Protein–RNA interactions for Protein: Q8NHH9

ATL2, Atlastin-2, humanhuman

Predictions only

Length 583 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATL2Q8NHH9 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
ATL2Q8NHH9 KIRREL1-202ENST00000360089 3304 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
ATL2Q8NHH9 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
ATL2Q8NHH9 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
ATL2Q8NHH9 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
ATL2Q8NHH9 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
ATL2Q8NHH9 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
ATL2Q8NHH9 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
ATL2Q8NHH9 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
ATL2Q8NHH9 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC18.96■□□□□ 0.63
ATL2Q8NHH9 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
ATL2Q8NHH9 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
ATL2Q8NHH9 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC18.96■□□□□ 0.63
ATL2Q8NHH9 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
ATL2Q8NHH9 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
ATL2Q8NHH9 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
ATL2Q8NHH9 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
ATL2Q8NHH9 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
ATL2Q8NHH9 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
ATL2Q8NHH9 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
ATL2Q8NHH9 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
ATL2Q8NHH9 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
ATL2Q8NHH9 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
ATL2Q8NHH9 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
ATL2Q8NHH9 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
ATL2Q8NHH9 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
ATL2Q8NHH9 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ATL2Q8NHH9 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ATL2Q8NHH9 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
ATL2Q8NHH9 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
ATL2Q8NHH9 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ATL2Q8NHH9 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
ATL2Q8NHH9 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ATL2Q8NHH9 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ATL2Q8NHH9 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ATL2Q8NHH9 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
ATL2Q8NHH9 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
ATL2Q8NHH9 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
ATL2Q8NHH9 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
ATL2Q8NHH9 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
ATL2Q8NHH9 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
ATL2Q8NHH9 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ATL2Q8NHH9 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ATL2Q8NHH9 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
ATL2Q8NHH9 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ATL2Q8NHH9 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
ATL2Q8NHH9 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ATL2Q8NHH9 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
ATL2Q8NHH9 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
ATL2Q8NHH9 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ATL2Q8NHH9 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
ATL2Q8NHH9 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ATL2Q8NHH9 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ATL2Q8NHH9 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
ATL2Q8NHH9 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ATL2Q8NHH9 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ATL2Q8NHH9 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ATL2Q8NHH9 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
ATL2Q8NHH9 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ATL2Q8NHH9 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ATL2Q8NHH9 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ATL2Q8NHH9 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ATL2Q8NHH9 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ATL2Q8NHH9 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ATL2Q8NHH9 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ATL2Q8NHH9 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
ATL2Q8NHH9 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ATL2Q8NHH9 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
ATL2Q8NHH9 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ATL2Q8NHH9 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
ATL2Q8NHH9 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
ATL2Q8NHH9 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
ATL2Q8NHH9 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
ATL2Q8NHH9 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ATL2Q8NHH9 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ATL2Q8NHH9 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ATL2Q8NHH9 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ATL2Q8NHH9 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
ATL2Q8NHH9 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
ATL2Q8NHH9 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ATL2Q8NHH9 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
ATL2Q8NHH9 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
ATL2Q8NHH9 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
ATL2Q8NHH9 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ATL2Q8NHH9 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
ATL2Q8NHH9 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ATL2Q8NHH9 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ATL2Q8NHH9 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
ATL2Q8NHH9 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ATL2Q8NHH9 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ATL2Q8NHH9 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ATL2Q8NHH9 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ATL2Q8NHH9 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC18.93■□□□□ 0.62
ATL2Q8NHH9 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ATL2Q8NHH9 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
ATL2Q8NHH9 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
ATL2Q8NHH9 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
ATL2Q8NHH9 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ATL2Q8NHH9 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ATL2Q8NHH9 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.1 ms