Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z3C6

ATG9A, Autophagy-related protein 9A, humanhuman

Predictions only

Length 839 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG9AQ7Z3C6 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
ATG9AQ7Z3C6 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ATG9AQ7Z3C6 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ATG9AQ7Z3C6 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
ATG9AQ7Z3C6 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ATG9AQ7Z3C6 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ATG9AQ7Z3C6 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ATG9AQ7Z3C6 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ATG9AQ7Z3C6 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ATG9AQ7Z3C6 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ATG9AQ7Z3C6 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ATG9AQ7Z3C6 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ATG9AQ7Z3C6 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
ATG9AQ7Z3C6 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ATG9AQ7Z3C6 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ATG9AQ7Z3C6 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
ATG9AQ7Z3C6 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
ATG9AQ7Z3C6 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
ATG9AQ7Z3C6 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
ATG9AQ7Z3C6 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
ATG9AQ7Z3C6 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ATG9AQ7Z3C6 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ATG9AQ7Z3C6 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ATG9AQ7Z3C6 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ATG9AQ7Z3C6 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
ATG9AQ7Z3C6 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ATG9AQ7Z3C6 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ATG9AQ7Z3C6 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ATG9AQ7Z3C6 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
ATG9AQ7Z3C6 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ATG9AQ7Z3C6 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ATG9AQ7Z3C6 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ATG9AQ7Z3C6 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ATG9AQ7Z3C6 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ATG9AQ7Z3C6 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ATG9AQ7Z3C6 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ATG9AQ7Z3C6 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ATG9AQ7Z3C6 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ATG9AQ7Z3C6 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ATG9AQ7Z3C6 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ATG9AQ7Z3C6 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ATG9AQ7Z3C6 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ATG9AQ7Z3C6 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ATG9AQ7Z3C6 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ATG9AQ7Z3C6 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ATG9AQ7Z3C6 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ATG9AQ7Z3C6 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ATG9AQ7Z3C6 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ATG9AQ7Z3C6 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ATG9AQ7Z3C6 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ATG9AQ7Z3C6 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ATG9AQ7Z3C6 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
ATG9AQ7Z3C6 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ATG9AQ7Z3C6 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
ATG9AQ7Z3C6 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ATG9AQ7Z3C6 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ATG9AQ7Z3C6 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ATG9AQ7Z3C6 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ATG9AQ7Z3C6 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
ATG9AQ7Z3C6 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ATG9AQ7Z3C6 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ATG9AQ7Z3C6 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ATG9AQ7Z3C6 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ATG9AQ7Z3C6 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ATG9AQ7Z3C6 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ATG9AQ7Z3C6 PYCR2-208ENST00000612039 1549 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ATG9AQ7Z3C6 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ATG9AQ7Z3C6 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ATG9AQ7Z3C6 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ATG9AQ7Z3C6 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ATG9AQ7Z3C6 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ATG9AQ7Z3C6 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ATG9AQ7Z3C6 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ATG9AQ7Z3C6 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ATG9AQ7Z3C6 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ATG9AQ7Z3C6 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ATG9AQ7Z3C6 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ATG9AQ7Z3C6 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ATG9AQ7Z3C6 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ATG9AQ7Z3C6 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ATG9AQ7Z3C6 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ATG9AQ7Z3C6 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ATG9AQ7Z3C6 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ATG9AQ7Z3C6 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
ATG9AQ7Z3C6 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ATG9AQ7Z3C6 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ATG9AQ7Z3C6 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ATG9AQ7Z3C6 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ATG9AQ7Z3C6 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ATG9AQ7Z3C6 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ATG9AQ7Z3C6 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ATG9AQ7Z3C6 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ATG9AQ7Z3C6 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ATG9AQ7Z3C6 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ATG9AQ7Z3C6 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ATG9AQ7Z3C6 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ATG9AQ7Z3C6 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
ATG9AQ7Z3C6 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ATG9AQ7Z3C6 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ATG9AQ7Z3C6 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.3 ms