Protein–RNA interactions for Protein: Q92572

AP3S1, AP-3 complex subunit sigma-1, humanhuman

Predictions only

Length 193 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP3S1Q92572 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
AP3S1Q92572 KAZN-201ENST00000361144 3838 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
AP3S1Q92572 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
AP3S1Q92572 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
AP3S1Q92572 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
AP3S1Q92572 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
AP3S1Q92572 FYCO1-205ENST00000535325 8578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
AP3S1Q92572 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
AP3S1Q92572 AEBP1-206ENST00000450684 2571 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
AP3S1Q92572 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
AP3S1Q92572 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
AP3S1Q92572 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
AP3S1Q92572 NPRL3-201ENST00000399953 2784 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
AP3S1Q92572 PRPF31-203ENST00000419967 2269 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
AP3S1Q92572 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
AP3S1Q92572 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
AP3S1Q92572 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
AP3S1Q92572 MAP4K1-201ENST00000396857 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
AP3S1Q92572 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
AP3S1Q92572 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
AP3S1Q92572 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
AP3S1Q92572 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
AP3S1Q92572 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
AP3S1Q92572 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
AP3S1Q92572 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
AP3S1Q92572 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
AP3S1Q92572 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
AP3S1Q92572 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
AP3S1Q92572 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
AP3S1Q92572 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
AP3S1Q92572 NTRK2-205ENST00000376208 8178 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
AP3S1Q92572 EWSAT1-206ENST00000558922 1725 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
AP3S1Q92572 ASTN2-205ENST00000361209 4622 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
AP3S1Q92572 PCDHA3-201ENST00000522353 5260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
AP3S1Q92572 AMN1-201ENST00000281471 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
AP3S1Q92572 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
AP3S1Q92572 CACNA1G-201ENST00000352832 7848 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
AP3S1Q92572 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
AP3S1Q92572 COL2A1-202ENST00000380518 5071 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
AP3S1Q92572 LINC00200-201ENST00000425630 2434 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
AP3S1Q92572 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
AP3S1Q92572 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
AP3S1Q92572 ZNF619-205ENST00000456778 2192 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
AP3S1Q92572 AHDC1-202ENST00000374011 6438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
AP3S1Q92572 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
AP3S1Q92572 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
AP3S1Q92572 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
AP3S1Q92572 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
AP3S1Q92572 ABCG5-201ENST00000260645 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
AP3S1Q92572 NRXN2-202ENST00000301894 3535 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
AP3S1Q92572 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
AP3S1Q92572 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
AP3S1Q92572 ADGRA1-203ENST00000607359 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
AP3S1Q92572 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
AP3S1Q92572 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
AP3S1Q92572 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
AP3S1Q92572 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
AP3S1Q92572 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
AP3S1Q92572 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
AP3S1Q92572 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC16■□□□□ 0.15
AP3S1Q92572 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
AP3S1Q92572 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
AP3S1Q92572 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
AP3S1Q92572 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
AP3S1Q92572 CNTNAP3-205ENST00000377659 2649 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
AP3S1Q92572 TMEM184A-201ENST00000297477 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
AP3S1Q92572 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
AP3S1Q92572 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
AP3S1Q92572 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
AP3S1Q92572 TMUB2-204ENST00000538716 1953 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
AP3S1Q92572 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
AP3S1Q92572 PCDHA2-201ENST00000378132 2626 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
AP3S1Q92572 SLC30A1-201ENST00000367001 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
AP3S1Q92572 ARFGAP1-201ENST00000353546 2776 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
AP3S1Q92572 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
AP3S1Q92572 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
AP3S1Q92572 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
AP3S1Q92572 MIB2-202ENST00000378708 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
AP3S1Q92572 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
AP3S1Q92572 GRAMD1A-211ENST00000599564 2825 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
AP3S1Q92572 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
AP3S1Q92572 KIF5B-201ENST00000302418 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
AP3S1Q92572 C10orf10-201ENST00000298295 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
AP3S1Q92572 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
AP3S1Q92572 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
AP3S1Q92572 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
AP3S1Q92572 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
AP3S1Q92572 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
AP3S1Q92572 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
AP3S1Q92572 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
AP3S1Q92572 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
AP3S1Q92572 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
AP3S1Q92572 PCDHA12-201ENST00000398631 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
AP3S1Q92572 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
AP3S1Q92572 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
AP3S1Q92572 ITGA3-202ENST00000320031 4888 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
AP3S1Q92572 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
AP3S1Q92572 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
AP3S1Q92572 FAM129B-201ENST00000373312 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
AP3S1Q92572 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.2 ms