Protein–RNA interactions for Protein: Q96J87

CELF6, CUGBP Elav-like family member 6, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CELF6Q96J87 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CELF6Q96J87 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CELF6Q96J87 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
CELF6Q96J87 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CELF6Q96J87 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
CELF6Q96J87 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CELF6Q96J87 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CELF6Q96J87 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CELF6Q96J87 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CELF6Q96J87 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
CELF6Q96J87 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
CELF6Q96J87 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
CELF6Q96J87 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC18.67■□□□□ 0.58
CELF6Q96J87 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC18.67■□□□□ 0.58
CELF6Q96J87 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
CELF6Q96J87 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
CELF6Q96J87 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
CELF6Q96J87 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
CELF6Q96J87 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
CELF6Q96J87 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
CELF6Q96J87 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CELF6Q96J87 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC18.67■□□□□ 0.58
CELF6Q96J87 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
CELF6Q96J87 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC18.67■□□□□ 0.58
CELF6Q96J87 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CELF6Q96J87 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CELF6Q96J87 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
CELF6Q96J87 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
CELF6Q96J87 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CELF6Q96J87 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CELF6Q96J87 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CELF6Q96J87 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CELF6Q96J87 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
CELF6Q96J87 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
CELF6Q96J87 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
CELF6Q96J87 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
CELF6Q96J87 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
CELF6Q96J87 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
CELF6Q96J87 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
CELF6Q96J87 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
CELF6Q96J87 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
CELF6Q96J87 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
CELF6Q96J87 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
CELF6Q96J87 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
CELF6Q96J87 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
CELF6Q96J87 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC18.66■□□□□ 0.58
CELF6Q96J87 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
CELF6Q96J87 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
CELF6Q96J87 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
CELF6Q96J87 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
CELF6Q96J87 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
CELF6Q96J87 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
CELF6Q96J87 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
CELF6Q96J87 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
CELF6Q96J87 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
CELF6Q96J87 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
CELF6Q96J87 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
CELF6Q96J87 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
CELF6Q96J87 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
CELF6Q96J87 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
CELF6Q96J87 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
CELF6Q96J87 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
CELF6Q96J87 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
CELF6Q96J87 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
CELF6Q96J87 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
CELF6Q96J87 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
CELF6Q96J87 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
CELF6Q96J87 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
CELF6Q96J87 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC18.65■□□□□ 0.58
CELF6Q96J87 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
CELF6Q96J87 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
CELF6Q96J87 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
CELF6Q96J87 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
CELF6Q96J87 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
CELF6Q96J87 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC18.65■□□□□ 0.58
CELF6Q96J87 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC18.65■□□□□ 0.58
CELF6Q96J87 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC18.65■□□□□ 0.58
CELF6Q96J87 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC18.65■□□□□ 0.58
CELF6Q96J87 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC18.65■□□□□ 0.58
CELF6Q96J87 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC18.65■□□□□ 0.58
CELF6Q96J87 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
CELF6Q96J87 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
CELF6Q96J87 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
CELF6Q96J87 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
CELF6Q96J87 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
CELF6Q96J87 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
CELF6Q96J87 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
CELF6Q96J87 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
CELF6Q96J87 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
CELF6Q96J87 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
CELF6Q96J87 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.58
CELF6Q96J87 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.58
CELF6Q96J87 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
CELF6Q96J87 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
CELF6Q96J87 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
CELF6Q96J87 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
CELF6Q96J87 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
CELF6Q96J87 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
CELF6Q96J87 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
CELF6Q96J87 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.4 ms