Protein–RNA interactions for Protein: Q8IX21

SLF2, SMC5-SMC6 complex localization factor protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,173 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLF2Q8IX21 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SLF2Q8IX21 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SLF2Q8IX21 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SLF2Q8IX21 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SLF2Q8IX21 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SLF2Q8IX21 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SLF2Q8IX21 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SLF2Q8IX21 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SLF2Q8IX21 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SLF2Q8IX21 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SLF2Q8IX21 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SLF2Q8IX21 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SLF2Q8IX21 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
SLF2Q8IX21 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SLF2Q8IX21 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SLF2Q8IX21 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SLF2Q8IX21 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SLF2Q8IX21 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SLF2Q8IX21 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SLF2Q8IX21 AF186996.4-201ENST00000467186 377 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
SLF2Q8IX21 CNOT8-225ENST00000524105 904 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SLF2Q8IX21 NCAM1-AS1-202ENST00000533638 618 ntTSL 4 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SLF2Q8IX21 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
SLF2Q8IX21 AC026336.2-201ENST00000563922 763 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SLF2Q8IX21 ATP6V0C-202ENST00000564973 1081 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SLF2Q8IX21 AL773604.1-201ENST00000617417 272 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
SLF2Q8IX21 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SLF2Q8IX21 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SLF2Q8IX21 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SLF2Q8IX21 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SLF2Q8IX21 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SLF2Q8IX21 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SLF2Q8IX21 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SLF2Q8IX21 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SLF2Q8IX21 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SLF2Q8IX21 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SLF2Q8IX21 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SLF2Q8IX21 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SLF2Q8IX21 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SLF2Q8IX21 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SLF2Q8IX21 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SLF2Q8IX21 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SLF2Q8IX21 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SLF2Q8IX21 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
SLF2Q8IX21 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SLF2Q8IX21 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SLF2Q8IX21 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SLF2Q8IX21 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SLF2Q8IX21 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SLF2Q8IX21 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SLF2Q8IX21 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SLF2Q8IX21 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
SLF2Q8IX21 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SLF2Q8IX21 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
SLF2Q8IX21 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SLF2Q8IX21 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SLF2Q8IX21 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SLF2Q8IX21 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SLF2Q8IX21 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
SLF2Q8IX21 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SLF2Q8IX21 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SLF2Q8IX21 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SLF2Q8IX21 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
SLF2Q8IX21 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SLF2Q8IX21 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SLF2Q8IX21 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SLF2Q8IX21 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SLF2Q8IX21 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SLF2Q8IX21 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SLF2Q8IX21 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SLF2Q8IX21 HIST2H3DP1-201ENST00000401004 416 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
SLF2Q8IX21 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SLF2Q8IX21 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SLF2Q8IX21 KRT18P67-201ENST00000432816 1264 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
SLF2Q8IX21 SCARNA2-201ENST00000458748 420 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
SLF2Q8IX21 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SLF2Q8IX21 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SLF2Q8IX21 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SLF2Q8IX21 AP001005.1-201ENST00000571755 1248 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
SLF2Q8IX21 ATP5G2-209ENST00000602871 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SLF2Q8IX21 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
SLF2Q8IX21 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
SLF2Q8IX21 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
SLF2Q8IX21 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
SLF2Q8IX21 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
SLF2Q8IX21 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
SLF2Q8IX21 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
SLF2Q8IX21 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
SLF2Q8IX21 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
SLF2Q8IX21 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
SLF2Q8IX21 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
SLF2Q8IX21 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SLF2Q8IX21 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SLF2Q8IX21 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
SLF2Q8IX21 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SLF2Q8IX21 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SLF2Q8IX21 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SLF2Q8IX21 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SLF2Q8IX21 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SLF2Q8IX21 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21 ms