Protein–RNA interactions for Protein: Q92837

FRAT1, Proto-oncogene FRAT1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 279 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FRAT1Q92837 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
FRAT1Q92837 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
FRAT1Q92837 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
FRAT1Q92837 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
FRAT1Q92837 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
FRAT1Q92837 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
FRAT1Q92837 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
FRAT1Q92837 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
FRAT1Q92837 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
FRAT1Q92837 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
FRAT1Q92837 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
FRAT1Q92837 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
FRAT1Q92837 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
FRAT1Q92837 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
FRAT1Q92837 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
FRAT1Q92837 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
FRAT1Q92837 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
FRAT1Q92837 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
FRAT1Q92837 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
FRAT1Q92837 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
FRAT1Q92837 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
FRAT1Q92837 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
FRAT1Q92837 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
FRAT1Q92837 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
FRAT1Q92837 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
FRAT1Q92837 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
FRAT1Q92837 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
FRAT1Q92837 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
FRAT1Q92837 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
FRAT1Q92837 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
FRAT1Q92837 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
FRAT1Q92837 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
FRAT1Q92837 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
FRAT1Q92837 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
FRAT1Q92837 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
FRAT1Q92837 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
FRAT1Q92837 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
FRAT1Q92837 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
FRAT1Q92837 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
FRAT1Q92837 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
FRAT1Q92837 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
FRAT1Q92837 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
FRAT1Q92837 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
FRAT1Q92837 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
FRAT1Q92837 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
FRAT1Q92837 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
FRAT1Q92837 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
FRAT1Q92837 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
FRAT1Q92837 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
FRAT1Q92837 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
FRAT1Q92837 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
FRAT1Q92837 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
FRAT1Q92837 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
FRAT1Q92837 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
FRAT1Q92837 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
FRAT1Q92837 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
FRAT1Q92837 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
FRAT1Q92837 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
FRAT1Q92837 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
FRAT1Q92837 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
FRAT1Q92837 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
FRAT1Q92837 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
FRAT1Q92837 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
FRAT1Q92837 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
FRAT1Q92837 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
FRAT1Q92837 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
FRAT1Q92837 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
FRAT1Q92837 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC23.41■■□□□ 1.34
FRAT1Q92837 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
FRAT1Q92837 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
FRAT1Q92837 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
FRAT1Q92837 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
FRAT1Q92837 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
FRAT1Q92837 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
FRAT1Q92837 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
FRAT1Q92837 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
FRAT1Q92837 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
FRAT1Q92837 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
FRAT1Q92837 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
FRAT1Q92837 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
FRAT1Q92837 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
FRAT1Q92837 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
FRAT1Q92837 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
FRAT1Q92837 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
FRAT1Q92837 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
FRAT1Q92837 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
FRAT1Q92837 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
FRAT1Q92837 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
FRAT1Q92837 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
FRAT1Q92837 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
FRAT1Q92837 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
FRAT1Q92837 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
FRAT1Q92837 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
FRAT1Q92837 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
FRAT1Q92837 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
FRAT1Q92837 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
FRAT1Q92837 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
FRAT1Q92837 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
FRAT1Q92837 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
FRAT1Q92837 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.6 ms