Protein–RNA interactions for Protein: Q8IUI4

SNX29P2, Putative protein SNX29P2, humanhuman

Predictions only

Length 249 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX29P2Q8IUI4 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SNX29P2Q8IUI4 SCAP-201ENST00000265565 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SNX29P2Q8IUI4 SCARB1-202ENST00000339570 3329 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SNX29P2Q8IUI4 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SNX29P2Q8IUI4 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SNX29P2Q8IUI4 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SNX29P2Q8IUI4 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SNX29P2Q8IUI4 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SNX29P2Q8IUI4 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
SNX29P2Q8IUI4 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
SNX29P2Q8IUI4 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SNX29P2Q8IUI4 AC023824.1-201ENST00000562945 2975 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
SNX29P2Q8IUI4 ARL15-201ENST00000502271 3248 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SNX29P2Q8IUI4 CALU-205ENST00000535011 3210 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SNX29P2Q8IUI4 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
SNX29P2Q8IUI4 ELMO1-209ENST00000448602 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SNX29P2Q8IUI4 L2HGDH-202ENST00000267436 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SNX29P2Q8IUI4 SLC25A22-201ENST00000320230 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SNX29P2Q8IUI4 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SNX29P2Q8IUI4 PANK4-201ENST00000378466 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SNX29P2Q8IUI4 NGFR-201ENST00000172229 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SNX29P2Q8IUI4 HEYL-201ENST00000372852 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SNX29P2Q8IUI4 NFATC2-206ENST00000609943 5690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SNX29P2Q8IUI4 BCL11B-202ENST00000357195 7559 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SNX29P2Q8IUI4 SAP130-202ENST00000259235 4065 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SNX29P2Q8IUI4 MAP3K20-203ENST00000409176 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SNX29P2Q8IUI4 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SNX29P2Q8IUI4 BANP-201ENST00000286122 2368 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SNX29P2Q8IUI4 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SNX29P2Q8IUI4 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SNX29P2Q8IUI4 KDM6A-211ENST00000536777 5633 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SNX29P2Q8IUI4 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SNX29P2Q8IUI4 TRIM9-202ENST00000338969 3312 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SNX29P2Q8IUI4 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SNX29P2Q8IUI4 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SNX29P2Q8IUI4 WT1-209ENST00000530998 2421 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SNX29P2Q8IUI4 ABLIM2-201ENST00000341937 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SNX29P2Q8IUI4 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SNX29P2Q8IUI4 CBFB-201ENST00000290858 3136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SNX29P2Q8IUI4 EIF4ENIF1-206ENST00000397525 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SNX29P2Q8IUI4 SART1-201ENST00000312397 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SNX29P2Q8IUI4 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SNX29P2Q8IUI4 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SNX29P2Q8IUI4 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
SNX29P2Q8IUI4 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SNX29P2Q8IUI4 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SNX29P2Q8IUI4 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SNX29P2Q8IUI4 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SNX29P2Q8IUI4 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SNX29P2Q8IUI4 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SNX29P2Q8IUI4 ZNF799-201ENST00000419318 3036 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SNX29P2Q8IUI4 FAM222B-211ENST00000582266 2613 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SNX29P2Q8IUI4 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SNX29P2Q8IUI4 FRMD6-AS1-201ENST00000617151 2229 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
SNX29P2Q8IUI4 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SNX29P2Q8IUI4 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SNX29P2Q8IUI4 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SNX29P2Q8IUI4 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SNX29P2Q8IUI4 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SNX29P2Q8IUI4 GATA4-201ENST00000335135 3414 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SNX29P2Q8IUI4 AMZ2P1-202ENST00000430983 3425 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SNX29P2Q8IUI4 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SNX29P2Q8IUI4 SYTL2-215ENST00000527523 3049 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SNX29P2Q8IUI4 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SNX29P2Q8IUI4 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SNX29P2Q8IUI4 LETM2-205ENST00000519476 2240 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SNX29P2Q8IUI4 CLIC5-202ENST00000339561 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SNX29P2Q8IUI4 COQ7-201ENST00000321998 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SNX29P2Q8IUI4 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SNX29P2Q8IUI4 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SNX29P2Q8IUI4 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SNX29P2Q8IUI4 CORO2B-201ENST00000261861 3569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SNX29P2Q8IUI4 CORO2B-204ENST00000566799 3566 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SNX29P2Q8IUI4 KIF16B-203ENST00000408042 4640 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SNX29P2Q8IUI4 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SNX29P2Q8IUI4 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SNX29P2Q8IUI4 ADAMTSL4-204ENST00000369041 2908 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SNX29P2Q8IUI4 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
SNX29P2Q8IUI4 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
SNX29P2Q8IUI4 C20orf166-AS1-201ENST00000412495 2302 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SNX29P2Q8IUI4 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SNX29P2Q8IUI4 HCLS1-202ENST00000428394 1560 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SNX29P2Q8IUI4 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
SNX29P2Q8IUI4 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SNX29P2Q8IUI4 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SNX29P2Q8IUI4 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SNX29P2Q8IUI4 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
SNX29P2Q8IUI4 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SNX29P2Q8IUI4 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SNX29P2Q8IUI4 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SNX29P2Q8IUI4 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SNX29P2Q8IUI4 ZNF324-203ENST00000536459 5653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SNX29P2Q8IUI4 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SNX29P2Q8IUI4 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SNX29P2Q8IUI4 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SNX29P2Q8IUI4 ZDHHC13-202ENST00000446113 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SNX29P2Q8IUI4 PTEN-201ENST00000371953 9027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SNX29P2Q8IUI4 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.18
SNX29P2Q8IUI4 CROCCP3-201ENST00000263511 5368 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
SNX29P2Q8IUI4 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC16.14■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.1 ms