Protein–RNA interactions for Protein: Q96CM4

NXNL1, Nucleoredoxin-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NXNL1Q96CM4 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
NXNL1Q96CM4 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
NXNL1Q96CM4 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
NXNL1Q96CM4 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
NXNL1Q96CM4 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
NXNL1Q96CM4 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
NXNL1Q96CM4 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
NXNL1Q96CM4 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
NXNL1Q96CM4 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
NXNL1Q96CM4 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
NXNL1Q96CM4 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
NXNL1Q96CM4 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
NXNL1Q96CM4 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
NXNL1Q96CM4 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
NXNL1Q96CM4 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
NXNL1Q96CM4 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
NXNL1Q96CM4 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
NXNL1Q96CM4 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
NXNL1Q96CM4 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
NXNL1Q96CM4 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
NXNL1Q96CM4 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
NXNL1Q96CM4 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
NXNL1Q96CM4 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
NXNL1Q96CM4 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
NXNL1Q96CM4 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
NXNL1Q96CM4 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
NXNL1Q96CM4 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
NXNL1Q96CM4 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
NXNL1Q96CM4 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
NXNL1Q96CM4 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
NXNL1Q96CM4 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
NXNL1Q96CM4 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
NXNL1Q96CM4 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
NXNL1Q96CM4 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
NXNL1Q96CM4 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
NXNL1Q96CM4 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
NXNL1Q96CM4 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
NXNL1Q96CM4 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
NXNL1Q96CM4 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
NXNL1Q96CM4 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
NXNL1Q96CM4 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
NXNL1Q96CM4 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
NXNL1Q96CM4 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
NXNL1Q96CM4 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
NXNL1Q96CM4 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
NXNL1Q96CM4 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
NXNL1Q96CM4 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC17.95■□□□□ 0.46
NXNL1Q96CM4 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
NXNL1Q96CM4 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
NXNL1Q96CM4 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
NXNL1Q96CM4 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
NXNL1Q96CM4 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
NXNL1Q96CM4 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
NXNL1Q96CM4 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
NXNL1Q96CM4 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
NXNL1Q96CM4 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
NXNL1Q96CM4 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
NXNL1Q96CM4 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
NXNL1Q96CM4 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
NXNL1Q96CM4 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
NXNL1Q96CM4 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
NXNL1Q96CM4 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
NXNL1Q96CM4 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
NXNL1Q96CM4 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
NXNL1Q96CM4 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
NXNL1Q96CM4 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
NXNL1Q96CM4 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
NXNL1Q96CM4 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
NXNL1Q96CM4 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
NXNL1Q96CM4 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
NXNL1Q96CM4 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
NXNL1Q96CM4 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
NXNL1Q96CM4 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
NXNL1Q96CM4 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
NXNL1Q96CM4 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
NXNL1Q96CM4 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
NXNL1Q96CM4 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
NXNL1Q96CM4 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
NXNL1Q96CM4 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
NXNL1Q96CM4 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
NXNL1Q96CM4 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
NXNL1Q96CM4 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
NXNL1Q96CM4 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
NXNL1Q96CM4 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
NXNL1Q96CM4 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
NXNL1Q96CM4 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
NXNL1Q96CM4 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
NXNL1Q96CM4 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
NXNL1Q96CM4 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
NXNL1Q96CM4 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
NXNL1Q96CM4 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
NXNL1Q96CM4 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
NXNL1Q96CM4 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
NXNL1Q96CM4 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
NXNL1Q96CM4 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
NXNL1Q96CM4 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
NXNL1Q96CM4 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
NXNL1Q96CM4 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
NXNL1Q96CM4 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
NXNL1Q96CM4 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.7 ms