Protein–RNA interactions for Protein: Q96EB6

SIRT1, NAD-dependent protein deacetylase sirtuin-1, humanhuman

Predictions only

Length 747 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIRT1Q96EB6 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SIRT1Q96EB6 AC034243.1-201ENST00000520838 587 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SIRT1Q96EB6 AP000442.1-201ENST00000533552 769 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SIRT1Q96EB6 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SIRT1Q96EB6 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SIRT1Q96EB6 LY6E-207ENST00000520466 1419 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SIRT1Q96EB6 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SIRT1Q96EB6 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
SIRT1Q96EB6 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SIRT1Q96EB6 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SIRT1Q96EB6 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SIRT1Q96EB6 MRPS16-201ENST00000372940 866 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SIRT1Q96EB6 CST3-201ENST00000376925 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SIRT1Q96EB6 ODF3B-204ENST00000405135 917 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SIRT1Q96EB6 ANKRD54-202ENST00000406423 954 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SIRT1Q96EB6 RFX3-AS1-201ENST00000423112 552 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SIRT1Q96EB6 TMUB1-204ENST00000476627 882 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SIRT1Q96EB6 HS6ST1P1-201ENST00000481504 1234 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
SIRT1Q96EB6 LMX1B-203ENST00000526117 1195 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SIRT1Q96EB6 AC010327.4-202ENST00000591484 748 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
SIRT1Q96EB6 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SIRT1Q96EB6 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SIRT1Q96EB6 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SIRT1Q96EB6 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
SIRT1Q96EB6 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.59
SIRT1Q96EB6 PSMA7-201ENST00000370858 925 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
SIRT1Q96EB6 MCFD2-205ENST00000409218 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
SIRT1Q96EB6 HOXB-AS4-202ENST00000480386 566 ntTSL 4 BASIC24.95■■□□□ 1.58
SIRT1Q96EB6 AC027117.2-201ENST00000522768 510 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
SIRT1Q96EB6 AL589182.2-201ENST00000619332 1049 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
SIRT1Q96EB6 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SIRT1Q96EB6 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC24.95■■□□□ 1.58
SIRT1Q96EB6 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
SIRT1Q96EB6 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
SIRT1Q96EB6 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SIRT1Q96EB6 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SIRT1Q96EB6 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SIRT1Q96EB6 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SIRT1Q96EB6 HFE2-204ENST00000475797 1381 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SIRT1Q96EB6 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SIRT1Q96EB6 CGREF1-201ENST00000260595 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SIRT1Q96EB6 DUSP12-201ENST00000367943 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SIRT1Q96EB6 TSTD1-203ENST00000368024 457 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SIRT1Q96EB6 TMEM59-202ENST00000371337 600 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SIRT1Q96EB6 TNNT3-203ENST00000381557 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SIRT1Q96EB6 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SIRT1Q96EB6 HNRNPA1P28-201ENST00000424481 961 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
SIRT1Q96EB6 MVB12A-211ENST00000529939 1091 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SIRT1Q96EB6 AC126696.3-201ENST00000563993 575 ntTSL 4 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SIRT1Q96EB6 AC005256.1-202ENST00000592934 415 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SIRT1Q96EB6 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SIRT1Q96EB6 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SIRT1Q96EB6 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SIRT1Q96EB6 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
SIRT1Q96EB6 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SIRT1Q96EB6 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SIRT1Q96EB6 AL353593.2-201ENST00000602529 1483 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
SIRT1Q96EB6 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SIRT1Q96EB6 SRSF2-205ENST00000508921 1390 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SIRT1Q96EB6 AC138969.1-205ENST00000381497 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SIRT1Q96EB6 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SIRT1Q96EB6 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SIRT1Q96EB6 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SIRT1Q96EB6 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SIRT1Q96EB6 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SIRT1Q96EB6 AL355310.2-201ENST00000369843 688 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SIRT1Q96EB6 URGCP-206ENST00000446958 365 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SIRT1Q96EB6 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SIRT1Q96EB6 ARMC7-204ENST00000582136 1204 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SIRT1Q96EB6 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SIRT1Q96EB6 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SIRT1Q96EB6 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SIRT1Q96EB6 MOV10L1-203ENST00000395852 1422 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SIRT1Q96EB6 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SIRT1Q96EB6 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SIRT1Q96EB6 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SIRT1Q96EB6 CRELD1-206ENST00000452070 1778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SIRT1Q96EB6 RGS11-203ENST00000359740 1371 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SIRT1Q96EB6 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SIRT1Q96EB6 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SIRT1Q96EB6 KNOP1-205ENST00000568230 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SIRT1Q96EB6 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SIRT1Q96EB6 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SIRT1Q96EB6 DHDH-201ENST00000221403 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SIRT1Q96EB6 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SIRT1Q96EB6 MOB1B-202ENST00000396051 1107 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SIRT1Q96EB6 AL121672.1-201ENST00000439423 1181 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SIRT1Q96EB6 AC097532.1-201ENST00000440802 322 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SIRT1Q96EB6 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SIRT1Q96EB6 AC136632.2-201ENST00000512891 861 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
SIRT1Q96EB6 DHDH-204ENST00000523250 634 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SIRT1Q96EB6 AC002347.1-201ENST00000569543 541 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
SIRT1Q96EB6 MIR3687-2-201ENST00000577708 61 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
SIRT1Q96EB6 SEC11C-205ENST00000588875 718 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SIRT1Q96EB6 MIR3687-1-201ENST00000614492 61 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
SIRT1Q96EB6 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SIRT1Q96EB6 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SIRT1Q96EB6 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SIRT1Q96EB6 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SIRT1Q96EB6 NOX4-207ENST00000525196 1555 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.4 ms