Protein–RNA interactions for Protein: Q96Q05

TRAPPC9, Trafficking protein particle complex subunit 9, humanhuman

Predictions only

Length 1,148 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC9Q96Q05 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TRAPPC9Q96Q05 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TRAPPC9Q96Q05 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TRAPPC9Q96Q05 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
TRAPPC9Q96Q05 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
TRAPPC9Q96Q05 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
TRAPPC9Q96Q05 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TRAPPC9Q96Q05 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
TRAPPC9Q96Q05 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
TRAPPC9Q96Q05 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TRAPPC9Q96Q05 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TRAPPC9Q96Q05 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TRAPPC9Q96Q05 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TRAPPC9Q96Q05 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TRAPPC9Q96Q05 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
TRAPPC9Q96Q05 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TRAPPC9Q96Q05 CLCN2-205ENST00000457512 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TRAPPC9Q96Q05 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TRAPPC9Q96Q05 FNDC5-201ENST00000373471 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TRAPPC9Q96Q05 TMEM119-201ENST00000392806 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TRAPPC9Q96Q05 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TRAPPC9Q96Q05 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TRAPPC9Q96Q05 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TRAPPC9Q96Q05 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TRAPPC9Q96Q05 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TRAPPC9Q96Q05 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TRAPPC9Q96Q05 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TRAPPC9Q96Q05 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TRAPPC9Q96Q05 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TRAPPC9Q96Q05 PTPN5-202ENST00000396166 2299 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TRAPPC9Q96Q05 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TRAPPC9Q96Q05 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TRAPPC9Q96Q05 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TRAPPC9Q96Q05 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
TRAPPC9Q96Q05 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TRAPPC9Q96Q05 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TRAPPC9Q96Q05 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TRAPPC9Q96Q05 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TRAPPC9Q96Q05 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TRAPPC9Q96Q05 KIAA1586-203ENST00000545356 2883 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TRAPPC9Q96Q05 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TRAPPC9Q96Q05 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TRAPPC9Q96Q05 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TRAPPC9Q96Q05 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TRAPPC9Q96Q05 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TRAPPC9Q96Q05 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TRAPPC9Q96Q05 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TRAPPC9Q96Q05 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TRAPPC9Q96Q05 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TRAPPC9Q96Q05 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TRAPPC9Q96Q05 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TRAPPC9Q96Q05 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
TRAPPC9Q96Q05 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
TRAPPC9Q96Q05 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
TRAPPC9Q96Q05 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
TRAPPC9Q96Q05 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
TRAPPC9Q96Q05 CDH6-205ENST00000514738 2569 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
TRAPPC9Q96Q05 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
TRAPPC9Q96Q05 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TRAPPC9Q96Q05 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TRAPPC9Q96Q05 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TRAPPC9Q96Q05 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TRAPPC9Q96Q05 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
TRAPPC9Q96Q05 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
TRAPPC9Q96Q05 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
TRAPPC9Q96Q05 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
TRAPPC9Q96Q05 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.08■□□□□ 0.48
TRAPPC9Q96Q05 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
TRAPPC9Q96Q05 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
TRAPPC9Q96Q05 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TRAPPC9Q96Q05 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
TRAPPC9Q96Q05 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TRAPPC9Q96Q05 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TRAPPC9Q96Q05 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TRAPPC9Q96Q05 AL512625.1-201ENST00000305709 2541 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TRAPPC9Q96Q05 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TRAPPC9Q96Q05 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TRAPPC9Q96Q05 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
TRAPPC9Q96Q05 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TRAPPC9Q96Q05 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TRAPPC9Q96Q05 DAGLB-204ENST00000436575 2385 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
TRAPPC9Q96Q05 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TRAPPC9Q96Q05 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
TRAPPC9Q96Q05 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TRAPPC9Q96Q05 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
TRAPPC9Q96Q05 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TRAPPC9Q96Q05 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TRAPPC9Q96Q05 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TRAPPC9Q96Q05 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TRAPPC9Q96Q05 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TRAPPC9Q96Q05 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TRAPPC9Q96Q05 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TRAPPC9Q96Q05 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TRAPPC9Q96Q05 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TRAPPC9Q96Q05 CTNNB1-210ENST00000453024 2841 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TRAPPC9Q96Q05 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TRAPPC9Q96Q05 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TRAPPC9Q96Q05 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TRAPPC9Q96Q05 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TRAPPC9Q96Q05 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.9 ms