Protein–RNA interactions for Protein: Q8WUD4

CCDC12, Coiled-coil domain-containing protein 12, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 166 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC12Q8WUD4 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
CCDC12Q8WUD4 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC20.95■□□□□ 0.94
CCDC12Q8WUD4 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
CCDC12Q8WUD4 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
CCDC12Q8WUD4 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC20.95■□□□□ 0.94
CCDC12Q8WUD4 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
CCDC12Q8WUD4 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC20.95■□□□□ 0.94
CCDC12Q8WUD4 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
CCDC12Q8WUD4 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
CCDC12Q8WUD4 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
CCDC12Q8WUD4 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
CCDC12Q8WUD4 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
CCDC12Q8WUD4 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
CCDC12Q8WUD4 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
CCDC12Q8WUD4 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
CCDC12Q8WUD4 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
CCDC12Q8WUD4 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
CCDC12Q8WUD4 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
CCDC12Q8WUD4 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CCDC12Q8WUD4 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
CCDC12Q8WUD4 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CCDC12Q8WUD4 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CCDC12Q8WUD4 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
CCDC12Q8WUD4 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CCDC12Q8WUD4 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
CCDC12Q8WUD4 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
CCDC12Q8WUD4 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CCDC12Q8WUD4 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CCDC12Q8WUD4 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
CCDC12Q8WUD4 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CCDC12Q8WUD4 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CCDC12Q8WUD4 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
CCDC12Q8WUD4 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
CCDC12Q8WUD4 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.94■□□□□ 0.94
CCDC12Q8WUD4 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CCDC12Q8WUD4 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CCDC12Q8WUD4 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CCDC12Q8WUD4 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
CCDC12Q8WUD4 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CCDC12Q8WUD4 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
CCDC12Q8WUD4 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
CCDC12Q8WUD4 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CCDC12Q8WUD4 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CCDC12Q8WUD4 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CCDC12Q8WUD4 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CCDC12Q8WUD4 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CCDC12Q8WUD4 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CCDC12Q8WUD4 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CCDC12Q8WUD4 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CCDC12Q8WUD4 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CCDC12Q8WUD4 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CCDC12Q8WUD4 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
CCDC12Q8WUD4 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CCDC12Q8WUD4 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
CCDC12Q8WUD4 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CCDC12Q8WUD4 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CCDC12Q8WUD4 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
CCDC12Q8WUD4 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
CCDC12Q8WUD4 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
CCDC12Q8WUD4 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
CCDC12Q8WUD4 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CCDC12Q8WUD4 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CCDC12Q8WUD4 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
CCDC12Q8WUD4 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
CCDC12Q8WUD4 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CCDC12Q8WUD4 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
CCDC12Q8WUD4 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
CCDC12Q8WUD4 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CCDC12Q8WUD4 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CCDC12Q8WUD4 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
CCDC12Q8WUD4 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CCDC12Q8WUD4 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
CCDC12Q8WUD4 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CCDC12Q8WUD4 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CCDC12Q8WUD4 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CCDC12Q8WUD4 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
CCDC12Q8WUD4 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CCDC12Q8WUD4 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
CCDC12Q8WUD4 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CCDC12Q8WUD4 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
CCDC12Q8WUD4 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
CCDC12Q8WUD4 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CCDC12Q8WUD4 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CCDC12Q8WUD4 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CCDC12Q8WUD4 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
CCDC12Q8WUD4 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
CCDC12Q8WUD4 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
CCDC12Q8WUD4 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
CCDC12Q8WUD4 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
CCDC12Q8WUD4 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CCDC12Q8WUD4 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
CCDC12Q8WUD4 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CCDC12Q8WUD4 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CCDC12Q8WUD4 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
CCDC12Q8WUD4 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
CCDC12Q8WUD4 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CCDC12Q8WUD4 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CCDC12Q8WUD4 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
CCDC12Q8WUD4 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CCDC12Q8WUD4 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.2 ms