Protein–RNA interactions for Protein: Q8NHW6

OTOS, Otospiralin, humanhuman

Predictions only

Length 89 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OTOSQ8NHW6 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
OTOSQ8NHW6 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC16.04■□□□□ 0.16
OTOSQ8NHW6 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
OTOSQ8NHW6 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
OTOSQ8NHW6 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
OTOSQ8NHW6 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
OTOSQ8NHW6 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
OTOSQ8NHW6 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
OTOSQ8NHW6 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
OTOSQ8NHW6 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
OTOSQ8NHW6 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
OTOSQ8NHW6 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
OTOSQ8NHW6 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
OTOSQ8NHW6 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
OTOSQ8NHW6 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
OTOSQ8NHW6 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
OTOSQ8NHW6 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
OTOSQ8NHW6 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
OTOSQ8NHW6 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
OTOSQ8NHW6 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
OTOSQ8NHW6 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
OTOSQ8NHW6 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
OTOSQ8NHW6 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
OTOSQ8NHW6 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
OTOSQ8NHW6 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
OTOSQ8NHW6 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
OTOSQ8NHW6 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
OTOSQ8NHW6 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
OTOSQ8NHW6 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
OTOSQ8NHW6 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
OTOSQ8NHW6 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
OTOSQ8NHW6 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
OTOSQ8NHW6 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
OTOSQ8NHW6 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
OTOSQ8NHW6 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
OTOSQ8NHW6 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
OTOSQ8NHW6 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
OTOSQ8NHW6 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
OTOSQ8NHW6 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
OTOSQ8NHW6 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
OTOSQ8NHW6 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
OTOSQ8NHW6 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
OTOSQ8NHW6 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
OTOSQ8NHW6 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
OTOSQ8NHW6 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
OTOSQ8NHW6 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
OTOSQ8NHW6 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
OTOSQ8NHW6 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
OTOSQ8NHW6 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
OTOSQ8NHW6 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
OTOSQ8NHW6 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
OTOSQ8NHW6 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
OTOSQ8NHW6 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
OTOSQ8NHW6 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
OTOSQ8NHW6 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
OTOSQ8NHW6 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
OTOSQ8NHW6 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
OTOSQ8NHW6 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
OTOSQ8NHW6 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
OTOSQ8NHW6 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
OTOSQ8NHW6 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
OTOSQ8NHW6 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
OTOSQ8NHW6 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
OTOSQ8NHW6 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
OTOSQ8NHW6 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
OTOSQ8NHW6 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
OTOSQ8NHW6 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
OTOSQ8NHW6 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
OTOSQ8NHW6 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
OTOSQ8NHW6 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
OTOSQ8NHW6 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
OTOSQ8NHW6 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
OTOSQ8NHW6 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
OTOSQ8NHW6 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
OTOSQ8NHW6 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
OTOSQ8NHW6 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
OTOSQ8NHW6 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
OTOSQ8NHW6 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
OTOSQ8NHW6 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
OTOSQ8NHW6 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
OTOSQ8NHW6 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.15
OTOSQ8NHW6 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
OTOSQ8NHW6 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
OTOSQ8NHW6 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
OTOSQ8NHW6 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
OTOSQ8NHW6 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
OTOSQ8NHW6 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
OTOSQ8NHW6 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
OTOSQ8NHW6 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
OTOSQ8NHW6 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
OTOSQ8NHW6 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
OTOSQ8NHW6 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
OTOSQ8NHW6 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
OTOSQ8NHW6 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
OTOSQ8NHW6 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
OTOSQ8NHW6 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
OTOSQ8NHW6 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
OTOSQ8NHW6 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
OTOSQ8NHW6 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
OTOSQ8NHW6 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24 ms