A9Q96Q91 SDCCAG3P1-201ENST00000589292 1150 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
SLC4A9Q96Q91 AL022328.2-201ENST00000608016 640 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SLC4A9Q96Q91 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SLC4A9Q96Q91 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SLC4A9Q96Q91 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SLC4A9Q96Q91 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SLC4A9Q96Q91 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SLC4A9Q96Q91 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SLC4A9Q96Q91 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SLC4A9Q96Q91 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SLC4A9Q96Q91 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SLC4A9Q96Q91 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SLC4A9Q96Q91 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SLC4A9Q96Q91 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SLC4A9Q96Q91 FCN1-201ENST00000371806 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SLC4A9Q96Q91 MRPS16-201ENST00000372940 866 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SLC4A9Q96Q91 C6orf48-203ENST00000375638 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SLC4A9Q96Q91 C6orf48-207ENST00000375642 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SLC4A9Q96Q91 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
SLC4A9Q96Q91 PLA2G12A-202ENST00000502283 1189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SLC4A9Q96Q91 AP005019.1-201ENST00000545254 664 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SLC4A9Q96Q91 CHMP1A-208ENST00000550102 803 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SLC4A9Q96Q91 AC130456.4-201ENST00000568635 665 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SLC4A9Q96Q91 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SLC4A9Q96Q91 AL022326.1-202ENST00000641533 845 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
SLC4A9Q96Q91 LINC02138-201ENST00000378340 1326 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SLC4A9Q96Q91 FNDC8-201ENST00000158009 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SLC4A9Q96Q91 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SLC4A9Q96Q91 LINC00894-202ENST00000425602 1597 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SLC4A9Q96Q91 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SLC4A9Q96Q91 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SLC4A9Q96Q91 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
SLC4A9Q96Q91 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SLC4A9Q96Q91 GSTZ1-202ENST00000349555 867 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SLC4A9Q96Q91 TMEM59-202ENST00000371337 600 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SLC4A9Q96Q91 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SLC4A9Q96Q91 TNNT3-203ENST00000381557 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SLC4A9Q96Q91 GNB2-207ENST00000427895 1146 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SLC4A9Q96Q91 ZNF295-AS1-202ENST00000429739 783 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SLC4A9Q96Q91 DNAJB3-201ENST00000446806 729 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
SLC4A9Q96Q91 LINC00237-202ENST00000455890 1220 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SLC4A9Q96Q91 LINC02123-201ENST00000514869 885 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SLC4A9Q96Q91 ATP6V0D1-203ENST00000540149 1262 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SLC4A9Q96Q91 AC092718.3-202ENST00000564536 1032 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SLC4A9Q96Q91 DHRS7-212ENST00000611054 1321 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SLC4A9Q96Q91 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SLC4A9Q96Q91 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SLC4A9Q96Q91 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SLC4A9Q96Q91 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SLC4A9Q96Q91 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SLC4A9Q96Q91 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SLC4A9Q96Q91 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SLC4A9Q96Q91 LMCD1-204ENST00000426878 1431 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SLC4A9Q96Q91 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
SLC4A9Q96Q91 TMEM219-201ENST00000279396 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SLC4A9Q96Q91 ESR1-204ENST00000406599 1251 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SLC4A9Q96Q91 DNAJB3-202ENST00000449667 1266 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
SLC4A9Q96Q91 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SLC4A9Q96Q91 MSRA-206ENST00000521209 814 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SLC4A9Q96Q91 LINC01413-201ENST00000564843 772 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SLC4A9Q96Q91 AC064836.3-201ENST00000607928 673 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
SLC4A9Q96Q91 NXNL2-205ENST00000618633 739 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SLC4A9Q96Q91 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SLC4A9Q96Q91 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SLC4A9Q96Q91 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SLC4A9Q96Q91 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SLC4A9Q96Q91 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SLC4A9Q96Q91 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SLC4A9Q96Q91 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
SLC4A9Q96Q91 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SLC4A9Q96Q91 DBNL-213ENST00000452943 1513 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SLC4A9Q96Q91 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SLC4A9Q96Q91 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SLC4A9Q96Q91 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SLC4A9Q96Q91 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SLC4A9Q96Q91 ZNF517-202ENST00000525105 1383 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SLC4A9Q96Q91 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.2 ms