Protein–RNA interactions for Protein: Q96JN2

CCDC136, Coiled-coil domain-containing protein 136, humanhuman

Predictions only

Length 1,154 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC136Q96JN2 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCDC136Q96JN2 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCDC136Q96JN2 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCDC136Q96JN2 SBSPON-201ENST00000297354 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCDC136Q96JN2 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCDC136Q96JN2 RECK-201ENST00000377966 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCDC136Q96JN2 CTNNB1-210ENST00000453024 2841 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCDC136Q96JN2 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCDC136Q96JN2 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCDC136Q96JN2 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCDC136Q96JN2 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCDC136Q96JN2 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCDC136Q96JN2 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCDC136Q96JN2 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCDC136Q96JN2 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCDC136Q96JN2 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCDC136Q96JN2 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCDC136Q96JN2 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCDC136Q96JN2 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
CCDC136Q96JN2 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
CCDC136Q96JN2 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
CCDC136Q96JN2 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
CCDC136Q96JN2 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCDC136Q96JN2 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCDC136Q96JN2 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCDC136Q96JN2 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCDC136Q96JN2 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCDC136Q96JN2 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCDC136Q96JN2 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCDC136Q96JN2 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCDC136Q96JN2 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCDC136Q96JN2 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCDC136Q96JN2 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCDC136Q96JN2 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCDC136Q96JN2 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCDC136Q96JN2 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCDC136Q96JN2 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCDC136Q96JN2 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCDC136Q96JN2 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCDC136Q96JN2 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCDC136Q96JN2 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCDC136Q96JN2 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCDC136Q96JN2 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCDC136Q96JN2 ST6GALNAC6-202ENST00000373141 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCDC136Q96JN2 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCDC136Q96JN2 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCDC136Q96JN2 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCDC136Q96JN2 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCDC136Q96JN2 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCDC136Q96JN2 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCDC136Q96JN2 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCDC136Q96JN2 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCDC136Q96JN2 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCDC136Q96JN2 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCDC136Q96JN2 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCDC136Q96JN2 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCDC136Q96JN2 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCDC136Q96JN2 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCDC136Q96JN2 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
CCDC136Q96JN2 FAM181B-201ENST00000329203 3924 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCDC136Q96JN2 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCDC136Q96JN2 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCDC136Q96JN2 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCDC136Q96JN2 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCDC136Q96JN2 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCDC136Q96JN2 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCDC136Q96JN2 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCDC136Q96JN2 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCDC136Q96JN2 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCDC136Q96JN2 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCDC136Q96JN2 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCDC136Q96JN2 HASPIN-201ENST00000325418 2797 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCDC136Q96JN2 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCDC136Q96JN2 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCDC136Q96JN2 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCDC136Q96JN2 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
CCDC136Q96JN2 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCDC136Q96JN2 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCDC136Q96JN2 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCDC136Q96JN2 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCDC136Q96JN2 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCDC136Q96JN2 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
CCDC136Q96JN2 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
CCDC136Q96JN2 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCDC136Q96JN2 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCDC136Q96JN2 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCDC136Q96JN2 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCDC136Q96JN2 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCDC136Q96JN2 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
CCDC136Q96JN2 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCDC136Q96JN2 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCDC136Q96JN2 RAB1A-203ENST00000409784 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCDC136Q96JN2 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCDC136Q96JN2 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCDC136Q96JN2 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCDC136Q96JN2 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCDC136Q96JN2 NPRL3-201ENST00000399953 2784 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCDC136Q96JN2 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCDC136Q96JN2 CDH23-205ENST00000398809 4533 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCDC136Q96JN2 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.2 ms