Protein–RNA interactions for Protein: Q76B58

BRINP3, BMP/retinoic acid-inducible neural-specific protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 766 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRINP3Q76B58 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
BRINP3Q76B58 SIGLEC8-202ENST00000340550 1293 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
BRINP3Q76B58 PSMA7-201ENST00000370858 925 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
BRINP3Q76B58 PRUNE2-202ENST00000376713 1069 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
BRINP3Q76B58 ARRB2-203ENST00000381488 1236 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
BRINP3Q76B58 AMACR-204ENST00000382085 1195 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
BRINP3Q76B58 TSTD1-204ENST00000423014 593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
BRINP3Q76B58 ACTG1P14-201ENST00000446382 1122 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
BRINP3Q76B58 FTCD-AS1-201ENST00000446649 500 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
BRINP3Q76B58 AC055854.1-201ENST00000523627 570 ntTSL 4 BASIC24.55■■□□□ 1.52
BRINP3Q76B58 AC190387.1-201ENST00000551683 408 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
BRINP3Q76B58 KRT19P2-202ENST00000557173 1012 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
BRINP3Q76B58 CITED2-204ENST00000618718 901 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
BRINP3Q76B58 AQP12B-206ENST00000621682 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
BRINP3Q76B58 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
BRINP3Q76B58 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
BRINP3Q76B58 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC24.55■■□□□ 1.52
BRINP3Q76B58 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
BRINP3Q76B58 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
BRINP3Q76B58 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
BRINP3Q76B58 TUBA4B-203ENST00000490341 1380 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
BRINP3Q76B58 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
BRINP3Q76B58 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
BRINP3Q76B58 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
BRINP3Q76B58 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
BRINP3Q76B58 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
BRINP3Q76B58 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
BRINP3Q76B58 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
BRINP3Q76B58 AC005034.1-201ENST00000426657 489 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
BRINP3Q76B58 AP000695.1-201ENST00000429588 893 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
BRINP3Q76B58 AC109322.1-201ENST00000524499 1264 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
BRINP3Q76B58 CYB561-217ENST00000582997 877 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
BRINP3Q76B58 AC004835.2-201ENST00000603762 682 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
BRINP3Q76B58 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
BRINP3Q76B58 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
BRINP3Q76B58 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
BRINP3Q76B58 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
BRINP3Q76B58 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
BRINP3Q76B58 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
BRINP3Q76B58 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
BRINP3Q76B58 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
BRINP3Q76B58 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
BRINP3Q76B58 RPL13P5-202ENST00000412023 1438 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
BRINP3Q76B58 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
BRINP3Q76B58 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
BRINP3Q76B58 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
BRINP3Q76B58 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
BRINP3Q76B58 PSMG3-201ENST00000252329 1007 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
BRINP3Q76B58 ATP23-201ENST00000300145 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
BRINP3Q76B58 C22orf39-201ENST00000333059 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
BRINP3Q76B58 MRPL23-201ENST00000381514 919 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
BRINP3Q76B58 THAP7-202ENST00000399133 1144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
BRINP3Q76B58 CBR1-202ENST00000399191 838 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
BRINP3Q76B58 AC004461.1-201ENST00000412461 403 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
BRINP3Q76B58 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
BRINP3Q76B58 SNHG8-201ENST00000602414 672 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
BRINP3Q76B58 SNHG8-205ENST00000602819 470 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
BRINP3Q76B58 AL390955.2-201ENST00000603032 514 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
BRINP3Q76B58 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
BRINP3Q76B58 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
BRINP3Q76B58 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
BRINP3Q76B58 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
BRINP3Q76B58 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
BRINP3Q76B58 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
BRINP3Q76B58 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
BRINP3Q76B58 PC-214ENST00000628663 1470 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
BRINP3Q76B58 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
BRINP3Q76B58 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
BRINP3Q76B58 CENPM-203ENST00000402338 1002 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
BRINP3Q76B58 AC015922.1-201ENST00000421102 1152 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
BRINP3Q76B58 LINC01264-201ENST00000431395 500 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
BRINP3Q76B58 CCDC74BP1-201ENST00000508880 1123 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
BRINP3Q76B58 POLD4-207ENST00000531239 584 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
BRINP3Q76B58 NDUFS7-216ENST00000546283 1060 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
BRINP3Q76B58 AQP6-205ENST00000618286 829 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
BRINP3Q76B58 Z92544.3-201ENST00000624747 417 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
BRINP3Q76B58 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
BRINP3Q76B58 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
BRINP3Q76B58 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
BRINP3Q76B58 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
BRINP3Q76B58 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
BRINP3Q76B58 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
BRINP3Q76B58 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
BRINP3Q76B58 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
BRINP3Q76B58 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
BRINP3Q76B58 EGR3-204ENST00000522910 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
BRINP3Q76B58 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
BRINP3Q76B58 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
BRINP3Q76B58 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
BRINP3Q76B58 HIST1H3D-201ENST00000356476 411 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
BRINP3Q76B58 HDAC11-202ENST00000402259 1000 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
BRINP3Q76B58 PIK3CD-AS2-201ENST00000415330 939 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
BRINP3Q76B58 AL049612.1-201ENST00000427017 694 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
BRINP3Q76B58 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
BRINP3Q76B58 DUT-210ENST00000559935 569 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
BRINP3Q76B58 AC096734.2-201ENST00000562054 433 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
BRINP3Q76B58 TMEM88-202ENST00000574668 510 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
BRINP3Q76B58 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
BRINP3Q76B58 FSTL3-207ENST00000605925 748 ntTSL 4 BASIC24.51■■□□□ 1.51
BRINP3Q76B58 AC073592.5-201ENST00000624854 528 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.9 ms